シングルセル自動調製システム
- 5,184個のナノウェルを搭載したICELL8 Chipに細胞を分注し、1,200～1,500個程度のシングルセルを取得
- 5～100 μmの幅広い細胞サイズに対応、様々なサイズの細胞集団を解析可能
- イメージングによりシングルセルを自動判別し、ダブレットや空ウェル、死細胞を解析から排除
- 最大8種類の細胞サンプルを1枚のICELL8 Chip上で一度に解析可能
- 様々なシングルセルRNA-Seqアプリケーションに対応
製品説明
ICELL8 cxシステムは、わずか4センチ四方のICELL8 Chipに搭載された5,184個のナノウェルに、数10ナノリットルレベルの精密な分注を行い、1枚のChip上で1,200～1,500個程度のシングルセルを取得します。細胞分注は8本の独立した分注ノズルで行うため、最大8種類までのサンプルを1枚のChip上に分注し、一度に解析することが可能です。
特長
イメージングにより「生きたシングルセル」を自動判別し、解析に使用
ICELL8 Chipへ細胞を分注後、システム本体に内蔵された顕微鏡により全5,184ウェルの画像を取得します。核を染色するHoechst（青色蛍光）と死細胞を染色するPI（Propidium Iodide、赤色蛍光）を用いて、細胞を予め染色しておくことで、専用のCellSelectソフトウェアにより画像を解析し、生きたシングルセルを含むウェルのみを自動判別します。
選択したウェルのみにRT試薬を分注し、後の反応に進むことができるため、シングルセル解析で問題となるダブレットや空ウェル、死細胞を、シーケンスを行う前に解析から排除することができます。
心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能
ICELL8システムは、5～100 μmのさまざまな大きさの細胞に対応しており、心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能にします。
＜実施例＞ ICELL8 Chip上のナノウェル内でシングルセル化されたマウス成体由来の心筋細胞（約100 μm）。
細胞はHoechstおよびCellTracker Redで染色。 ※データご提供 ： マックス・プランク研究所 Stefan Günther博士
関連技術情報
心筋細胞のICELL8使用論文はこちら
ICELL8 Chipへ細胞を分注後、システム本体に内蔵された顕微鏡により全5,184ウェルの画像を取得します。核を染色するHoechst（青色蛍光）と死細胞を染色するPI（Propidium Iodide、赤色蛍光）を用いて、細胞を予め染色しておくことで、専用のCellSelectソフトウェアにより画像を解析し、生きたシングルセルを含むウェルのみを自動判別します。
選択したウェルのみにRT試薬を分注し、後の反応に進むことができるため、シングルセル解析で問題となるダブレットや空ウェル、死細胞を、シーケンスを行う前に解析から排除することができます。
心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能
ICELL8システムは、5～100 μmのさまざまな大きさの細胞に対応しており、心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能にします。
＜実施例＞ ICELL8 Chip上のナノウェル内でシングルセル化されたマウス成体由来の心筋細胞（約100 μm）。
細胞はHoechstおよびCellTracker Redで染色。 ※データご提供 ： マックス・プランク研究所 Stefan Günther博士
関連技術情報
- テクニカルノート：ICELL8 システムを用いた画像確認に基づく心筋細胞のシングルセル解析
- ユーザー様ご提供プロトコール：ICELL8 システム解析用の成体マウス心筋細胞の調製
- ウェビナー：ICELL8システムを用いた心筋細胞研究の自動化（Takara-bio USA社サイトへ）
心筋細胞のICELL8使用論文はこちら
システム紹介動画
ICELL8システムを用いた解析フロー例（3' DE解析の場合）
＊ICELL8 Chip Cyclerはシステムに含まれています。
様々なシングルセルRNA-seqアプリケーションに対応
以下のRNA-seqアプリケーションを可能にする専用試薬がご利用いただけます。SMART技術により超微量のRNAを高感度かつ再現性高く増幅し、より多くの遺伝子の検出が可能です。
SMART-Seq® Pro Application Kit - 2 Chip
ICELL8 cxシステムで単離した単一細胞由来のmRNA転写産物の全長配列情報を得ることで、全長トランスクリプトーム解析を行う。
ICELL8 cxシステムで単離した単一細胞由来のmRNA転写産物の全長配列情報を得ることで、全長トランスクリプトーム解析を行う。
Single cell ATAC-seq
旧ICELL8システムで単離した単一細胞のATAC-seq（オープンクロマチン領域解析：Assay for Transposase-Accessible Chromatin Sequencing）のプロトコルを公開しています。
旧ICELL8システムで単離した単一細胞のATAC-seq（オープンクロマチン領域解析：Assay for Transposase-Accessible Chromatin Sequencing）のプロトコルを公開しています。
ユーザーによるレビュー
ご使用者様インタビュー：マウスでの脊髄損傷部の単一核トランスクリプトーム解析
依藤 依代先生大阪大学大学院医学系研究科 分子神経科学
大阪大学 依藤先生にICELL8を使用して取得されたデータをご紹介いただくとともに、ICELL8の使用感や、実験のデザイン段階や情報解析において試行錯誤された点など、大変興味深いお話をお聞かせいただきました。現在シングルセル解析実験を実施されている方はもちろんのこと、これから実施を検討されている方も是非ご覧ください。
＞＞詳しく見る
ウェビナー： ICELL8システムを用いた心筋細胞研究の自動化
Dr. Stefan Günther、Michail Yekelchyk氏マックス・プランク研究所、ドイツ
心筋細胞はそのサイズの大きさと脆弱性から、既存のマイクロフルイディクス法やナノドロップレット法では制限を受けます。本ウェビナーではマックス・プランク研究所のDr. Stefan GüntherとMichail Yekelchyk氏が、単核および多核の心筋細胞のシングルセル化処理にICELL8システムを用いて、どのようにこの困難を克服したかについて語っています。
＞＞ウェビナーを見る（Takara-bio USA社サイト）
ユーザーによるレビュー動画： マウス脳組織サンプルのシングルセル解析
Dr. Sten Linnarssonカロリンスカ研究所、スウェーデン
2016年のAGBT(Advances in Genome Biology and Technology)で行われた、スウェーデン カロリンスカ研究所 (Karolinska Institutet)のDr Sten Linnarssonの発表をご覧ください。マウス脳を分子生物学的に解剖することを目的とした一連の研究において、組織サンプルのシングルセル解析は大きな役割を担っています。「ICELL8システムでの細胞の単離は約2日間で終了する。これは以前は数ヵ月かかっていた。」とDr. Sten Linnarssonは語っています。
＞＞詳しく見る
使用実績のある細胞リスト
| Cell line/type | Species | Source |
|---|---|---|
| 307 | Mouse | Pancreas |
| 3T3 | Mouse | Fibroblast |
| A-20 | Mouse | B-lymphocyte |
| A-375 | Human | Melanoma |
| BaF/3 | Mouse | Pre-B cells |
| Beta-TC-6 | Mouse | Pancreas |
| Primary cells | Mouse | Bone marrow |
| Primary cells | Mouse | Cardiomyocyte (adult) |
| CHO | Hamster | Ovary |
| ESC; Differentiated ESC |
Mouse | Embryonic stem cells |
| Ear | Mouse | Inner ear organs |
| Primary cells | Mouse | Embryos |
| FACS-sorted lymphocytes | Human | Bone marrow |
| Fetal cortex | Human | Primary cells |
| Fetal neurons | Human | Fetal brain |
| Gut cells | Mosquito | Gut |
| H2452 | Human | Lung |
| HCT 116 | Human | Colon |
| HSPC | Mouse | Hematopoietic stem cells |
| Cell line/type | Species | Source |
|---|---|---|
| KU812 | Human | Blood, CML myeloblast |
| Lung epithelia | Mouse | Primary FACS-sorted cells |
| MCF7 | Human | Breast |
| MDA-MB-231 | Human | Mammary gland |
| MIA PaCa-2 | Human | Pancreas |
| Nasal epithelia | Human | Primary nasal scraping |
| NCH421K | Human | Glioma/glioblastoma |
| Neurons | Mouse | Fresh dissection |
| Nuclei | Human | Frozen lung tumor; frozen breast cancer |
| PBMCs | Human | Blood |
| Planaria SC | Planarium | Stem cells |
| Retina | Mouse | Primary cells |
| Scheider S2 | Drosophila | Embryo |
| SK-BR3 | Human | Breast |
| Skin | Zebrafish | Skin |
| Spheroids | Human | MCF10CA-derived |
| U-87-MG | Human | Glioblastoma; astrocytoma |
| UTHSC | Human | Bone marrow EW-8 Ewing Sarcoma |
| Z-138 | Human | B-cell lymphoma |
ICELL8システムを用いて、幅広い細胞サイズのサンプルをバイアスなく分離可能
ICELL8システムで単離した細胞種の一例です。青色で示したサンプルは、ICELL8システムが初めて単離に成功したシングルセル、核、スフェロイドです。
システム構成・内容
ICELL8 cx Single-Cell System（製品コード 640190）
Nanodispenser Chip Holder（製品コード 640008）
ICELL8 Chipを挟むマグネットプレート。システムには標準で2セット付属していますが、分注後のICELL8 Chipを複数枚保管したい場合、追加でご購入いただくことが可能です。
- ICELL8 cxシステム本体
- CellSelect Software
- ICELL8 Chip Cycler
- 制御解析用PC
| ICELL8 cxシステム本体 | |
|---|---|
| サイズ(幅×奥行き×高さ) | 108 cm×58 cm×58 cm |
| 重さ | 90.7 kg |
| 電源 | AC100～240V, 50/60Hz |
Nanodispenser Chip Holder（製品コード 640008）
ICELL8 Chipを挟むマグネットプレート。システムには標準で2セット付属していますが、分注後のICELL8 Chipを複数枚保管したい場合、追加でご購入いただくことが可能です。
Application
ご使用者様インタビュー：マウスでの脊髄損傷部の単一核トランスクリプトーム解析
ユーザーによるレビュー動画：マウス脳組織サンプルのシングルセル解析
Technical Notes
ICELL8システムを用いた画像確認に基づく心筋細胞のシングルセル解析
ユーザー提供プロトコール：ICELL8システム解析用の成体マウス心筋細胞の調製
全⻑scRNA-Seq 解析による遺伝子融合、SNP および選択的スプライシングの検出能向上
ICELL8システムによる抗体染色を用いた細胞選択
ICELL8® Single Cell Systemを用いたiPS細胞から心筋分化する過程におけるシングルセル解析
ICELL8® Single Cell Systemを用いた骨髄性白血病由来細胞のシングルセル解析
- 注意事項
- 本製品は理化学機器またはソフトウェアとなります。
- お客様自身が装置の修理または分解や改造（付属品以外のソフトウェアの使用やコンピューターウィルスの感染等を含む）を行った場合、ならびに、本製品の取扱説明書に記載の内容を無視して装置を使用した場合には、タカラバイオは保証に基づくすべての義務とそれによって生じたいかなる損害についても責任を負いません。
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