| Strain | Genotype |
|---|---|
| BB4 | supF58, supE44, hsdR514, galK2, galT22, trpR55, metB1, tonA, ΔlacU169/F'[proAB+, lac Iq, lacZΔM15Tn10(tetr)] |
| BL21(DE3)*1 | F－, ompT, hsdSB(rB－ mB－), gal(λcI 857, ind1, Sam7, nin5, lacUV5-T7gene1), dcm(DE3) (B株由来) |
| BM25.5 | F－, λimm434kanr,(P1), cmr, rK- mK+, tetr |
| BMH71-18mutS | Δ(lac-proAB), supE, thi, mutS215::Tn10 (tetr)/F'(traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15) |
| BW313 | HfrKL16PO/45[lys(61-62)/dut1, ung1, thi-1, relA1] |
| C-la | A wild type strain(C strain) |
| C600 | supE44, hsdR, thi-1, thr-1, leuB6, lacY1, tonA21 |
| CJ236 | dut1, ung1, thi-1, relA1/pCJ105(F'camr) |
| DH1 | supE44, hsdR17, recA1, endA1, gyrA96, thi-1, relA1 |
| DH5 | supE44, hsdR17, recA1, endA1, gyrA96, thi-1, relA1 |
| DH5α | F－, |
| DH10B | F－, mcrA, Δ（mrr-hsdRMS-mcrBC）, |
| DP50supF | supE44, supF58, hsdS3(rB- mB-), dapD8, lacY1, glnV44, Δ(gal-uvrB)47, tyrT58, gyrA29, tonA53, Δ(thyA57) |
| ED8654 | supE, supF, hsdR, metB, lacY, gal, trpR |
| ED8767 | supE44, supF58, hsdS3(rB－ mB－), recA56, galK2, galT22, metB1 |
| ER1647 | F－, trp-31, his-1, rpsL104(strr), fhuA2, Δ(lacX)r1, supE44, xyl-7, mtl-2, metB1, recD1014, mcrA1272::Tn10, Δ(mcrB, hsdRMS, mrr)102::Tn10(tetr) |
| HB101 | F-, hsdS20(rB-, mB-), recA13, ara-14, proA2, lacY1, galK2, rpsL20 (str), xyl-5, mtl-1, supE44, leuB6, thi-1 |
| HMS174*1 | F－, recA1, hsdR, RifR |
| HST02 | F' [traD36, proA+B+, lacIq, lacZΔM15]/Δ(lac-proAB), recA, endA, gyrA96, thi, e14-(mcrA-), supE44, relA, ΔdeoR, Δ(mrr-hsdRMS-mcrBC) |
| HST04 dam－/dcm－ | F－, ara, Δ(lac-proAB)[ |
| HST08 Premium | F－, endA1, supE44, thi-1, recA1, relA1, gyrA96, phoA, |
| JM83 | F－, ara, Δ(lac-proAB), rpsL( |
| JM101 | supE, thi, Δ(lac-proAB)/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15] |
| JM105 | endA1, supE, sbcB15, thi, rpsL, Δ(lac-proAB)/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15] |
| JM106 | F－, endA1, gyrA96, thi, hsdR17, supE44, relA1, Δ(lac-proAB) |
| JM107 | endA1, gyrA96, thi, hsdR17, supE44, relA1, Δ(lac-proAB)/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15] |
| JM108 | F－, recA1, endA1, gyrA96, thi, hsdR17, supE44, relA1, Δ(lac-proAB) |
| JM109 | recA1, endA1, gyrA96, thi, hsdR17(rK- mK+), e14- (mcrA－), supE44, relA1, Δ (lac-proAB)/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15] |
| JM110 | dam, dcm, supE44, hsdR17, thi, leu, rpsL1, lacY, galK, galT, ara, tonA, thr, tsx, Δ(lac-proAB)/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15] |
| K802 | F－, lacY1 or Δ(lac Iq-Y )6(lac-3), supE44, galK2, galT22, mcrA, rfbD, metB1, mcrB1, hsdR2 |
| K803 | F－, lacY1 or Δ(lac Iq-Y )6(lac-3), supE44, galK2, galT22, mcrA, rfbD, metB1, mcrB1, hsdR3 |
| LE392 | supE44, supF58, hsdR514, galK2,galT22, metB1, trpR55, lacY1 |
| MC1061 | hsdR, mcrB, araD139, Δ(araABC-leu)7679, ΔlacX74, galU, galK, rpsL, thi |
| MV1184 | ara, Δ(lac-proAB), rpsL, thi, ( |
| MV1193 | Δ(lac-proAB), rpsL, thi, endA1, sbcB15, hsdR4, Δ(srl-recA)306::Tn10(tetr)/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15] |
| NovaBlue*1 | endA1, hsdR17, (rK- mK+), supE44, thi-1, gyrA96, relA1, lac, recA1/F', [proAB+, lac Iq Z ΔM15, Tn10(tetr)] |
| RR1 | supE44, hsdS20, ara-14, proA2, lacY1, galK2, rpsL20, xyl-5, mtl-1 |
| TAP90 | supE44, supF58, hsdR, pro, leuB, thi-1, rpsL, lacY1, tonA1, recD1903::mini-tet |
| TG1 | supE, hsdΔ5, thi, Δ(lac-proAB)/F'〔traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15〕 |
| TG2 | supE, hsdΔ5, thi, Δ(lac-proAB)Δ(srl-recA)306::Tn10(tetr)/F'〔traD36, proAB+, lac Iq, lacZΔM15〕 |
| TH2 | supE44, hsdS20(rB- mB－), recA13, ara-14, proA2, lacY1, galK2, rpsL20, xyl-5, mtl-1, thi-1, trpR624 |
| XL1-Blue | hsdR17, supE44, recA1, endA1, gyrA46, thi, relA1, lac/F' 〔proAB+, lac Iq, lacZΔM15:: Tn10(tetr)〕 |
| χ1776 | F－, thuA53, dapD8, minA1, minB2, rfb-2, glnV44(supE44), Δ(gal-uvrB)47, tyrA142, gyrA29, oms-2, metC65, osm-1(tte-1), Δ(bioH-asd)29, cycA1, cycB2, hsdR2 |
| Y-1088 | F－, ΔlacU169, supE, supF, hsdR, metB, trpR, fhuA21, proC::Tn5/pMC9*2 |
| Y-1089 | F－, ΔlacU169, lon-100, araD139, rpsL, hflA150[chr::Tn10/pMC9*2] |
| Y-1090 | F－, ΔlacU169, lon-100, araD139, rpsL, supF, mcrA, trpC22::Tn10/pMC9*2 |
太字は、TaKaRaでコンピテントセル、エレクトロセルとして販売している菌株
*1 メルク社（Novagen）でコンピテントセルとして販売している菌株
*2 pMC9 is pBR322 with lac Iq inserted.
遺伝子操作によく使用される大腸菌遺伝子記号
1)制限修飾系およびメチレーション系遺伝子
2) 相同組換え系遺伝子
3)ラクトース系遺伝子
4)その他よく利用される遺伝子
| dam | GATC配列中AdenineのN-6位メチル化能欠損 制限酵素認識配列中および近傍にGATC配列が存在し、メチル化により影響を受ける酵素の場合にはdam-株を使用する(メチル化の影響の項参照)。 |
| dcm | CCWGG配列中2番目Cytosineの5位メチル化能欠損 制限酵素認識配列中および近傍にCCWGG配列が存在し、メチル化により影響を受ける酵素の場合にはdcm-株を使用する(メチル化の影響の項参照)。 |
| hsd (R-M-S) | EcoK制限修飾系遺伝子；hsdR：制限系欠損、hsdS：制限修飾系欠損 |
| mcrA | 5'-meCpG配列の制限欠損 |
| mcrB、C | 5'-GpmeC配列の制限欠損 |
| mrr | メチル化Adenineによる制限系欠損；damおよびEcoKによるメチル化塩基には関与しない。 Δ(mcrC-mrr)はmcrC-merB-hsdS-hsdM-hsdR-mrrの6遺伝子を欠損している。 hsd(R-M-S)、mcrA、BC、mrr株は、メチル化DNA(genomic、cDNA)のクローニングに使用される。 |
| recA | 相同組換え能欠損 |
| recBC | Exonuclease V活性および相同組換え能欠損 |
| recD | Exonuclease V活性欠損。ただし相同組換え能には影響しない。 |
| recF、J | 相同組換え能減少 |
| sbcB、C | Exonuclease I 活性欠損 recA以外のrec、sbc系遺伝子は、ゲノムクローニング等、invert repeat、tandem repeatを多く含むDNAのクローニング用宿主として利用される。 |
| lac Iq | lac repressorの過剰生産 (プロモーター変異) |
| lacZ | β-ガラクトシダーゼ欠損 lacZΔM15は、β-ガラクトシダーゼのC末端フラグメント(ω-fragment)をコードしているが、 そのままでは活性がなく、種々ベクターにコードされるlacα-fragmentの共存下でβ-ガラクトシダーゼ活性が回復し、X-Galでのカラーセレクションが可能となる。 |
| lac Y | Lactose permease欠損 ΔU169、ΔX111、ΔX74は、lac operonが完全に欠失している。 |
| dut | dUTPase活性欠損 |
| ung | Uracil N-glycosilase活性欠損；dut、ung株は、Kunkel法による部位特異的変異処理に 用いられる。 |
| endA | Endonuclease I活性欠損 |
| lon | ATP dependent protease活性欠損；異常タンパク質の分解に関与するため、 異種タンパク質を発現する際の宿主にlon株が用いられる。 |
| ompT | membrane-associated protease活性欠損；発現異種タンパク質の精製時分解に関与 |
| hflA | λファージ溶原化頻度の上昇；λgt10を用いたクローニングの宿主に用いられる。 |
| supE | Amber(UAG)suppressor tRNA(glutamine)；suppressor要求性 λファージ増殖用宿主等に用いられる。 |
| supF | Amber(UAG)suppressor tRNA(tyrosine)；suppressor要求性λファージ増殖用 (Sam7、Sam100のlytic growth)宿主等に用いられる。 |
| Tn5 | Transposon5：カナマイシン耐性 |
| Tn10 | Transposon10：テトラサイクリン耐性 |
| F | 接合伝達因子；M13ファージ感染に必須。 F'〔traD36、proAB+、lac Iq、lacZΔM15〕は、大腸菌ゲノムの一部(proAB+、lac Iq、lacZΔM15)をもち、接合伝達能の著しく低下(traD36)した性質を有するFプラスミドであることを示す。 |
| (P1) | P1ファージ溶原化株：P1制限修飾系、P1 dam+は通常発現している。 |
| (P2) | P2ファージ溶原化株：λ red+dam+の増殖制限(Spi-selection) |
| rpsL | リボソームタンパク質の変異に由来したストレプトマイシン耐性 |
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