TaKaRa制限酵素認識配列検索ツール「Takara Cut-Site Navigator」

[1] DNA配列の読み込み

Boxに、DNA配列をCopy＆Pasteしていただくか、配列ファイルを指定していただくことで、配列を読み込むことができます。
Fasta形式、テキスト形式のファイルおよびGenbank形式が使用可能です。

[2] 条件設定

使用可能な制限酵素を絞り込むために、いろいろな条件を付加することができます。

Enzyme	：	特定の制限酵素を選択可能です。
Cutting Type	：	切断サイトのタイプを選択することができます。（blunt end、3’or 5’sticky end）
Methylation	：	メチル化の有無による切断可否を検索条件に適用します。
Recognition Sequence Length	：	認識配列の長さを検索条件に適用します。
Frequency	：	切断頻度を設定します。

[3] 検索開始

Submit ボタンをクリックすると検索結果が表示されます。
表示方法は以下から選択可能です。

※検索結果は実際の結果とは異なる場合があります。
　結果の取り扱いには十分にご注意ください。

本ツールはNやRなどの複数の塩基を示す核酸コードを入力・出力します。
酵素が配列を認識・切断する際には、認識する配列の両端に数塩基が必要になります。
ご参考：『PCR産物末端の制限酵素切断』
本ツールはこの点を考慮しておりません。

[4] マウスオーバーコメント

ポイントを重ねることにより、各パラメーターの機能を簡単にご説明します。
詳しい機能はtutorialでご確認ください。

※	パラメーターをクリックするとtutorialにジャンプします。

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