16S rRNA解析(細菌叢解析)・ショットガンメタゲノム解析のグループ情報記載例と使用例

グループ情報(群情報)記載例

グループ情報記載欄には、実験Setごとにグループ情報(群情報)をご記載ください。

系統分類結果の並び替え、多様性解析が結果に反映されます。
また菌叢統計比較解析をご依頼いただいた場合は、指定のグループ間での統計検定による群間比較を実施いたします。
以下記載例ではSet A(Control対Treat)、Set B(male対female)、 Set C(age10s対age50s対age70s)の3 Setがそれぞれグループ比較として多様性解析・菌叢統計比較解析に用いられます。

<記載例>
検体No サンプル名称 Set
A
Set
B
Set
C
Set
D
1 A Control male age10s
2 B Control female age10s
3 C Treat male age50s
4 D Treat female age70s

※オンライン注文ではSet名称は変更できません。

※グループを指定しない場合は"-"のままにしてください。
またSet内で比較に使用しないサンプルについても"-"のままにしてください。

グループ情報使用例

指定されたグループ情報は以下のように反映されます。

  • 系統分類結果 Bar Chart
    KingdomからSpeciesレベルまで全サンプル分の菌株の存在量をhtml形式のファイルでご確認いただけます。サンプル、グループ名で並び替えが可能です。(並び順は数値、アルファベットの昇順となります。)
    系統分類結果
  • 系統分類結果 Heatmap (ショットガンメタゲノム解析)*1
    KingdomからSpeciesレベルまで全サンプル分の菌株の存在量パターンをhtml形式のファイルでご確認いただけます。heatmap上部でグループ情報のカラーバーを表記します。
    Heatmap画像
    *1 16S rRNA解析(細菌叢解析)結果ではグループ情報は反映されません。結果ファイル形式も異なります。
  • α多様性解析(Rarefaction 解析結果)*2
    検体中の菌種の多様性をご確認いただけます。検体ごと、グループごとの結果を表示可能です。
    α多様性解析の表示結果
    *2 ショットガンメタゲノム解析結果には含まれません。
  • β多様性解析(主座標分析結果)
    PCoA(主座標分析)の実施結果です。解析検体数が3検体未満の場合作成されません。
    β多様性解析の表示結果
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