製品説明
Lacto-N-biosidaseは、I型糖鎖構造に特異的に作用して糖鎖の非還元末端からlacto-N-biose(Galβ1-3GlcNAc)を遊離するが、II型糖鎖には全く作用しない1, 2)。糖タンパク質や糖脂質糖鎖のI型、II型構造の判別に利用できる。また、α-1,3/4-L-Fucosidase(製品コード 4453)と組み合わせて用いることにより、Lewisa構造とLewisx構造を識別することができる。糖タンパク質や糖脂質糖鎖の構造と機能の解明に有用である。本酵素100 μU(1 vial分)で、糖鎖 ~10 pmolに対して、およそ50~100回分の酵素消化が行える。
保存
-20℃
系統名
oligosaccharide lacto-N-biosylhydrolase
酵素番号
3.2.1.140
由来
Streptomyces sp.142
反応
非還元末端にI型糖鎖構造(Galβ1-3GlcNAc-)を持つ糖鎖に作用してlacto-N-biose(Galβ1-3GlcNAc)を遊離する1)。
形状
溶液[0.05% Brij 58を含む50 mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)]
濃度
1μU/μl
活性の定義
37℃、pH5.5においてPA-lacto-N-tetraoseから1分間に1μmolのPA-lactoseを生成する酵素量を1 Uとする。
活性測定法
2μMのPA-lacto-N-tetraose(PA-Sugar Chain 042;製品コード 4142)を含む40 mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)中、37℃で20分間酵素反応を行わせた後、1%のトリフルオロ酢酸を加えて反応を止める。反応液をHPLCで分析して、生成物[PA-lactose、(PA-Sugar Chain 026;製品コード 4126)]の量から酵素活性を算出する。
一般的性質
分子量: |
約60,000(SDS-PAGE) |
至適pH: |
pH5.5(クエン酸ナトリウム緩衝液、酢酸ナトリウム緩衝液) 基質:PA-lacto-N-tetraose |
pH安定領域: |
pH4.0~10.0(4℃、16h) |
安定化剤: |
非イオン性界面活性剤(Brij 58、NP 40)、Bovine serum albumin |
阻害剤: |
Hg2+、Cu2+、Fe3+、lacto-N-biose |
ミカエリス定数: |
Km=6.80μM 基質:PA-lacto-N-tetraose(PA-Sugar Chain 042;製品コード 4142) Km=38.9μM 基質:PA-Sugar Chain 003(製品コード 4103) |
基質特異性
基質(終濃度2μM) |
生成物 |
比活性(mU/mg) |
PA-Sugar Chain 042 |
PA-Sugar Chain 026 |
2683 |
PA-Sugar Chain 041 |
|
0 |
PA-Sugar Chain 003 |
PA-Sugar Chain 001 |
280 |
PA-Sugar Chain 002 |
|
0 |
PA-Sugar Chain 043 |
|
0 |
PA-Sugar Chain 044 |
|
0 |
PA-Sugar Chain 045 |
|
0 |
純度
1.残存エキソグリコシダーゼ活性およびエンドグリコシダーゼ活性
合成基質:
p-NP-glycoside 1.1 mMを含む40 mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH4.5)225 μlに本酵素標品25μlを加えて37℃で16時間反応を行わせた後、1 M炭酸ナトリウム250μlを加えて反応を停止し、405 nmにおける反応液の吸光度を測定する。
活性の検出限界は1 μU/ml。
糖鎖基質:適当なPA-Sugar Chain 2μMを含む40 mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)8 μlに本酵素標品2 μlを加えて37℃で16時間反応を行わせた後、1%のトリフルオロ酢酸を加えて反応を止める。反応液をHPLCで分析して、生成物の有無を調べる。
活性の検出限界は0.1 μU/ml。
残存グリコシダーゼ活性 |
合成基質 |
糖鎖基質 |
α-Fucosidase |
<0.005% |
<0.01% |
α-Galactosidase |
<0.02% |
ND |
β-Galactosidase |
ND |
ND |
α-Glucosidase |
NT |
ND |
β-Glucosidase |
<0.005% |
<0.015% |
β-N-Acetylhexosaminidase |
<0.5% |
ND |
α-N-Acetylgalactosaminidase |
NT |
ND |
α-Mannosidase |
ND |
ND |
β-Mannosidase |
<0.005 |
NT |
Sialidase |
NT |
ND |
Endo-β-N-acetylglucosaminidase |
NT |
ND |
ND;Not detected, NT;Not tested
2.残存プロテアーゼ活性
酸化インスリンB鎖0.4 mMを含む200 mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)10 μlに本酵素標品10 μlを加えて37℃で16時間反応させた後、反応液を逆相系HPLCで分析した結果、基質(酸化インスリンB鎖)以外のピークを認めなかった。