製品説明
Low Input Library Prep Kitはイルミナ社の次世代シーケンサーにすぐに使用できるライブラリーを作製するキットであり、微量なdsDNAから高感度かつ短時間(2時間)にライブラリーを構築することができる。精製ステップが無く、バーコード付加したライブラリー作製を1チューブで行うことができ、3ステップのプロトコールはわずか2時間で完了する。本キットは50 pg~20 ngのdsDNAから効率的なライゲーションによりライブラリーを構築できるため、SMART-Seq v4またはSMARTer Universal Low Kitから得たdsDNAからIlluminaシーケンス用ライブラリーを作製するのに最適である。
特長
- イルミナ社次世代シーケンサー用のsingleplexまたはmultiplex用ライブラリーの作製
- シングルリードおよびペアエンドシーケンスに対応
- 1反応あたり20 ng以上のDNAの使用や、一本鎖DNAおよびRNAを用いたライブラリー作製には適さない。
図1.プロトコールフロー
Low Input Library Prep Kitの操作は約2時間で完了する。
Rsa I-消化済みSMARTer cDNA(SMARTer Universal Low RNA Kit for Illumina Sequencing)またはCovarisなどにより剪断済みのSMARTer cDNA(SMART-Seq v4)を用いてライブラリー構築を行う。
内容
Low Input Library Prep Kit(製品コード 634947)
Template Preparation Buffer
Template Preparation Enzyme
Library Synthesis Buffer
Library Synthesis Enzyme
Library Amplification Buffer
Library Amplification Enzyme
Nuclease-Free Water
Indexing Reagent 1
Indexing Reagent 2
Indexing Reagent 3
Indexing Reagent 4
Indexing Reagent 5
Indexing Reagent 6
Indexing Reagent 7
Indexing Reagent 8
Indexing Reagent 9
Indexing Reagent 10
Indexing Reagent 11
Indexing Reagent 12
保存
-20℃
本製品以外に必要な試薬、機器(主なもの)
下記の製品は本プロトコールにて使用できることが確認されています。他製品で代替はできませんので、ご注意ください。
- シングルチャンネルピペット 10 μl、20 μlおよび200 μl 各1本
- 8連チャンネルピペット 20 μl、200 μl 各1本
- フィルターピペットチップ 10 μl、20 μlおよび200 μl 各1箱
- キャップ付き8-strip nuclease-free 0.2 ml thin wall PCR チューブ
SPRI Bead 精製
- Agencourt AMPure PCR Purification Kit
(5 ml, Beckman Coulter社 Code. A63880 ; 60 ml, Beckman Coulter社 Code. A63881)
- Magnetic Stand-96(Ambion社 Code. AM10027)
- 96-well V-bottom Plate(500 μl)(VWR(Axygen)社 Code. 47743-996)
- MicroAmp Clean Adhesive Seal(Applied Biosystems社 Code. 4306311)
- 80% Ethanol
- Purification Buffer またはElution Buffer(下記の製品に含まれる)
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing(製品コード 634938/634940)
SMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina Sequencing(製品コード 634936)
SMARTer Ultra Low Input RNA for Illumina Sequencing - HV(製品コード 634820/634823/634826/634828/634830)
SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(製品コード 634888/634889/634890/634891/634892/634893/634894)