キャンペーン

タカラバイオ サマーキャンペーン2025(ID:N245)

キャンペーン期間:
2025年7月1日~2025年9月30日


巻頭特集


タカラバイオのイチ推し製品! Trekker™
最近よく聞く「空間解析」。
こんなお悩みはありませんか?
うーん?
  • 始めてみたいけどハードルが高そう
  • 従来の空間解析の課題
    -セグメンテーションの偽陽性評価
    -シングルセルデータと同程度のクオリティが得られない
  • トランスクリプトーム以外のオミックスも評価したい

New Technology 専用装置不要! 真のシングルセル空間トランスクリプトーム解析用試薬
Trekker™ Single-Cell Spatial Mapping Kit
  • ✓ シングルセルデータに位置情報を付与した解析
  • ✓ DNAバーコードで核をタグ付けすることで
    セグメンテーションなしで正確な空間解析が可能
  • ✓ 既存シングルセル解析システムのワークフローに適応
  • ✓ 空間解析専用装置やプローブセット不要
    * シングルセル解析、NGS工程の装置は必要です。


ワークフロー
核をDNAバーコードでタグ付けすることで、シングルセルの正確な空間解析が可能となり、
組織内の細胞の位置情報をシングルセルデータに反映することができます。

【解析例】Trekker™を使用した胚発生11日目(E11)のマウス胚からの核の空間解析
Trekker™を使用した胚発生11日目(E11)のマウス胚からの核の空間解析
E11マウス胚由来の25 μm組織切片をTrekkerタイル(10 mm x 10 mm)に供し、57,545個の核の空間解析を行った。
(A)Trekkerを使用した核の空間マップ。各点は単一の核を表している。(B)隣接する組織切片のHE染色画像。(C)ST align(画像と遺伝子発現を結びつけるツール)によるHE画像とTrekker空間マップの重ね合わせ画像。(D)シングルセル解析から得られたUMAP。各点は図Aの点に1対1に対応している。(E)5種類の遺伝子(Gm3764Rtn1CpoxDnm3osGata3)に関して空間上の発現パターンを示した画像。


製品の仕様
空間解析の解像度シングルセル
サンプルタイプ新鮮凍結組織(Fresh frozen)
タイルサイズ10 mm x 10 mm
必要な設備Cryostat、シングルセル解析プラットフォーム、NGSシーケンサー
作業時間核抽出まで1時間+ シングルセル解析
Trekker™を用いた受託解析も承ります! お気軽にご相談ください。
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メニュー作業仕様納品物
空間トランスクリプトーム解析
(シングルセル空間マッピング)
【供与検体】
・新鮮凍結組織、OCT包埋組織
 ※組織種などはお問い合わせください。
【snRNA-Seqシステム】
・Chromium Universal 3' (v3.1, v4)
  • Cell Ranger解析結果
  • Trekker bioinformatics pipeline
    解析結果fastqファイル
  • 作業報告書