サーバ上で変異の絞り込みを簡単に行えます。

クラウド解析(VariantFilter)

■お問い合わせ窓口(A)

TEL:077-565-6999


[サンプル送付先]
タカラバイオ株式会社 CDMセンター 遺伝子工学研究/検査 受託受付担当 宛て
〒525-0058 滋賀県草津市野路東七丁目4番38号
TEL:077-567-9262
ご注意:伝票の品名に受託名をご記載ください。 お問い合わせフォームは こちら

特長

  • 全ゲノムシーケンス解析およびエクソーム解析に対応
  • クラウド解析サービスでは、サーバ上にアップロードした解析結果より、お客様自身で変異絞り込みを簡単に行っていただけます。
  • 疾患群とコントロール群を指定し、疾患群特異的な変異の絞り込み、アノテーション情報を用いた絞り込みが可能です。

概要

全ゲノムシーケンス解析やエクソーム解析では検体ごとの変異塩基を検出しますが、膨大の数の変異が検出されるため、その中からターゲットの変異を絞り込む必要があります。
クラウド解析サービスでは、クラウド上でフィルタリング機能を用いて簡単に変異の絞り込みを行っていただけます。

サービス内容

ヒト全ゲノムシーケンス解析やエクソーム解析等で得られた変異検出結果をクラウド上にアップロードいたします。各種フィルタリング機能を用いて、クラウド上で変異の絞り込んでいただけます。フィルタリング結果はExcelまたはCSV形式のファイルとしてエクスポート可能です。
※弊社で実施した変異解析結果をアップロードいたします。弊社パイプラインによる変異解析からのご依頼が必要です。
※ヒト全ゲノムシーケンスについては、遺伝子間領域とイントロン領域(splicing donor/acceptor以外)を除いた領域の変異が、クラウドアップロードの対象です。
クラウド上で変異の絞り込み

■ フィルタリング機能

遺伝子、位置情報、既知SNP、変異クオリティ、人種別アレル頻度、疾患影響度、変異影響度などを使用した変異絞り込みが可能です。
変異絞り込み

疾患群(対照群)と正常(コントロール)群を指定し、疾患群特異的な変異の絞り込みが可能です。
疾患群特異的な変異の絞り込み

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

クラウド解析サービスをご利用の場合は、変異解析結果をクラウド上にアップロードし、納品時にクラウドURLをご連絡いたします。クラウド解析サービスは納品後6ヵ月間ご利用いただけます。
※ クラウドご利用には、事前にWEB会員登録が必要です。
※ シーケンス、変異解析からご依頼の場合は、別途、作業報告書・解析データを納品いたします。

■クラウド解析サービスご利用環境について
クラウド解析サービスは、Google Chromeの使用を推奨いたします。Google Chrome 70.0.3538.77のバージョンで動作確認をしております。それ以外のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。

ご注文方法

オンライン注文とFAX注文の2種類からお選びください。
相乗りシーケンスからご依頼の場合は、オンライン注文からご注文ください。
  • オンライン注文:
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    ※ 生物種、検体数等によってはオンライン注文に対応しておりません。その場合は見積書をご用意いたしますので、お問い合わせください。

    ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
    「オンラインのご注文方法について」

    ※オンライン注文ページは Internet Explorer11.0のバージョンのブラウザで動作確認をしております。それ以前のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。 また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • FAX注文:


サンプル送付
  • 解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を上記サンプル送付先へご送付ください。
  • 解析データは平日午前着指定でご送付ください。

受入サンプル

シーケンスデータ
全ゲノムシーケンス解析やエクソーム解析で得られたイルミナ社シーケンスデータ(fastqファイル)
※ シーケンスデータでお預かりの場合は、変異解析からご依頼いただく必要がございます。
※ 弊社で実施した変異解析結果をお持ちの場合は事前にご相談ください。

ご留意事項

ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。 詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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