Fluidigm社C1 Systemに最適化

SMARTer® Ultra® Low RNA Kit for the Fluidigm® C1™ System

  • Fluidigm社 C1システムで単離された単一細胞から直接cDNAを合成
  • 2 IFC、10 IFC 2種類の反応スケールに対応
  • 高品質のRNA-Seq(RNA Sequencing)解析データを取得可能
    -完全長遺伝子解析により全トランスクリプトーム情報を取得
    -5’端、3’端でのcDNA合成のバイアスがない
    -rRNA配列の混入は2%以下
    -エキソンを幅広くカバー
    -高い相関性(ERCC correlation)
メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
CLN 634832 Z4832N SMARTer® Ultra® Low RNA Kit for the Fluidigm® C1™ System, 2 IFCs
  • ライセンス
2 chips ¥185,400
30%OFFクーポン配布中!
CLN 634833 Z4833N SMARTer® Ultra® Low RNA Kit for the Fluidigm® C1™ System, 10 IFCs
  • ライセンス
10 chips ¥628,300
30%OFFクーポン配布中!
本製品のプロトコールは Fluidigm社のウェブサイトでご確認ください。
下記ページのプロトコル  「C1 System for mRNA Seq」が該当します。
https://jp.fluidigm.com/productsupport/c1-support-hub#documents

製品説明

本製品は、Fluidigm社 C1システムで単離された細胞からSingle-Cell mRNA Sequencingに用いるcDNAを調製するためのキットである。本製品はSMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina SequencingをC1システム用に改良しており、逆転写酵素、PCR酵素などcDNA合成に必要な全ての試薬が含まれている。本製品はイルミナ社のGenome Analyzerシステム、HiSeqシステム、HiScanシステム、MiSeqシステム用にデザインされている。

SMART technology

SMART(Switching Mechanism At the 5’End of the RNA Template)技術は、遺伝子の全長をカバーでき、単一細胞の研究、血中循環腫瘍細胞研究、腫瘍細胞中でのスプライシング現象の解析など、トランスクリプトーム解析において威力を発揮する優れた技術である。

解析の流れ

SMARTer Ultra Low RNA Kitは、Fluidigm社 C1システムによるsingle cell mRNA-seqの一環として、単一細胞からのcDNA合成に使用する。本製品で調製したcDNAはイルミナ社のNexteraによるライブラリー作製に使用する。

内容

BOX1
SMARTer IIA Oligonucleotide(12 μM)
BOX2
3' SMART CDS Primer IIA(12 μM)
5×First-Strand Buffer(RNase-Free)
dNTP Mix(10 mM)
Dithiothreitol(DTT)(100 mM)
IS PCR Primer(12 μM)
RNase Inhibitor(40 U/μl)
Dilution Buffer
SMARTScribe Reverse Transcriptase(100 U/μl)
Advantage 2 PCR Kit(製品コード 639207)
50×Advantage 2 Polymerase Mix
10×Advantage 2 PCR Buffer
10×Advantage 2 SA PCR Buffer
50×dNTP Mix(10 mM each)
Control DNA Template(100 ng/μl)
Control Primer Mix(10 μM each)
PCR-Grade Water

保存

SMARTer IIA Oligonucleotide:-70℃
Dilution Buffer:-20℃(融解後は4℃保存)
その他のコンポーネント:-20℃

用途

・Fluidigm社 C1システム単離細胞からのRNA-Seq解析用cDNAの合成
・RNA-Seq解析前のFluidigm社BioMark qPCR用cDNAの合成
Fluidigm C1はFluidigm社のトレードマークです。

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