TaKaRa RNA LA PCR™ Kit (AMV) Ver.1.1
3'-RACE法(例)
サンプルRNA:ヒト培養細胞HL60由来 total RNA
ターゲット:トランスフェリンレセプター(TFR)
増幅サイズ:1,105 kb
図 3'-RACE法の原理図
A.逆転写反応
- 下記に示す反応液を調製する。
試薬 | 使用量 | 最終濃度 |
MgCl2 | 2 μl | 5 mM |
10 × RNA PCR Buffer | 1 μl | 1 × |
RNase Free dH2O | 4.25 μl | |
dNTP Mixture(各10 mM) | 1 μl | 1 mM
|
RNase Inhibitor | 0.25 μl | 1 U/μl
|
AMV Reverse Transcriptase XL | 0.5 μl | 0.25 U/μl |
Oligo dT-Adaptor Prime | 0.5 μl | 0.125 μM
|
HL 60由来 total RNA(1 μg/μl) | 0.5 μl | 0.5 μg |
Total | 10 μl/sample | |
- 調製済のチューブをサーマルサイクラーにセットし、右のプログラムで反応を行う。
30℃、10 min | 1 cycle |
50℃、30 min |
95℃、2 min |
5℃、5 min |
B.PCR
- 下記に示す反応液を調製する。
試薬 | 使用量 | 最終濃度(反応液100 μl) |
MgCl2 | 3 μl | 2.5 mM |
10×LA PCR Buffer II(Mg2+ Free) | 4 μl | 1× |
滅菌精製水 | 31.75 μl | |
TaKaRa LA Taq | 0.25 μl | 1.25 U/50 μl |
M13 Primer M4 | 0.5 μl | 0.2 μM |
TFR-1 Primer | 0.5 μl | 0.2 μM |
Total | 40 μl/sample | |
- 1. の反応液40 μlをA. -2. で逆転写反応を終了したチューブに添加する。
- 調製したチューブをサーマルサイクラーにセットし、右のプログラムで反応を行う。
94℃、30 sec | 30 cycle |
55℃、30 sec |
72℃、5 min |
- 反応終了後、反応液の一部(5 μl)をアガロース電気泳動で確認する。目的の増幅フラグメント(1,105 bp)が確認できる。
TaKaRa RNA LA PCR™ Kit (AMV) Ver.1.1