TaKaRa RNA LA PCR™ Kit (AMV) Ver.1.1
             
           
         
      
      
        
          3'-RACE法(例)
                    
            
            
            サンプルRNA:ヒト培養細胞HL60由来 total RNA
ターゲット:トランスフェリンレセプター(TFR)
増幅サイズ:1,105 kb
図 3'-RACE法の原理図
             
           
                    
            A.逆転写反応
            
            
- 下記に示す反応液を調製する。
| 試薬 | 使用量 | 最終濃度 | 
| MgCl2 | 2 μl | 5 mM | 
| 10 × RNA PCR Buffer | 1 μl | 1 × | 
| RNase Free dH2O | 4.25 μl |   | 
| dNTP Mixture(各10 mM) | 1 μl | 1 mM
 | 
| RNase Inhibitor | 0.25 μl | 1 U/μl
 | 
| AMV Reverse Transcriptase XL | 0.5 μl |  0.25 U/μl | 
| Oligo dT-Adaptor Prime | 0.5 μl | 0.125 μM
 | 
| HL 60由来 total RNA(1 μg/μl) | 0.5 μl | 0.5 μg | 
| Total | 10 μl/sample |   | 
 
- 調製済のチューブをサーマルサイクラーにセットし、右のプログラムで反応を行う。
| 30℃、10 min | 1 cycle | 
| 50℃、30 min | 
| 95℃、2 min | 
|  5℃、5 min | 
 
             
           
                    
            B.PCR
            
            
- 下記に示す反応液を調製する。
| 試薬 | 使用量 | 最終濃度(反応液100 μl) | 
| MgCl2 | 3 μl | 2.5 mM | 
| 10×LA PCR Buffer II(Mg2+ Free) | 4 μl |  1× | 
| 滅菌精製水 | 31.75 μl |   | 
| TaKaRa LA Taq | 0.25 μl | 1.25 U/50 μl | 
| M13 Primer M4 | 0.5 μl | 0.2 μM | 
| TFR-1 Primer | 0.5 μl | 0.2 μM | 
| Total | 40 μl/sample |   | 
 
- 1. の反応液40 μlをA. -2. で逆転写反応を終了したチューブに添加する。
 
- 調製したチューブをサーマルサイクラーにセットし、右のプログラムで反応を行う。
| 94℃、30 sec | 30 cycle | 
| 55℃、30 sec | 
| 72℃、5 min | 
 
- 反応終了後、反応液の一部(5 μl)をアガロース電気泳動で確認する。目的の増幅フラグメント(1,105 bp)が確認できる。
 
             
           
                   
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