試薬の準備 |
Buffer MW2*1、rDNase溶液*2が添付の英文説明書に従って調製、希釈されていることを確認する。 |
1.サンプルの溶解*3 |
組織サンプルの場合 細胞サンプルの場合
組織、または細胞にBuffer ML 300 μlを添加して、5回以上のピペッティングまたはvortexにより溶解する。 |
2.溶解液のろ過 |
NucleoSpin Filter(紫色のリング)をCollection Tube(2 ml:蓋付)にセットする。 |
3.エタノールの添加 |
ろ液300 μl*4に対してエタノール150 μlを添加する。すぐにvortexで5秒間混合する。 |
4.カラムへの吸着 |
NucleoSpin RNA Column(青色のリング)をCollection tube(2 ml:蓋付)にセットする。 |
5.サンプルの溶解 |
カラムを新しいCollection tube(2 ml)にセットする。 |
6.DNAの分解 |
rDNase溶液*2 100 μlをカラムに添加する。蓋を閉めずに室温で15分間以上反応させる。 |
7.タンパク質の不溶化 |
4.のろ液にBuffer MP 300 μlを加え、蓋を閉めて、vortexで5秒間混合する。 |
8.タンパクの除去 |
11,000×g、3分間遠心してタンパク質を沈殿させる。*6 NucleoSpin Protein Removal Column(白色のリング)をCollection tube(2 ml:蓋付)にセットする。 |
9.Bufferの添加 |
NucleoSpin Protein Removal Columnを取り除き、800 μlのBuffer MXを添加する。 |
10.カラムへの吸着 (small RNAのlarge RNA 吸着カラムへの結合) |
Large RNAを結合済みの6のNucleoSpin RNA Column(青色のリング)に9.の溶液600 μlを添加し、11,000×g、30秒間遠心する |
11.メンブレンの洗浄 |
1回目の洗浄 2回目の洗浄
3回目の洗浄 |
12.RNAの溶出 (small RNA+large RNAの精製) |
カラムを新しいCollection tube(1.5 ml)にセットする。 |
*1 Buffer MW2
Wash Buffer RA3(Concentrate)に4倍量の96~100%エタノールを添加して、よく混合する。Buffer MW2は室温で1年間安定である。
*2 rDNase溶液
rDNase(凍結乾燥品)1 vialにReaction Buffer for DNase 3 mlを加え、室温で1分間インキュベートし、その後穏やかに混合し、完全に溶解する。
調製したrDNase溶液は小分けして、-20℃に保存する(6ヵ月間安定)。凍結融解は3回までとする。
*3 サンプルの溶解
サンプルの溶解方法はここで挙げた方法以外にも、各組織にあった方法を使用してもよい。詳細は英文説明書を参照のこと。
*4 300 μl以上のろ液を処理する場合には、ステップ3のエタノール、ステップ7のBuffer MP、ステップ9のBuffer MXを比例して増量する。また一度でカラム処理ができない場合には、その作業を繰り返す。
*5 カラム内部に溶液が残る場合には、カラムを180℃回転させてgのかかる方向を変え、再度遠心する。
*6 沈殿にはタンパク質が含まれており、容易にSDS-PAGE、ウェスタン解析などに使用できる。詳細は英文説明書参照のこと。
*7 微量サンプル(3 mg以下の組織、1×107個以下の細胞)から精製をしている場合、10 μg Carrier RNAを添加することで、収量を改善することができる。詳細は英文説明書参照のこと。
*8 RNAの収量や濃度を上げたい場合は、溶出液量変更することも可能である(英文説明書参照)。