ノロウイルス(GI / GII)遺伝子型判別用PCRキット Ver.2

ノロウイルス遺伝子型判別用PCRキット Ver.2による各種遺伝子型に対する網羅性確認試験

ノロウイルス遺伝子型判別用PCRキットVer.2(以下、本製品:製品コード RC122A/RC123A)*1を用いて網羅性確認試験を行いました。比較として病原体検出マニュアル*2に準拠した反応系(以下、標準法)を用いた試験も行いました。試薬組成、PCR条件、試験結果を以下に示します。

<試薬組成・PCR条件>

人工合成遺伝子(DNA)を鋳型とし、GI.1~9および GII.1~27, GXI.1(旧GII.15)の人工合成遺伝子(DNA)を5×104コピー/反応となるよう供し、PCR反応のみを実施しました。電気泳動には、TAE bufferと3%アガロースゲルを使用し、PCR産物5 µlを供して、100 V/25分間の泳動を行いました。

本製品(製品コード RC122A/RC123A)
(試薬組成)
RT-PCR Mix (NV)-225 μl
Enzyme Mix (NV)4 μl
GI or GII Primer Mix (NV)-22 μl
滅菌水17 μl
人工合成遺伝子(鋳型)2 μl
Total50 μl


(PCR条件)
94℃1分
98℃10秒
 
45サイクル
52℃15秒
68℃30秒
標準法
(試薬組成)
2×PCR Buffer for KOD -Multi & Epi-25 μl
KOD-Multi & Epi-1 μl
Forward primer(10 μM)*32.5 μl
Reverse primer(10 μM)*42.5 μl
滅菌水17 μl
人工合成遺伝子(鋳型)2 μl
Total50 μl

(PCR条件)
94℃2分
98℃10秒
 
45サイクル
50℃15秒
68℃30秒

<結果(GI)>

Marker:100 bp ladder、GI目的産物鎖長:579 bp
GI目的産物鎖長


<結果(GII)>

Marker:100 bp ladder、GII目的産物鎖長:570 bp
GII目的産物鎖長

本製品では、GI遺伝子型9種(P-type 9種)およびGII遺伝子型27種(P-type 18種)の現在確認されている遺伝子型全てを、安定的に増幅することができた。

第43回 日本食品微生物学会学術総会 発表資料より
(タカラバイオ比較データ)

*1 Norovirus (GI) RT-PCR Kit for genotyping Ver.2(製品コード RC122A)、Norovirus (GII) RT-PCR Kit for genotyping Ver.2(製品コード RC123A)
*2 国立感染症研究所「病原体検出マニュアル ノロウイルス (第1版)令和元年6月」
*3 GI: MON432, GII: MON431
*4 GI: G1-SKR, GII: G2-SKR

  ノロウイルス(GI / GII)遺伝子型判別用PCRキット Ver.2