TB Green® Premix Ex Taq™ II FAST qPCR
LightCycler® 480 System IIを用いる場合の操作方法
LightCycler 480 System IIを用いる場合の操作方法
※各機種の取扱説明書に従って操作してください。
- 下記に示すPCR反応液を調製する。
<1反応あたり>
*1 最終プライマー濃度は0.4 μMで良い結果が得られる場合が多いですが、反応性に問題があるときは0.2~1.0 μMの範囲で最適な濃度をご検討ください。
*2 DNA template の場合は、100 ng以下を用いることを推奨します。cDNA template(RT反応液)の場合は、添加量をPCR反応液容量の10%以下にしてください。
*3 各装置の推奨容量に従って調製ください。
- 反応を開始する。
PCR反応は、下記のシャトルPCR標準プロトコールで行うことをお勧めします。まずはこのプロトコールを試し、必要に応じてPCR条件を至適化してください。
Tm値が低めのプライマーなど、シャトルPCRでの反応が難しい場合には、3ステップPCRを行います。(PCR条件を至適化する場合は、「実験条件の選び方」をご参照ください。)
シャトルPCR標準プロトコール
Reaction Volume:20 μl
Hold(初期変性)
*4
95℃、30秒(Ramp Rate 4.4℃/s)
1サイクル
PCR
Analysis Mode:Quantification
95℃、5秒(Ramp Rate 4.4℃/s)
60℃、10秒(Ramp Rate 2.2℃/s、Acquisition Mode:Single)
40サイクル
Melting
Analysis Mode:Melting Curves
95℃、5秒(Ramp Rate 4.4℃/s)
60℃、1分(Ramp Rate 2.2℃/s)
95℃(Ramp Rate 0.11℃/s、Acquisition Mode:Continuous, Acquisition:5 per℃)
1サイクル
Cooling
50℃、30秒(Ramp Rate 2.2℃/s)
1サイクル
*4 PCR産物(dUTPを含む)によるコンタミネーションが疑われる場合には、初期変性の前に 25℃ 2 ~10分のステップを実施してください。UNGの作用により前回の実験からキャリーオーバーしたPCR産物が分解されます。
※使用上の注意
本製品に使用している変異型Taq HSはポリメラーゼ活性を抑制する抗Taq抗体を利用したホットスタートPCR用酵素です。他社の化学修飾タイプのホットスタートPCR酵素で必要なPCR反応前の95℃(5~)15分の活性化ステップは行わないでください。必要以上の熱処理を加えると酵素活性が低下し、増幅効率、定量精度に影響を及ぼす傾向があります。PCR反応前に鋳型の初期変性を行う場合でも、通常95℃ 30秒で充分です。
- 反応終了後、増幅曲線と融解曲線を確認し、定量を行う場合は検量線を作成する。
解析方法は、各装置の取扱説明書をご参照ください。
TB Green® Premix Ex Taq™ II FAST qPCR