TaKaRa RNA LA PCR™ Kit (AMV) Ver.1.1

3'-RACE法(例)

サンプルRNA:ヒト培養細胞HL60由来 total RNA
ターゲット:トランスフェリンレセプター(TFR)
増幅サイズ:1,105 kb

図 3'-RACE法の原理図

A.逆転写反応

  1. 下記に示す反応液を調製する。
    試薬使用量最終濃度
    MgCl22 μl5 mM
    10 × RNA PCR Buffer1 μl1 ×
    RNase Free dH2O4.25 μl 
    dNTP Mixture(各10 mM)1 μl1 mM
    RNase Inhibitor0.25 μl1 U/μl
    AMV Reverse Transcriptase XL0.5 μl 0.25 U/μl
    Oligo dT-Adaptor Prime0.5 μl0.125 μM
    HL 60由来 total RNA(1 μg/μl)0.5 μl0.5 μg
    Total10 μl/sample 
  2. 調製済のチューブをサーマルサイクラーにセットし、右のプログラムで反応を行う。
    30℃、10 min1 cycle
    50℃、30 min
    95℃、2 min
    5℃、5 min

B.PCR

  1. 下記に示す反応液を調製する。
    試薬使用量最終濃度(反応液100 μl)
    MgCl23 μl2.5 mM
    10×LA PCR Buffer II(Mg2+ Free)4 μl
    滅菌精製水31.75 μl 
    TaKaRa LA Taq0.25 μl1.25 U/50 μl
    M13 Primer M40.5 μl0.2 μM
    TFR-1 Primer0.5 μl0.2 μM
    Total40 μl/sample 
  2. 1. の反応液40 μlをA. -2. で逆転写反応を終了したチューブに添加する。
  3. 調製したチューブをサーマルサイクラーにセットし、右のプログラムで反応を行う。
    94℃、30 sec30 cycle
    55℃、30 sec
    72℃、5 min
  4. 反応終了後、反応液の一部(5 μl)をアガロース電気泳動で確認する。目的の増幅フラグメント(1,105 bp)が確認できる。

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