製品説明
本製品は、O-157:H7をはじめとする腸管出血性大腸菌(EHEC)による食中毒の原因遺伝子であるベロ毒素1型、2型遺伝子をPCR法で増幅することにより、EHECの検出とタイピングを簡便に、かつ迅速に行うためのOne Shot PCRキットである。PCRに必要な試薬全てが0.2 ml PCR tubeに分注されており、サンプルDNAを加えるだけでPCRを開始することができる。
また、DNAポリメラーゼにホットスタートタイプで増幅効率に優れたTaKaRa Ex Taq HSを用いることにより、短時間でより高感度かつ安定した検出が可能になった。さらに反応阻害等による偽陰性判定を防ぐため、各tubeにはPCRのpositive controlとなるControl templateが含まれている。このテンプレートを鋳型にした場合の増幅産物はベロ毒素遺伝子由来の増幅産物とサイズが大きく異なるので、電気泳動による判定を容易に行うことができる。
内容
(48回分、50 μl反応系)
2×One Shot PCR solution tube(無色の0.2 ml PCR tube) 25 μl×48
* 本キットは、ロットA2201AよりVer.2となりました。
プロトコールの変更に伴い、50 μl反応系×48回用に変更になりました。
保存
-20℃
各コンポーネントにはTaKaRa Ex Taq HSが含まれているので、激しい撹拌操作や凍結融解は避ける。
また、凍結融解により反応性が低下する場合があるので、使用するtubeのみ融解すること。
キット以外に必要な試薬、機器
本キットを用いた検出過程では、さらに次のような試薬、機器を必要とする。
【試薬】
- 滅菌精製水
- アガロースゲル
PrimeGel Agarose PCR-Sieve(製品コード 5810A)
- 電気泳動用 buffer
Tris-Acetate-EDTA Buffer (TAE) 50×Powder, pH8.3(製品コード T9131)
またはTBE (Tris-borate-EDTA) powder(製品コード T905)
- DNAマーカー
pHY Marker(製品コード 3404A/B)
またはφ X174‐Hinc II digest(製品コード 3406A/B)
または100 bp DNA ladder(製品コード 3407A/B)
- Loading buffer(6× : 36% glycerol, 0.05% bromophenol blue, 0.035% xylene cyanol, 30 mM EDTA)(4. に記載のDNAマーカーには添付されている。)
- DNA染色剤
SYBR Green I Nucleic Acid Gel Stain(製品コード 5760A/5761A)
またはエチジウムブロマイド
【機器】
- ヒートブロック(95℃まで温度を上げられるもの)
- 1.5 mlチューブ対応型冷却遠心機
- サーマルサイクラー
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(製品コード TP350)
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient(製品コード TP600)
- 電気泳動装置
Mupid-2plus(製品コード M-2P)
Mupid-exU(製品コード EXU-1)
Mupid-One(製品コード O1-01)
- 電気泳動ゲル撮影装置(SYBR Green Iを使用する場合は専用のフィルターが必要です。)
【その他】
- 1.5 mlチューブまたは0.2 ml PCR tube
[ 0.2 ml Hi-Tube Dome Cap(製品コード NJ200)など
- 200 μl & 20 μlマイクロピペット
- マイクロピペット用チップ
- ポラロイドフィルム
- アガロースゲル染色用トレイ(SYBR Green I を使用される場合はポリプロピレン製容器を使用してください。)
増幅されるDNAサイズ
標的遺伝子 | 増幅DNAサイズ |
VT1 | 349 bp |
VT2, VT2vha, VT2vhb, VT2vp1, VT2vp2 | 112 bp |
2×One Shot PCR solution中に含まれているもの
- PCR Primer
- Control template
PCRが正常に行われていることを確認するためのpositive control templateであり、このtemplateを鋳型にしてPCRを行うと、1,070 bpの増幅産物が得られる。
- TaKaRa Ex Taq HS
TaKaRa Ex Taq HSは、抗Taq抗体とTaKaRa Ex Taqを混合したもので、ホットスタートPCR用の酵素である。高温に加熱するまでは抗Taq抗体が酵素に結合しポリメラーゼ活性を抑えているため、サイクル前のミスプライミングやプライマーダイマーに起因する非特異的増幅を防ぐことができる。
- Ex Taq Buffer
- dNTP Mixture