RNA精製不要で新型コロナウイルス変異株の変異をダイレクト検出
＊ 本製品は研究用試薬です。環境調査や疫学調査などに使用します。生体試料を用いたSARS-CoV-2感染の診断補助には、体外診断用医薬品Takara SARS-Cov-2ダイレクト検出キットをご使用ください。
- プライマー・プローブとコアキットを組み合わせて自由に使用可能
本シリーズのプライマー・プローブはすべて、SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Core Kit（製品コード RC330A）＊と組み合わせて使用可能です。
＊ SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Kit（製品コード RC300A/RC30JW）と同じ反応系です。
反応条件は、プライマー・プローブの取扱説明書をご確認ください（一部温度条件が異なります）。 - RNA精製は不要、ダイレクトに検出！
サンプルと前処理試薬の混合液を熱処理するだけの簡便な前処理でRT-PCRが可能 - 前処理から検出まで1時間以内、迅速に判定可能
本製品シリーズを用いたオミクロン株（B.1.1.529+BA.＊系統）の検出について
※オミクロン株においては、N501Y、T478K、P681Hの検出について、上記の当該変異検出用試薬をご利用いただけません。
詳細はリンク先をご確認ください。
※オミクロン株においては、N501Y、T478K、P681Hの検出について、上記の当該変異検出用試薬をご利用いただけません。
詳細はリンク先をご確認ください。
新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）変異検出用ポジティブコントロールRNAはこちら
【Primer/Probe L452R (SARS-CoV-2)（製品コード RC346A）】バージョンアップのお知らせ
2021年6月14日（月）出荷分（Lot：AL52809A）よりバージョンアップして仕様変更しましたので、ご使用前に取扱説明書をご確認ください。
変更の詳細はこちら
2021年6月14日（月）出荷分（Lot：AL52809A）よりバージョンアップして仕様変更しましたので、ご使用前に取扱説明書をご確認ください。
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製品説明
本製品は、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）のスパイクタンパク質におけるN501Y、L452R/L452Q、T478K、E484K/E484Q/E484A、F490S、P681R/P681H、G339D、ins214EPEの変異を検出するための迅速・簡便なリアルタイムPCR試薬で、各変異をそれぞれ特異的に検出するためのプライマー・プローブと、コアキット（PCR酵素ミックスと前処理試薬のセット）、ポジティブコントロールRNAを組み合わせて使用する。（ポジティブコントロールRNA各種はこちら）
製品化にあたり、群馬パース大学大学院 木村博一教授に監修していただいた。
※N501Y、E484K/E484Q/E484A、L452R/L452Q、T478K、F490S、P681R/P681H、G339D、ins214EPEの各変異は、新型コロナウイルスのスパイクタンパク質にみられるアミノ酸変異である。これらの変異を持つ変異株として以下が報告されている。
【特長】
【検出フロー】
【判定イメージ】
※ Primer/Probe E484K/E484Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC349A）については、FAM：Wild検出系、Cy5：E484K Mutant検出系、HEX：E484Q Mutant検出系で、Primer/Probe L452R/L452Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC343A）については、FAM：Wild検出系、Cy5：L452R Mutant検出系、HEX：L452Q Mutant検出系で、また、Primer/Probe P681R/P681H (SARS-CoV-2)（製品コード RC321A）については、FAM：Wild検出系、HEX：P681R Mutant検出系、Cy5：P681H Mutant検出系で、それぞれの変異の判定を行います。
製品化にあたり、群馬パース大学大学院 木村博一教授に監修していただいた。
※N501Y、E484K/E484Q/E484A、L452R/L452Q、T478K、F490S、P681R/P681H、G339D、ins214EPEの各変異は、新型コロナウイルスのスパイクタンパク質にみられるアミノ酸変異である。これらの変異を持つ変異株として以下が報告されている。
- N501Y変異：アルファ株（EPI_ISL_601443）、ベータ株（EPI_ISL_700428）、ガンマ株（EPI_ISL_833137）など
- E484K変異：ベータ株（EPI_ISL_700428）、ガンマ株（EPI_ISL_833137）など
- E484Q変異：カッパ株（EPI_ISL_1704611）など
- E484A変異：オミクロン株BA.1（EPI_ISL_6913953.2）、BA.1.1（EPI_ISL_7571618）、BA.2（EPI_ISL_8559646）など
- L452R変異：デルタ株（EPI_ISL_2379631）など
- L452Q変異：ラムダ株（EPI_ISL_2508582）など
- T478K変異：デルタ株（EPI_ISL_2379631）など
- F490S変異：ラムダ株（EPI_ISL_2508582）など
- P681R変異：ガンマ株（EPI_ISL_833137）、デルタ株（EPI_ISL_2379631）など
- P681H変異：アルファ株（EPI_ISL_601443）、ミュー株（EPI_ISL_2933813）など
- G339D変異：オミクロン株BA.1（EPI_ISL_6913953.2）、BA.1.1（EPI_ISL_7571618）、BA.2（EPI_ISL_8559646）など
- ins214EPE変異：オミクロン株BA.1（EPI_ISL_6913953.2）、BA.1.1（EPI_ISL_7571618）など ※変異株の名称はWHOによる分類を示し、括弧内は代表的GISAID Accession IDを示しています。
【特長】
- プライマー・プローブとコアキットを組み合わせて自由に使用可能
本シリーズのプライマー・プローブはすべて、SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Core Kit（製品コード RC330A）＊と組み合わせて使用可能です。
＊ SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Kit（製品コード RC300A/RC30JW）と同じ反応系です。
反応条件は、プライマー・プローブの取扱説明書をご確認ください（一部温度条件が異なります）。 - RNA精製は不要、ダイレクトに検出！
サンプルと前処理試薬の混合液を熱処理するだけの簡便な前処理でRT-PCRが可能 - 前処理から検出まで1時間以内、迅速に判定可能
【検出フロー】
【判定イメージ】
| FAM (Wild 検出系） | Cy5 (Mutant 検出系） | 判定 |
 |  | 変異あり |
 |  | 変異なし |
※ Primer/Probe E484K/E484Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC349A）については、FAM：Wild検出系、Cy5：E484K Mutant検出系、HEX：E484Q Mutant検出系で、Primer/Probe L452R/L452Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC343A）については、FAM：Wild検出系、Cy5：L452R Mutant検出系、HEX：L452Q Mutant検出系で、また、Primer/Probe P681R/P681H (SARS-CoV-2)（製品コード RC321A）については、FAM：Wild検出系、HEX：P681R Mutant検出系、Cy5：P681H Mutant検出系で、それぞれの変異の判定を行います。
内容
SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Core Kit（製品コード RC330A）（100回分）
Primer/Probe N501Y (SARS-CoV-2) （製品コード RC344A）（300 μl）
Primer/Probe E484K (SARS-CoV-2)（製品コード RC345A）（300 μl）
Primer/Probe L452R (SARS-CoV-2) Ver.2（製品コード RC346A）（300 μl）
Primer/Probe T478K (SARS-CoV-2)（製品コード RC347A）（300 µl）
Primer/Probe F490S (SARS-CoV-2)（製品コード RC348A）（300 µl）
Primer/Probe E484A (SARS-CoV-2)（製品コード RC322A）（300 µl）
Primer/Probe G339D (SARS-CoV-2)（製品コード RC323A）（300 µl）
Primer/Probe ins214EPE (SARS-CoV-2)（製品コード RC324A）（300 µl）
Primer/Probe E484K/E484Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC349A）（300 µl）
Primer/Probe L452R/L452Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC343A）（300 µl）
Primer/Probe P681R/P681H (SARS-CoV-2)（製品コード RC321A）（300 µl）
＊1 酵素、基質等を含む。
＊2 蛍光物質を含んでいるため、遮光に留意すること。
＊3 蛍光標識プローブを含んでいるため、遮光に留意すること。
| Solution A | 800 μl |
| RT-qPCR Mix＊1 | 2× | 750 μl×2本 |
 RNase Free H2O | 1 ml | |
| ROX Reference Dye II＊2 | 50× | 60 μl |
Primer/Probe N501Y (SARS-CoV-2) （製品コード RC344A）（300 μl）
| Primer/Probe N501Y＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe E484K (SARS-CoV-2)（製品コード RC345A）（300 μl）
| Primer/Probe E484K＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe L452R (SARS-CoV-2) Ver.2（製品コード RC346A）（300 μl）
| Primer/Probe L452R Ver.2＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe T478K (SARS-CoV-2)（製品コード RC347A）（300 µl）
| Primer/Probe T478K＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe F490S (SARS-CoV-2)（製品コード RC348A）（300 µl）
| Primer/Probe F490S＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe E484A (SARS-CoV-2)（製品コード RC322A）（300 µl）
| Primer/Probe E484A＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe G339D (SARS-CoV-2)（製品コード RC323A）（300 µl）
| Primer/Probe G339D＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe ins214EPE (SARS-CoV-2)（製品コード RC324A）（300 µl）
| Primer/Probe ins214EPE＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe E484K/E484Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC349A）（300 µl）
| Primer/Probe E484K/E484Q＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe L452R/L452Q (SARS-CoV-2)（製品コード RC343A）（300 µl）
| Primer/Probe L452R/L452Q＊3 | 10× | 300 μl |
Primer/Probe P681R/P681H (SARS-CoV-2)（製品コード RC321A）（300 µl）
| Primer/Probe P681R/P681H＊3 | 10× | 300 μl |
＊1 酵素、基質等を含む。
＊2 蛍光物質を含んでいるため、遮光に留意すること。
＊3 蛍光標識プローブを含んでいるため、遮光に留意すること。
保存
－20℃
実験例
＜N501Y変異検出およびE484K変異検出＞
Twist Bioscience社のControl 2 (MN908947.3) およびControl 16 (B.1.351, EPI_ISL_678597)を適宜希釈し、1反応当り 0（RNase Free H2O）、50、500、5,000コピーを鋳型として使用した場合の反応例を以下に示す。
（qPCR装置はQuantStudio 5 Real-Time PCR Systemを使用）
＜L452R変異検出＞
Positive Control RNA Set (L452R)の Positive Control RNA (wild)およびPositive Control RNA (L452R)を適宜希釈し、1反応当り 0（Negative Control）、50、500、5,000コピーを鋳型として使用した場合の反応例を以下に示す。
（qPCR 装置は QuantStudio 5 Real-Time PCR Systemを使用）
Twist Bioscience社のControl 2 (MN908947.3) およびControl 16 (B.1.351, EPI_ISL_678597)を適宜希釈し、1反応当り 0（RNase Free H2O）、50、500、5,000コピーを鋳型として使用した場合の反応例を以下に示す。
（qPCR装置はQuantStudio 5 Real-Time PCR Systemを使用）
N501Y変異検出の場合
＜鋳型＞ Control 2 (MN908947.3)（501N Wild Template）
＜鋳型＞ Control 16 (B.1.351, EPI_ISL_678597)（N501Y Mutant Template）
E484K変異検出の場合
＜鋳型＞ Control 2 (MN908947.3)（484E Wild Template）
＜鋳型＞ Control 16 (B.1.351, EPI_ISL_678597)（E484K Mutant Template）
＜L452R変異検出＞
Positive Control RNA Set (L452R)の Positive Control RNA (wild)およびPositive Control RNA (L452R)を適宜希釈し、1反応当り 0（Negative Control）、50、500、5,000コピーを鋳型として使用した場合の反応例を以下に示す。
（qPCR 装置は QuantStudio 5 Real-Time PCR Systemを使用）
＜鋳型＞ Positive Control RNA (wild)
＜鋳型＞ Positive Control RNA (L452R)
使用に際して
本製品を使用する際の注意事項です。使用前に必ずお読みください。
- 使用目的：
本キットは、研究用試薬です。 - 測定結果：
本製品はウイルス遺伝子を検出する試薬であるため、感染性のない不活化されたウイルスを検出する可能性があります。
また、Primer/Probeの配列内に遺伝子の変異や欠損／挿入が生じた際には、検出できない場合があります。
（反応結果により発生する問題に関して、タカラバイオ株式会社は一切の責任を負いません。） - 廃棄：
試料は感染性を有するものとして、各施設の安全規定に従って廃棄してください。作業区域は常に清潔に保ち、検体または検査に用いた器具等は高圧蒸気滅菌器を用いて121℃で20分間以上加熱滅菌処理、または次亜塩素酸ナトリウム液で処理を行った上、各施設の感染性廃棄処理マニュアルに従って処理してください。試薬を廃棄する際は多量の水で流してください。
プラスチックなどの試薬容器ならびに器具は、廃棄物の処理および清掃に関する法律に従って処理してください。
補足資料
【Quick Manual】
Thermal Cycler Dice Real Time SystemシリーズおよびCronoSTAR 96 Real-Time PCR Systemシリーズを使用の場合に便利な“Quick Manual”をご用意しています。 キットに添付の取扱説明書とあわせてご使用ください。
Thermal Cycler Dice Real Time SystemシリーズおよびCronoSTAR 96 Real-Time PCR Systemシリーズを使用の場合に便利な“Quick Manual”をご用意しています。 キットに添付の取扱説明書とあわせてご使用ください。
- Thermal Cycler Dice Real Time System III (Cy5) with PC（製品コード TP990）
- Thermal Cycler Dice Real Time System Lite（製品コード TP700：終売）
- CronoSTAR 96 Real-Time PCR System（製品コード 640231/640232）
- CronoSTAR Portable Real-Time PCR System（製品コード 640247/640249）
- Thermal Cycler Dice Real Time Systemシリーズ操作マニュアル －SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Kit（RC330A, RC344A, RC371A）専用－
- Thermal Cycler Dice Real Time Systemシリーズ操作マニュアル －SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Kit（RC330A, RC345A, RC372A）専用－
- CronoSTAR 96 Real-Time PCR Systemシリーズ操作マニュアル －新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）変異検出用プライマー・プローブ各種専用－
- CronoSTAR Portable Real-Time PCR Systemシリーズ操作マニュアル －SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Kit（RC330A, RC344A, RC371A）専用－
- CronoSTAR Portable Real-Time PCR Systemシリーズ操作マニュアル －SARS-CoV-2 Direct Detection RT-qPCR Kit（RC330A, RC345A, RC372A）専用－
- 注意事項
- 本ページの製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
- タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。
- タカラバイオ製品に関連するライセンス・パテントについては、ライセンスマークをクリックして内容をご確認ください。
また、他メーカーの製品に関するライセンス・パテントについては、各メーカーのウェブサイトまたはメーカー発行のカタログ等でご確認ください。 - ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
