製品説明
炭疽菌は、芽胞を形成する好気性グラム陽性桿菌であり、その病原性は、2種類の毒性プラスミド(pX01、pX02)によるものである。pX01プラスミドは3種類の毒素成分(PA: protective antigen, LF: lethal factor, EF: edema factor)をコードしている。一方、pX02プラスミドは莢膜合成に関係する遺伝子(capA, capB, capC)をコードしている。これら2種類の毒性プラスミドの両方を保持する場合に病原性を示す。
TaKaRa 炭疽菌 PCR Detection Kitは、pX01プラスミドに含まれるPA遺伝子およびpX02プラスミドに含まれるcapA遺伝子をPCR法により一本の反応チューブで同時に増幅し、アガロースゲル電気泳動により検出するためのキットである。増幅にはHot Start用酵素(TaKaRa Ex Taq HS)を使用しているので、反応液調製時などサイクル前のミスプライミングやプライマーダイマーに由来する非特異的増幅を防ぐことができ、高感度の検出が可能となっている。また本キットにはインターナルコントロールが含まれているため、偽陰性をモニターすることができる。
なお、本キットの製品化にあたり、帯広畜産大学畜産学部獣医学科 牧野壮一先生にご協力をいただきました。
内容
(48回分)
TaKaRa Ex Taq HS(5 units/μl) | 12.5 μl |
5×Reaction Mixture*1 | 500 μl |
PA Primers(PA7, PA6)(各10μM) | 200 μl |
CAP Primers(M011, M012)(各10μM) | 200 μl |
100 bp DNA Ladder(650 ng/5μl) | 50 μl |
6×Loading buffer*2 | 60 μl |
*1 dNTP Mixture、Internal Control を含む。
*2 36% グリセロール、30 mM EDTA、0.05% Bromophenol Blue、0.035% キシレンシアノール
保存
-20℃
プライマー配列と増幅サイズ
|
プライマー名 |
配列 |
ターゲット 増幅サイズ |
インターナルコントロール 増幅サイズ |
PA Primers |
PA7 |
5'- ATCAC CAGAG GCAAG ACACC C -3' |
211 bp |
409 bp |
PA6 |
5'- ACCAA TATCA AAGAA CGACG C -3' |
CAP Primers |
MO11 |
5'- GACGG ATTAT GGTGC TAAG -3' |
591 bp |
98 bp |
MO12 |
5'- GCACT GGCAA CTGGT TTTG -3' |
キット以外に必要な試薬、機器(主なもの)
本キットを用いた検出過程では、さらに次のような試薬、機器を必要とする。
- 【試薬】
- 1. 滅菌精製水
- 2. PrimeGel Agarose PCR-Sieve(製品コード 5810A)
- 3. 電気泳動用buffer [TBE (Tris-Borate-EDTA) Buffer powder(製品コード T905)など]
- 4. DNA染色剤 [SYBR Green I Nucleic Acid Gel Stain(製品コード 5760A/5761A)、またはエチジウムブロマイド]
- 【機器】
- 1. サーマルサイクラー
[TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(製品コード TP350)]
[TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient (製品コード TP600)]
- 2. 電気泳動装置
Mupid-2plus(製品コード M-2P)
Mupid-exU(製品コード EXU-1)
Mupid-One(製品コード O1-01)など
- 3. 電気泳動ゲル撮影用装置(SYBR Green Iを使用する場合は専用のフィルターが必要です。)
- 4. UVトランスイルミネーター(300 nm前後のもの)
- 5. 電気泳動ゲル撮影用ポラロイドカメラ
(SYBR Green Iを使用される場合は専用のフィルターが必要です。)
- 6. ヒートブロック(95℃まで温度を上げられるもの)
- 7. 1.5 mlチューブ対応型冷却遠心機
- 【その他】
- 1. 0.2 ml PCR tube[0.2 ml Hi-Tube Dome Cap (製品コード NJ200)]など
- 2. マイクロピペット
- 3. マイクロピペット用チップ(疎水性フィルター付き)
- 4. ポラロイドフィルム
- 5. アガロースゲル染色用トレイ(SYBR Green Iを使用される場合は、ポリプロピレン製容器を使用してください。)