5,184個(72×72)の微小ウェルを持つSmartChip上に、数十ナノリットルレベルの精密なディスペンシング(ナノ分注)を行います。5,184ウェルの各ウェルにおいてリアルタイムPCR反応を行うため、一度に多数の遺伝子(SNP)、サンプルを解析することが可能です。微量で反応を行うことで、試薬や試料の使用量が抑えられコスト削減にも貢献します。
チャンバー内の湿度を一定に保つように管理された閉鎖環境内で8チャンネルのノズルによって反応液を分注します。インストール済みの分注パターンに従って規則的・効率的に SmartChip上を移動することで、40分で5,184ウェルに反応液を分注することができます(分注時間は分注パターンに依存します)。
MultiSample NanoDispenser によりサンプルおよびPrimer/Probeを含む反応液をSmartChip上に自動分注した後、SmartChip Real-Time PCR CyclerでリアルタイムPCRを行うことで、多サンプル遺伝子発現やSNPジェノタイピング解析を行うことができます。
SmartChip 分注パターン | ||||||||||||||
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Assays | 12 | 24 | 36 | 48 | 54 | 72 | 80 | 96 | 120 | 144 | 216 | 248 | 296 | 384 |
Samples | 384 | 216 | 144 | 108 | 96 | 72 | 64 | 54 | 42 | 36 | 24 | 20 | 16 | 12 |
FAMおよびVIC色素を使用したプローブ検出系(5’-ヌクレアーゼ法)により複数サンプルをSNPジェノタイピング解析した結果、平均コールレート98%以上、平均一致率99.8%以上の値が得られました。
操作者・チップ・作業日が異なる条件で、同じ遺伝子発現解析実験を行った結果、操作者間・チップ間・作業日間の比較において非常に高い相関係数(R2 > 0.98) が得られました。
SmartChipは熱が伝わりやすい金属製で、325 copies / wellでDNAを5,184ウェル全てにロードしてリアルタイムPCRを行った結果、Ct値の範囲は19.36~19.96の間に収まり、標準偏差は0.1以下でした。
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お問い合わせSmartChip Real-Real Time PCR Cycler仕様 | ||
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同時測定サンプル数 | 5,184反応 | |
反応液量 | 100 nl/well | |
検出精度 | 5,000~10,000コピーのコントロール鋳型を用いてリアルタイムPCRを行い得られたCt値の標準偏差が0.2未満 | |
蛍光検出波長 | 励起フィルター | 蛍光フィルター |
FAM (475/35) | FAM (520/15) | |
VIC (520/15) | VIC (565/24) | |
ROX (543/22) | ROX (676/29) | |
SYBR (475/42) | SYBR (550/50) | |
蛍光検出法 | 冷却CCDカメラ方式、930万画素 | |
蛍光励起光源 | 250 W 安定化タングステンハロゲンランプ、定格寿命1,000時間 | |
加熱速度 | 加熱速度:20秒未満(65~95℃)、冷却速度:15秒未満(95~65℃)、典型的な条件による40サイクルのリアルタイムPCRを実行した場合の反応時間は約2時間となります | |
冷却速度 | 融解曲線分析時の加熱速度:0.5~2℃/step(サイクル条件設定により変更することができ、推奨加熱速度は0.5℃/stepとなります) | |
温度精度 | 温度精度:76℃設定で±0.5℃ | |
ソフトウェア | SmartChip リアルタイムPCR装置制御・解析ソフトウェア。サイクラー1台につきソフトウェアは5台のコンピューターまでインストールできます | |
コンピューター | 64ビット版Windows7エンタープライズ、4 GBメモリー、250 GBストレージ、1ギガビットネットワークアダプター、USBポート(USBフラッシュドライブ使用)、液晶モニター、Dellウルトラスモールフォームファクター | |
電源 | AC100~120/200–240 V±10%、8/4 A、50~60 Hz、2個口(サイクラー、コンピューター・モニター) | |
ヒューズ | 5×20 mm、T6.3AH | |
設置環境条件 | 周辺温度:15~30℃、湿度:10~70%RH ただし結露なきこと、標高2,000 m未満、汚染度 2以下 | |
外形寸法 | サイクラー:(W)66 cm、(H)53 cm、(D)60 cm | |
コンピューター・モニター:(W)60 cm、(H)50 cm、(D)50 cm | ||
重量 | サイクラー:57 kg、コンピューター・モニター:12 kg | |
適合規格 | TUV(North America)、CE Mark(European Union) | |
エアー | ドライエアー(推奨露点-40℃)、ガス圧 6.9~8.3 bar(100~120 psi)、圧力調整器出力:4 mmODウレタンチューブが接続可能なこと、あるいは配管口径M5または1/8 NPTメス口を持つ | |
(エアーおよび圧力調整器の対応についてはタカラバイオにお問い合わせください) |
SmartChip MultiSample NanoDispenser仕様 | ||
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最大サンプル数 | 384 | |
分注液量 | 100 nl/well | |
コンピューター | 64ビット版Windows7エンタープライズ、2 GBメモリー、250 GBストレージ、1ギガビットネットワークアダプター(無線)、USBポート | |
電源 | AC100~120/200~240 V、8/4A、60/50Hz、4個口(MSND、ポンプコントロールボックス、コンピューター) | |
設置環境条件 | 周辺温度:15~30℃、湿度:10~70%RH ただし結露なきこと | |
外形寸法 | 送液モジュール:(W)28 cm、(H)33 cm、(D)45 cm ステージモジュール:(W)27 cm、(H)40 cm、(D)60 cm コンピューター:(W)35 cm、(H)30 cm、(D)27 cm |
ポンプコントロールボックス:(W)26 cm、(H)38 cm、(D)51 cm 加湿器:(W)20 cm、(H)40 cm、(D)30 cm はかり:(W)25 cm、(H)50 cm、(D)22 cm |
重量 | MSND:65 kg、コンピューター:2.7 kg | |
性能 | ラムダDNAを用いてリアルタイムPCRを行い得られたCt値の標準偏差が0.2未満 48サンプル:10分未満、384サンプル:60分未満 |
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適合規格 | TUV(North America)、CE Mark(European Union) | |
エアー | ヘリウム(99.9%以上)、ガス圧 2.0~2.8 bar(29~41 psi)、圧力調整器出力:3.2 mmODウレタンチューブが接続可能なこと、あるいは配管口径M5または1/8 NPTメス口を持つ (エアーおよび圧力調整器の対応についてはタカラバイオにお問い合わせください) |
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