GenomeWalker KitsはPCR法に基づくシンプルな方法により、EST(expression sequence tag, 発現配列タグ)などの既知配列からスタートして、ゲノムDNAの上流または下流へウォーキングを行える。GenomeWalkerでは長距離PCRを用いるため、各ウォーキングで最高6 kbまでのゲノムDNAが得られる(図1)。得られた配列から新たなプライマーを作製してウォーキングを繰り返すだけで、簡単にウォーキング範囲を広げることができる。
用途
- Genomic DNA walking
- プロモーターや調節領域の同定
- エキソンジャンクションのマッピング
- トランスポゾンやウイルスの挿入位置同定
- Zinc finger nucleaseやTAL effector nucleaseなどによるゲノムDNA改変の確認
- ゲノムDNAのクローニング
- 次世代シーケンサーによるマッピング
内容
Universal GenomeWalker 2.0(製品コード 636405)
・Four Restriction Enzymes (Dra I, EcoR V, Pvu II & Stu I)
・Corresponding Restriction Enzyme Buffers
・Positive Control Human GenomeWalker Library
・Adaptor Primer 1 (AP1)
・Nested Adaptor Primer 2 (AP2)
・GenomeWalker Adaptor
・Positive Control tPA Primer 1 (PCP1)
・Positive Control tPA Nested Primer 2 (PCP2)
・T4 DNA Ligase
・Ligation Buffer
・Positive Control Human Genomic DNA
・NucleoSpin Tissue(製品コード 740952.10)
・NucleoSpin Gel and PCR Clean-Up(製品コード 740609.50)
・Advantage 2 PCR Kit(製品コード 639207)
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