製品説明
ウイロイドは、低分子の (RNA)核酸病原体であり、植物に寄生して、わい化・葉巻・奇形などの症状を引き起こすことが知られている。ウイロイドは、約250~400ヌクレオチドの一本鎖の環状RNAだけからなり、構造タンパク質を欠き、独自のタンパク質情報もコードしていない。PSTVd(ポテトスピンドルチューバーウイロイド)やTCDVd(トマトクロロティックドワーフウイロイド)はジャガイモやトマトの最重要病害の一つで、近年、世界中で感染拡大の兆候が見られ、日本においても発生が確認されている。感染拡大を防止するためには原因ウイロイドの早期発見、感染株の除去が必要となる。
本キットは、PSTVdおよびTCDVdの本体である環状RNAを、RT-Cycleave ICAN法により簡便に検出するためのキットである。
Cycleave ICAN法は、検出特異性の非常に高いサイクリングプローブ法と等温核酸増幅法であるICAN法を組み合わせた方法である。判定は反応後のチューブにUVを照射することにより、増幅されたPSTVd/TCDVdの有無を蛍光で目視確認する。目的産物が増幅された場合、反応液はUV照射でピンク色を呈する。
内容
(25 μl、100回)
1. RT Reaction Mix | 875 μl |
2. PrimeScript RTase (200 U/μl) | 25 μl |
3. ICAN Enzyme Mix | 750 μl |
4. PSTVd/TCDVd Primer/Probe Mix* | 750 μl |
5. Positive Control RNA | 50 μl |
6. Dilution Buffer | 1 ml |
* 遮光保存に留意してください。
保存
-20℃
(コンポーネント1、3、4は、6ヵ月以内であれば、4℃での保存も可能です。融解時は激しい撹拌は避けてください。融解後は、均一になるように軽くチューブを転倒混和してからご使用ください。融解時に沈殿物が生じた場合は、軽くチューブを転倒混和して沈殿物を溶解後ご使用ください。)
キット以外に必要な器具、機器(主なもの)
[器具]
- 耐エアロゾル性マイクロピペット
- マイクロピペット用チップ(疎水性フィルター付)
- 0.2 mlマイクロチューブ(製品コード 9047など)
- 2.0 mlおよび1.5 mlマイクロチューブ
- ベンチトップクーラー(Agilent社製 Code 410109など)
- ディスポーザブルグローブ(パウダーフリーがよい)
- UV防護用具類
[機器]
- 45℃と55℃の温度設定ができるサーマルサイクラーまたはヒートブロック
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(製品コード TP350)など
- 卓上型微量遠心機(室温用も使用可)
- UVランプ
ハンディUVランプ、長波長365 nmタイプ(アズワン社製 Code 1-5479-01 LUV-4など)