DNAメチル化解析のコントロールに
- 各種DNAメチル化解析で、それぞれポジティブ／ネガティブコントロールDNAとして使用可能
- Methylatedタイプは、CpG Methylaseにより高度にメチル化されたHCT116 gDNA
- メチル基転移酵素ノックダウン株から調製したUnmethylatedタイプは極めて低いメチル化レベル
製品説明
DNAメチル化の解析は、近年注目を集めるエピジェネティクス解析の一領域であり、動物ではCpG配列のシトシンがメチル化されることが知られている。特に遺伝子プロモーター領域のCpGアイランドは、そのメチル化状態が遺伝子発現制御に関与している場合があり、主要な解析対象領域となっている。解析にはバイサルファイトシーケンスなど様々な手法が用いられている。
EpiScope Methylated HCT116 gDNA（製品コード 3522）は、HCT116細胞（Human colon cancer細胞株）由来のゲノムDNAをCpG methylaseを用いて高度にメチル化したものである。さまざまなDNAメチル化解析において、ポジティブコントロール（高メチル化DNA）として使用することができる。
EpiScope Unmethylated HCT116 DKO gDNA（製品コード 3521）は、DNMT1（DNA methyltransferase 1）とDNMT3B（DNA methytransferase 3B）をDouble knockoutしたHCT116 細胞由来のゲノムDNAであり、wild type HCT116細胞由来のゲノムDNAと比較してメチル化レベルは極めて低い（5％未満）*。本DNAは、さまざまなDNAメチル化解析においてネガティブコントロール（非メチル、低メチル化DNA）として使用することができる。
* ゲノムワイドなメチル化状態の比較結果であり、特定のゲノム領域においてはこれよりも高い割合でメチル化状態が維持される場合がある。
* 本製品は遺伝子改変したHCT116細胞株より調製したゲノムDNAのため、DNAメチル化状態の詳細は製品ロット毎に異なる場合がある。
用途
以下に示すような各種メチル化DNA解析手法の、ポジティブコントロール（高メチル化）ヒト由来DNA（製品コード 3522）またはネガティブコントロール（非メチル、低メチル化）ヒト由来DNA（製品コード 3521）として使用する。
- バイサルファイトシーケンス
- Combined Bisulfite Restriction Analysis (COBRA)
- Methylated CpG Island Recovery Assay など
保存
－20℃
濃度
100 ng/μl
形状
| 10 mM | Tris-HCl (pH8.0) |
| 1 mM | EDTA |
起源および調製法
EpiScope Methylated HCT116 gDNA：ヒトHCT116細胞から抽出・精製されたゲノムDNAをCpG methylase（M.Sss I）でメチル化し、フェノール／クロロホルム抽出およびエタノール沈殿により精製
EpiScope Unmethylated HCT116 DKO gDNA：ヒトDNMT DKO HCT 116細胞から抽出・精製したゲノムDNA
EpiScope Unmethylated HCT116 DKO gDNA：ヒトDNMT DKO HCT 116細胞から抽出・精製したゲノムDNA
品質管理データ
性能試験結果については、各ロットのCertificate of Analysis（CoA）をご覧ください。CoAはhttps://catalog.takara-bio.co.jp/search/doc_index.phpからダウンロードできます。
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