ThruPLEX Tag-Seq HVのワークフローは、同一チューブ(または同一ウェル)で行われる3つの簡単なステップで構成されており、操作途中での精製ステップやサンプルの移し替えの必要がない。本キットは、高いインプット容量(30 μl)、最大200 ngまでのサンプルの使用が可能なため、サンプルの濃縮が不要で、多様性の高いライブラリーの作製が可能である。
PCRとシーケンスエラーに起因する偽陽性のコールを減らすことができ、バリアントコールのあいまいさを排除することができる。
Panel A.イルミナプラットフォームで高品質なシーケンスが確保できるUMIを選択
Panel B.50 ng(紫色)と5 ng(緑色)のDNAインプット量で、UMI使用頻度が均一に得られるように濃度を最適化
Gene | Amino acid change | Expected allele frequency 0% | Expected allele frequency 1% | Expected allele frequency 5% | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|
EGFR | G719S | 0.0% | 0.0% | 1.4% | 1.5% | 6.2% | 5.9% |
EGFR | L858R | 0.0% | 0.0% | 1.0% | 1.6% | 5.5% | 6.1% |
EGFR | L861Q | 0.0% | 0.0% | 0.7% | 1.6% | 2.2% | 2.2% |
KRAS | G12D | 0.0% | 0.0% | 1.3% | 0.5% | 4.1% | 3.7% |
NRAS | Q61K | 0.0% | 0.0% | 2.9% | 1.9% | 6.3% | 4.8% |
PIK3CA | E545K | 0.0% | 0.0% | 0.4% | 1.0% | 4.2% | 6.3% |
Improvements to the ThruPLEX® HV kits
ThruPLEX® HV PLUS kitsと他社同タイプキットとの比較
Highly accurate detection of low-frequency variants using molecular tags
ThruPLEX® Tag-Seq HVのUMIから得たデータ解析方法(英語)
ThruPLEX® HV:FFPEサンプルから再現性の高いデータ、cfDNAから低頻度変異の確実な検出を可能に(英語)
ThruPLEX® HV:FFPEサンプルおよびcfDNAを簡便かつ正確に実施可能なソリューション(英語)
Rheonix NGS OnePrep™ SolutionによるThruPLEX® Tag-Seq HVライブラリー作製の自動化(英語)
マイナーアレル頻度(MAF)検出のためのシーケンスデプス(英語)
FFPE DNA、cfDNA解析用のライブラリー調製キット
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