SNP検出用リアルタイムPCRプライマー・プローブ合成

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特長

  • CycleavePCR法によるSNP解析に適したプライマー・プローブ設計
  • オンラインで簡単に設計、合成注文！配列などの詳細情報は注文前に確認可能
  • 目的遺伝子の塩基配列・検出対象塩基を指定するだけで、最大3種類の設計結果を表示

概要

CycleavePCR法（サイクリングプローブ法によるリアルタイムPCR）に最適なSNP(1塩基多型)検出用のプライマー・プローブ合成受託サービスです。タカラバイオの設計ノウハウを反映させたプログラムを搭載したシステムにより、目的遺伝子の塩基配列、検出対象塩基を指定するだけで、プライマー・プローブの設計ができます。設計後は、プライマー・プローブ配列などの詳細情報をオンライン上で確認でき、そのままシームレスに注文が可能です。

サービス内容

  • CycleavePCR Assay Designer (SNPs) について

    • ・オンラインで、SNP解析に適したプライマー・プローブを設計・注文
    CycleavePCR Assay Designer (SNPs) は、CycleavePCR法に適したSNP（1塩基多型）検出用プライマー・プローブを設計・オンライン注文するためのシステムです。目的遺伝子の塩基配列、検出対象塩基を指定するだけで、プライマー、プローブ候補を最大3種類設計します。
    ご使用されるリアルタイム装置の機種や使用目的に応じて、Allele 1とAllele 2の識別（2波長）、どちらか一方の識別（1波長）の2通りから、反応系を選択することができます。

    ・プライマー・プローブの情報を開示
    設計後は、プライマー・プローブの配列、位置、Tm値、増幅産物の大きさ、プローブの向きなどの情報を開示します。プライマー・プローブの詳細情報を確認した上で、ご希望のセットをご注文いただくことが可能です。

    ・反応条件の至適化作業が不要
    弊社のCycleavePCR Starter Kit（製品コード CY505S）またはCycleavePCR Reaction Mix （製品コード CY505A/B）の標準PCR反応条件に最適化されており、Mg2＋濃度やアニーリング温度など、PCR反応条件の至適化作業も不要です。

※あらかじめ、タイピングが明確な精製ゲノムDNAサンプル（Allele 1 homo、Allele 2 homo）を用い、対応するプローブのみで検出できるか確認することをお勧めします。
※本システムで得られるプライマー・プローブセットはSNP解析用として非常に高い特異性を得られる設計を行っておりますが、候補として提示されるプライマー・プローブは実験的な確認を行ったものではありませんので、反応性や特異性を保証するものではないことをご了承ください。設計可能であっても、CycleavePCRの性質上、実際には性能が充分でないケースもございます。 またその場合でも、合成したプライマー・プローブの代金はご請求させていただきます。

価格・納期

サービス項目参考価格参考納期
プライマー＆サイクリングプローブ（1プローブ） ￥36,0001セットあたり 約4週間
プライマー＆サイクリングプローブ（2プローブ） ￥66,0001セットあたり 約4週間

納品物

  • プライマー＆サイクリングプローブ（1プローブ）
    ・プライマー　2本（Forward、Reverse）
    HQ-SEQグレード（HPLC精製）、1 OD保証、濃度調整済みTE溶液品（50 μM）
    ・サイクリングプローブ　1本（クエンチャー：Eclipse、レポーター：FAM、HEX、ROXから選択＊1）
    HPLC精製、1 OD保証、濃度調整済みTE溶液品（50 μM；遮光チューブ）

  • プライマー＆サイクリングプローブ（2プローブ）
    ・プライマー　2本（Forward、Reverse）
    HQ-SEQグレード（HPLC精製）、1 OD保証、濃度調整済みTE溶液品（50 μM）
    ・サイクリングプローブ　2本（クエンチャー：Eclipse、レポーター：FAM、HEX、ROXから選択＊2）
    HPLC精製、1 OD保証、濃度調整済みTE溶液品（50 μM；遮光チューブ）

＊1 基本的には、FAM標識をお勧めします。
＊2 Thermal Cycler Dice Real Time Systemシリーズ（製品コードTP950、TP900：終売）、
　　　Smart Cycler II Systemでは、FAM標識/ROX標識の組み合わせをお勧めします。
　　　VIC標識の代替品としては、HEX標識をご使用ください。

ご注文方法

  • オンライン注文：
    CycleavePCR Assay Designer (SNPs)
    ユーザー登録後、条件を入力してプローブを設計し、設計結果をご確認の上、ご注文ください。
    オンライン注文ができない環境のお客様は、上記受託窓口へ直接お問い合わせください。

  • CycleavePCR Assay Designer（SNPs）による設計配列以外のご注文：
    以下のフォーマットにご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。

  • お見積りについてはこちら よりご依頼ください。
リアルタイムPCR関連実験の各種手法をホームページでご紹介しています。あわせてご参照ください。
　

ご留意事項

・ お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

関連製品・受託

キメラプローブ合成
SNPタイピング（ビーズアレイ）
リアルタイムPCR用プライマー・プローブ合成（サイクリングプローブ）

注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
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