製品説明
本酵素は、隣接したDNA鎖の5’-P末端と3’-OH末端をホスホジエステル結合で連結する酵素である。補酵素としてATPを要求し、反応の中間体としてEnzyme-ATP complexが作られ、これがDNAに作用する。本酵素は突出末端どうしでも、平滑末端どうしでも連結できる。また、DNAとRNA、RNAどうしもわずかに連結できる。
保存
-20℃
濃度
350 U/μl
形状
10 mM | Tris-HCl(pH7.5) |
50 mM | KCl |
1 mM | DTT |
0.1 mM | EDTA |
50% | グリセロール |
添付Buffer組成(10×)
660 mM | Tris-HCl(pH7.6) |
66 mM | MgCl2 |
100 mM | DTT |
1 mM | ATP |
活性の定義
6 μg/20 μlのλDNA-
Hind III分解物を、16℃で約30分間に90%以上ライゲーションさせる酵素活性を1 Uとする。
本酵素の1 Uは、ATP-PPi交換反応における0.008 Weiss Unitに相当する。
Weiss Unit反応液組成:
66 mM |
Tris-HCl(pH7.6) |
6.6 mM |
MgCl2 |
10 mM |
DTT |
66 μM |
ATP |
3.3 μM |
[32P] Na4P2O7 |
活性測定用反応液組成
66 mM | Tris-HCl緩衝液(pH7.6) |
6.6 mM | MgCl2 |
10 mM | DTT |
0.1 mM | ATP |
6 μg/20 μl | λDNA-Hind III分解物 |
品質管理データ
使用上の注意
ライゲーション反応は、末端塩基配列の違いにより、反応速度が異なる。一般に次のような傾向がある。
突出末端 |
: |
Hind III>Pst I>EcoR I>BamH I>Sal I |
(Hind III siteはSal I siteより10~40倍速くライゲーションされる) |
平滑末端 |
: |
Hae III>Alu I>Hinc II>Sma I |
(Hae III siteはSma I siteより5~10倍速くライゲーションされる) |
| | EcoR V>Sca I>Pvu II>Nru I |
用途
- インサートDNAとベクターDNAとの連結
- DNA断片とリンカーあるいはアダプターDNAとの連結
起源
Escherichia coli carrying the plasmid that encodes the gene of T4 DNA ligase
一般的性質
- 分子量
約62,000
- サブユニット
シングルポリペプチド
- 至適pH
pH7.6(pH7.2~7.8、Tris-HCl)
(pH6.9で46%、pH8.0で65%に活性低下)
- 補因子
ATP
- 活性化剤
二価カチオン |
: |
Mg2+(至適濃度:10 mM) |
還 元 剤 |
: |
DTT、2-メルカプトエタノール (2-メルカプトエタノールの方が効果大) |
- 阻害剤
dATP(拮抗阻害剤)
高濃度一価カチオン |
: |
200 mM Na+、200 mM K+ (ただし、この濃度において10%ポリエチレングリコール(PEG)#6000存在下では逆に活性化作用を示す) |
多 糖 類 |
: |
ヘパリン、カラギナン |