製品説明
NucleoSpin Microbial DNAは、グラム陰性菌、グラム陽性菌、酵母、糸状菌などの微生物から高純度にゲノムDNAを抽出、精製するキットである。本製品の操作は、まず、製品に含まれるMN Bead Tubes Type B中のガラスビーズを用いてProteinase Kの存在下で試料を破砕する。この際には一般的な細胞破砕装置を使用することができる。Proteinase Kが含まれているため、新たに菌体溶解酵素を準備する必要はなく、1回の処理で様々な微生物サンプルを破砕することができる。菌体破砕後は、カオトロピック塩の存在下でDNAをカラムに吸着させ、2回の洗浄後、ゲノムDNAを溶出する。迅速、シンプルな操作で、収率良くゲノムDNAを得ることができる。
MN Bead Tubesは、サンプルの種類に適したものを使用する。グラム陰性菌、グラム陽性菌にはキットに含まれるMN Bead Tubes Type B(別売:製品コード 740812.50)がそのまま使用できる。酵母、糸状菌にはMN Bead Tubes Type C(製品コード 740813.50)、土壌、堆積物サンプルにはMN Bead Tubes Type A(製品コード 740786.50)が別途必要である。
(注)本製品の使用には撹拌式細胞破砕装置が必要です。
原理 |
シリカメンブレン法 |
形状 |
ミニスピンカラム |
サンプル量 |
<40 mg 湿菌体 |
精製サイズ |
200 bp~約50 kb |
回収量 |
5~25 μg(30 mg 湿菌体) サンプルの種類、破砕方法に依存 |
A260/280 |
1.6~2.0 |
溶出液量 |
100~200 μl |
精製時間 |
35分 |
結合容量 |
60 μg |
内容
NucleoSpin Microbial DNA(製品コード 740235.10/.50)
・Lysis Buffer MG
・Wash Buffer BW
・Wash Buffer B5 (Concentrate)
・Elution Buffer BE*1
・Liquid Proteinase K
・MN Bead Tubes Type B
・NucleoSpin Microbial DNA Columns
・Collection Tubes (2 ml)
*1 組成:5 mM Tris-HCl, pH8.5
MN Bead Tubes Type A(製品コード 740786.50)*2
・0.6~0.8 mm ceramic beads/2 ml Tube
推奨サンプル:土壌、堆積物
*2 NucleoSpin Soil(製品コード 740780.10/.50/.250)に含まれるものと同じ
MN Bead Tubes Type B(製品コード 740812.50)*3
・40~400 μm glass beads/2 ml Tube
推奨サンプル:グラム陽性菌、グラム陰性菌
*3 NucleoSpin Microbial DNA(製品コード 740235.10/.50)に含まれるものと同じ
MN Bead Tubes Type C(製品コード 740813.50)*4
・1~3 mm corundum/2 ml Tube
推奨サンプル:酵母、糸状菌
*4 NucleoSpin DNA Yeast(製品コード 740236.10/.50)に含まれるものと同じ
保存
室温
操作手順
用途
- 微生物培養サンプルからの全DNA精製
- 精製DNAはPCR、qPCR、サザンブロッティング、酵素反応などに利用可能
本製品以外に必要な試薬、機器(主なもの)
試薬
96~100%エタノール
器具
・1.5 mlマイクロ遠心チューブ
・ピペットチップ(滅菌済)
・ピペット
・微量高速遠心機
・推奨細胞破砕装置:
Vortex-Genie 2 (サイエンティフィックインダストリーズ社)+MN Bead Tube Holder(製品コード 740469)
撹拌式細胞破砕装置(Retsch社NM200など)
MN Bead Tube Holder(製品コード 740469)
この製品の使用方法は
こちらをご覧ください。
使用可能な細胞破砕装置(例)
・Schwingmühle MM200, MM300, MM400 (Veder Scientific社)
・FastPrep System (MP-Biomedicals社)
・Precellys (Bertin Technologies社)
・MagNa Lyser (Roche社)
・TissueLyser II and Tissue Lyser LT (QIAGEN社)
・Bullet Blender (Next Advance社)
・Mini-Beadbeater (Biospec Products社)
・Speed Mill (Analytik Jena社)
・Vortex Adapter for Vortex-Genie 2 X (MoBio社)
様々な微生物からの抽出例
図1.微生物サンプルからのDNA抽出
NucleoSpin Microbial DNA KitとMN Bead Tubes Type B(キットに含まれる)、またはMN Bead Tubes Type C(別売)を用いて様々な微生物サンプルからゲノムDNAを抽出した。
抽出DNA各100 ngをアガロースゲル電気泳動で調べた結果、全てのサンプルでRNAの混入やDNAの分解のない高分子のゲノムDNAが確認された。
1.
Escherichia coli, MN Bead Tubes Type B
2.
Vibrio fischerii, MN Bead Tubes Type B
3.
Bacillus subtilis, MN Bead Tubes Type B
4.
Corynebacterium glutamicum, MN Bead Tubes Type B
5.
Saccharomyces cerevisiae, MN Bead Tubes Type C
NucleoSpin Microbial DNAで使用実績のある微生物
Microorganisms |
Tested by |
Acinetobacter |
Customer |
Aspergillus spec. |
MN |
Bacillus subtilis |
Customer |
Clostridium ljungdahlii |
Customer |
Corynebacterium glutamicum |
MN |
Escherichia coli |
MN |
Eurotium spec. |
Customer |
Klebsiella pneumoniae |
Customer |
Microbacterium spec. |
Customer |
Pichia pastoris |
Customer |
Pseudomonas aeruginosa |
Customer |
Rhizopus spec. |
MN |
Saccharomyces cerevisiae |
MN |
Staphylococcus pneumoniae |
Customer |
Streptococcus pneumonieae |
Customer |
Trametec spec. |
Customer |
Vibrio fischerii |
MN |
MN:マッハライ・ナーゲル社でテストした菌株種
Customer:ユーザー様よりご報告のあった菌株種
NucleoSpinはマッハライ・ナーゲル社の登録商標です。