本製品はThermo Fisher Scientific社が推奨する実験条件に最適化されたGeneChip専用製品である。
Thermo Fisher Scientific社では、同社のGeneChip Human Mapping 250K/500K Array Setと同様に、Genome-Wide Human SNP Array 5.0/6.0 SetにもTitanium Taq DNAポリメラーゼの使用を選択した。これら最先端の一塩基多型(SNP; Single Nucleotide Polymorphism)ジェノタイピングシステムのために、Thermo Fisher Scientific社では安定した高収量と品質に基づきClontechのTitanium Taq DNA Polymeraseを推奨している。(図1)
Titanium DNA Amplification Kitは、Thermo Fisher Scientific社の研究者と共同で、GeneChip Mapping 250K/500K Array、ならびにGenome-Wide Human SNP Array 5.0/6.0のために特別に設計された。本キット(製品コード 639240、639243)には、それぞれ300回および400回のPCRを行うために十分な試薬が含まれている。
300回用キットは2チップ仕様(NspアレイとStyアレイが別々に存在)の Mapping Arrayに対応し、Mapping 500K Array Setを用いて96ゲノムDNAサンプルのスクリーニングが可能である。また、300回用キットと400回用キットはともにシングルチップ仕様のSNP Arrayに使用でき、SNP Array 5.0あるいは6.0 Setを用いて48ゲノムDNAサンプルのスクリーニングが可能である。質、量ともに最高レベルのSNPジェノタイピング研究を行うために、強力なAffymetrix SNP Array技術とClontechのTitanium DNA Amplification Kitを併用してください。
* 本製品は、Thermo Fisher Scientific社のGeneChip Mapping ArrayまたはAffymetrix Genome-Wide Human SNP Array 5.0/6.0のための専用製品である。
Titanium Taq DNA Polymerase
Titanium DNA Amplification Kitで使用するTitanium Taq DNA Polymeraseは、5’-エキソヌクレアーゼ活性を取り除いたTaqポリメラーゼであり、TaqStart Antibodyが組み込まれたホットスタートPCR酵素である。キットには最適化したバッファー(MgCl2を含む)、高純度dNTP Mix、独自のGC-Melt Reagentが含まれている。GC-Meltには、GCリッチな領域や高次構造を取る領域を増幅する際に特異性と収量を改善する効果がある。
パフォーマンスの確認
Titanium DNA Amplification KitはClontechの高い品質基準に合格しているだけではなく、Thermo Fisher Scientific社の研究者によって、Mapping 250K/500K ArrayならびにSNP Array 5.0/6.0 Setで適切に機能することが確認されている。
この特別な確認作業により、Titaniumによる増幅工程がジェノタイピングの成功の妨げになることは決してない。
図1. PCR増幅産物の電気泳動例
2%アガロースゲルを用いて、120Vで1時間泳動。増幅産物は250 bpから1,100 bp付近に分布 内容
Titanium DNA Amplification Kit
(製品コード 639240、639243)
・Titanium Taq DNA Polymerase Mix
・10× Titanium Taq PCR Buffer
・dNTP Mixture
・GC-Melt Reagent
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