ThruPLEX® DNA-Seq Kit

簡単操作、微量(50 pg)対応の、ChIP-seqに最適なDNAライブラリー調製キット
  • 微量DNAサンプル(50 pg~50 ng)から、イルミナ社NGS装置用ライブラリーを作製
  • 1チューブ、2時間の調製時間、3 stepの迅速でシンプルなワークフロー
  • サンプルが微量なケースが多いChIP-seqに最適
  • 主要なTarget Enrichmentプラットフォームに対応
    -Agilent SureSelect、Roche NimbleGen SeqCap EZ、IDT xGen Lockdown Probes等
初めてお使いになる方を対象に、お試しモニターを募集しています。
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製品コード メーカー
略称
製品名 容量 価格(税別)
キャンペーン価格
特記事項 説明書、CoA
データシート
ベクター情報
参考資料 カート
Takara Code
R400674

CLN

Clontech
ThruPLEX® DNA-Seq Kit
クロマチン構造解析に! NGS関連 -DNAシーケンス編- ライセンス
24回 ¥104,000
¥83,200
2020/11/16~
2021/03/31

説明書・データシート・ベクター情報
RB4674
R400675

CLN

Clontech
ThruPLEX® DNA-Seq Kit
クロマチン構造解析に! NGS関連 -DNAシーケンス編- ライセンス
48回 ¥198,000
¥158,400
2020/11/16~
2021/03/31

説明書・データシート・ベクター情報
RB4675
R400676

CLN

Clontech
ThruPLEX® DNA-Seq Kit
クロマチン構造解析に! NGS関連 -DNAシーケンス編- ライセンス
96回 ¥364,000
¥291,200
2020/11/16~
2021/03/31

説明書・データシート・ベクター情報
RB4676
R400677

CLN

Clontech
ThruPLEX® DNA-Seq Kit
クロマチン構造解析に! NGS関連 -DNAシーケンス編- ライセンス
480回 ¥1,610,000
¥1,288,000
2020/11/16~
2021/03/31

説明書・データシート・ベクター情報
RB4677
※色文字での表示は、キャンペーン価格およびそのキャンペーン期間です。
※ 製品名の「SMARTer」はなくなりましたが、製品コード、価格、仕様等については変更ありません。
プロトコール:SureSelect XTとの組合せ
プロトコール:SeqCap EZとの組合せ
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製品説明

ThruPLEX DNA-Seq Kit
ThruPLEX DNA-Seq Kitは、ThruPLEXケミストリーを用いて、わずか50 pgの微量DNAからduplicate率が少なく、多様性の高いNGS用ライブラリーを作製するキットである。キットはマルチプレックスシーケンスに対応した384種類までのインデックスに対応しており、ゲノムDNA、生体液由来cell-free DNA、FFPE DNAやcDNAなどが利用でき、断片化dsDNAもサンプルとして使用可能である。
本キットの操作には、精製やサンプル移し替えのステップは不要で、同一チューブ、または同一ウェル内で連続反応を行うことができ、操作は約2時間で完了する。
さらに、RNA-Seq、ChIP-Seqを含む様々なDNA-Seqに利用でき、主要なTarget Enrichmentプラットフォームにも対応している。
本キットにはインデックスが含まれていないため、DNA Index Kitを別途購入する必要がある。
PCR産物をサンプルとして使用する場合は、5'リン酸化プライマーを用いてPCRを行ってください。
ThruPLEX DNA-Seq Kitの1チューブワークフロー
図1. ThruPLEX DNA-Seq Kitの1チューブワークフロー

ThruPLEX DNA-Seq Kitのワークフローは、エンドリペア、アダプターライゲーション、ライブラリー増幅の3ステップで構成されており、わずか50 pgの二本鎖DNA/cDNAから、インデックスが付加されたライブラリーを調製できる。全操作は1チューブ内で行えるため、サンプルロスを防ぎ、約2時間でライブラリー作製が完了する。

ThruPLEX DNA-Seq Kitのテクノロジー
図2.ThruPLEX DNA-Seq Kitのテクノロジー
Step 1:断片化二本鎖DNA(50 pg~50 ng)のエンドリペア
Step 2:Stem-LoopアダプターのBlunt-endライゲーション
Stem-Loopアダプターは5’末端がブロックされており一本鎖部分がないためアダプター同士のアニーリングやライゲーションは起こらず、バックグラウンドを抑えることができる。
Step 3:ライブラリー増幅
ライゲーション後にStem-Loopアダプターを切断することによってバックグラウンドを抑え、正確性の高いライブラリー増幅を行うことができる。
ライブラリーの多様性とduplicateの割合
図3.ライブラリーの多様性とduplicateの割合

各社ライブラリー作製キットを用いてライブラリーを作製し、MiSeq v3 Reagent Kitを用いてライブラリーの多様性とduplicateの割合を比較した。ThruPLEX DNA-Seq Kitは少ないinput量からライブラリーが作製でき、多様性が高く(左図)、duplicateの割合も低かった(右図)。

GCカバー率の比較
図4.GCカバー率の比較

各社ライブラリー作製キットを用いてヒトゲノムDNA 50 ngよりライブラリーを作製しGCカバー率を調べた。ThruPLEX DNA-Seq Kit(左図)は広い範囲で優れたGCカバー率を示した(右図)。赤の縦線はヒトゲノムDNAのGC含量分布を示している。

内容

ThruPLEX DNA-Seq Kit(製品コード R400674)
Template Preparation D Buffer
Template Preparation D Enzyme
Library Synthesis D Buffer
Library Synthesis D Enzyme
Library Amplification D Buffer
Library Amplification Enzyme
Nuclease-Free Water

保存

-20℃

本製品以外に必要な試薬等

  • サーマルサイクラー (リアルタイムPCR用も可)
  • 遠心機
  • 96 well PCR プレートまたは PCRチューブ
  • 1.5 ml 低吸着マイクロチューブ (USA Scientific社, Code 1415-2600)
  • PCRプレートシール
  • シングルチャンネルピペット:10 μl、20 μl、200 μl
  • 8連チャンネルピペット: 20 μl、200 μl
  • フィルターピペットチップ:10 μl、20 μl、200 μl
  • TE buffer (10 mM Tris-HCl (pH 8.0)、0.1 mM EDTA)
  • 80% (v/v) エタノール(用時調製)
  • Magnetic Separator
  • Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter社, Code A63880)
注意事項
  • 本ページの製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
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