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ThruPLEX DNA-Seq Kitのワークフローは、エンドリペア、アダプターライゲーション、ライブラリー増幅の3ステップで構成されており、わずか50 pgの二本鎖DNA/cDNAから、インデックスが付加されたライブラリーを調製できる。全操作は1チューブ内で行えるため、サンプルロスを防ぎ、約2時間でライブラリー作製が完了する。
各社ライブラリー作製キットを用いてライブラリーを作製し、MiSeq v3 Reagent Kitを用いてライブラリーの多様性とduplicateの割合を比較した。ThruPLEX DNA-Seq Kitは少ないinput量からライブラリーが作製でき、多様性が高く(左図)、duplicateの割合も低かった(右図)。
各社ライブラリー作製キットを用いてヒトゲノムDNA 50 ngよりライブラリーを作製しGCカバー率を調べた。ThruPLEX DNA-Seq Kit(左図)は広い範囲で優れたGCカバー率を示した(右図)。赤の縦線はヒトゲノムDNAのGC含量分布を示している。
【ユーザー様実施例】 ThruPLEX DNA-Seq Kitを使用した出芽酵母のDMS-Seq解析
【ユーザー様実施例】ThruPLEX® DNA-Seq Kitを使用したネッタイツメガエル初期胚で発現する発生制御因子に対するChIP-Seq解析手法の確立
【ユーザー様実施例】ThruPLEX® を用いた血漿中セルフリーDNA(cfDNA)のシーケンス解析
DNA-seq from FFPE DNA samples
Low cell number ChIP-seq
Shearing low-volume DNA samples
Low-input whole-exome sequencing
ショットガンメタゲノム解析とメタトランスクリプトーム解析(英語)
イルミナ社Nextera® Rapid Captureを用いたThruPLEXターゲット濃縮プロトコル(英語)
Roche NimbleGen社SeqCap EZを用いたThruPLEXターゲット濃縮プロトコル(英語)
IDT社xGen panelsを用いたThruPLEXターゲット濃縮プロトコル(英語)
Agilent社SureSelectXTを用いたThruPLEXターゲット濃縮プロトコル(英語)
Agilent社SureSelectXT2を用いたThruPLEXターゲット濃縮プロトコル(英語)
Agilent社SureSelectQXTを用いたThruPLEXターゲット濃縮プロトコル(英語)
がんゲノミクスとエピゲノミクス(英語)
がんにおけるHLAタイピング(英語)