製品説明
	PrimeSTAR LongSeq DNA Polymeraseは、世界最高クラスの高い特異性を持つPCR酵素です。本製品はこの高い特異性により、非特異的増幅を抑制した50 kb以上の超長鎖増幅が可能であり、長鎖のGC/ATリッチなどの難配列も良好に増幅することができます。これらの特長により、従来は困難であった長鎖のマルチプレックスPCR反応を行うことができます。さらに高い正確性も併せ持つため、ロングリードシーケンスでの鋳型増幅に最適です。
本製品は、全てのコンポーネント(酵素、バッファー、dNTP Mixture等)が含まれている2×プレミックスタイプであり、-20℃で凍結しないため融解の手間がなく、直ちにプライマーと鋳型を加えて再現性の高いPCRを行うことができます。
なお、本製品に含まれる酵素は常温下でのDNA Polymerase活性および3’→5’exonuclease活性を抑えるモノクローナル抗体を添加したホットスタート用PCR酵素です。
本製品を用いる場合のプライマー設計に関しては、
こちらをご確認ください。
内容
	R055A(200回、50 μl反応系)
PrimeSTAR LongSeq Premix (2×)  1 ml×5
R055S(40回、50 μl反応系)
PrimeSTAR LongSeq Premix (2×)  1 ml
		保存
	-20℃
注)使用前には激しい攪拌を避け、転倒混和後スピンダウンしてください。
		PCR条件
	
|  | 使用量 | 最終濃度 | 
| PrimeSTAR LongSeq Premix (2×) | 25 μl | 1× | 
| Primer1 | 10 pmol | 0.2 μM*1 | 
| Primer2 | 10 pmol | 0.2 μM*1 | 
| Template | 推奨鋳型量を参照 |  | 
| 滅菌精製水 | up to 50 μl |  | 
【推奨鋳型量】
ヒトゲノムDNA      10~500 ng
大腸菌ゲノムDNA     100 pg~200 ng
プラスミドDNA      10 pg~10 ng
逆転写産物(cDNA)    25~750 ng
| 94℃ ↓
 98℃
 55~67℃*3
 68℃
 | 
 | 1 min.*2 
 10~20 sec.
 15 sec.
 20~30 sec./kb
 |  | 
 30~40 cycles
 | 
もしくは
| 98℃ 68℃
 | 
 | 10~20 sec. 20~30 sec./kb
 |  | 30~40 cycles | 
*1 マルチプレックスPCRを実施する場合には各プライマーの終濃度が0.2 μMとなるように調製し、適宜プライマー濃度を調整することを推奨します。
*2 増幅領域がGC richの場合や長鎖ターゲットの増幅を行う場合には、94℃、1 min.の初期変性を行うことを推奨します。
*3 アニーリングの温度はプライマーのTm値より5℃以上下げた温度を設定してください。
注1) イノシンを含むプライマーの使用は避けてください。
注2) 過剰なEDTAの持ち込みは避けてください。
注3) 鋳型やプライマーの希釈には、TE buffer(10 mM Tris-HCl, 0.1 mM EDTA)または滅菌精製水を推奨します。
PCR条件の選択
- プライマーは可能な限り、35 mer程度(Tm値>70℃)を強く推奨します。
- Tm値が70℃以下の場合はプライマーのTm値より5℃以上下げたアニーリング温度を用いた3 Step PCRにより、良好な増幅が得られることがあります。
- マルチプレックスPCRでは、プライマーのTm値を合わせるように設計することを推奨します。
- プライマーの3’末端塩基にホスホロチオエート修飾塩基を用いることで良好な増幅が得られることがあります。
 		実験例
	(1)増幅鎖長
PrimeSTAR LongSeq DNA Polymerase(製品コード R055S/A/B)は優れた伸長性を有し、一般にHigh Fidelity PCR酵素では増幅しづらい長鎖の鋳型DNAにおいても、超長鎖(53 kb)まで特異性高く増幅が可能です。
鋳型:ヒトゲノムDNA(100 ng/50 μl反応系)
  | 1. p53 | 0.5 kb | 
  | 2. DCLRE1A | 1 kb | 
  | 3. DCLRE1A | 2 kb | 
  | 4. DCLRE1A | 4 kb | 
  | 5. β-globin | 15 kb | 
  | 6. β-globin | 24 kb | 
  | 7. β-globin | 30 kb | 
  | 8. HBB | 40 kb | 
  | 9. SLC30A9 | 53 kb | 
  | M1. 1 kb DNA Ladder |  | 
   
  
  
| PCR条件: 94℃
 ↓
 98℃
 55℃
 68℃
 | 
 | 1 min.
 
 10 sec.
 15 sec.
 30 sec./kb
 |  | 
 
 30 cycles
 | 
   
 
Clontech PCR Thermal Cycler GP(製品コード WN400)使用
(2)GCリッチ・ATリッチターゲットの増幅
非特異的な増幅が起こりやすいGC rich・AT richな鋳型においても、PrimeSTAR LongSeq DNA Polymerase(製品コード R055S/A/B)では、特別なバッファーや反応条件を設定することなく長鎖増幅が可能です。
鋳型:ヒトゲノムDNA(100 ng/50 μl反応系)
   
1. 17 kb(GC含量 66%)
2. 20 kb(GC含量 65%)
3. 16 kb(AT含量 66%)
4. 21 kb(AT含量 65%)
M1. 1 kb DNA Ladder
  
  
| PCR条件: 94℃
 ↓
 98℃
 68℃
 | 
 | 1 min.
 
 10 sec.
 30 sec./kb
 |  | 
 
 30 cycles
 | 
   
 
Clontech PCR Thermal Cycler GP(製品コード WN400)使用