微生物群のゲノム/遺伝子情報を網羅的に解析

メタゲノム解析

■お問い合わせ窓口(A)

TEL:077-565-6999


[サンプル送付先]
タカラバイオ株式会社 CDMセンター 遺伝子工学研究/検査 受託受付担当 宛て
〒525-0058 滋賀県草津市野路東七丁目4番38号
TEL:077-567-9262
ご注意:伝票の品名に受託名をご記載ください。 お問い合わせフォームは こちら

特長

  • 次世代シーケンサーを用いたメタゲノムのショットガンシーケンス
  • 菌種組成および菌叢の持つ機能を解明
  • 凍結細菌叢、糞便等様々なサンプルからのDNA抽出にも対応可能

概要

メタゲノム解析は、環境サンプルから直接回収されたゲノムDNAを網羅的に解析することにより、菌種組成や菌叢の持つ機能を解明できる新しい手法として注目されています。16S rRNA領域のみを対象とする16S rRNA PCRサンプルの解析(細菌叢解析)とは違い、全ゲノム配列を対象とするため、より精度の高い菌種組成の解明が可能であり、また16S rRNA PCRサンプルの解析(細菌叢解析)では難しかった、菌叢の持つ機能を解明することも可能です。

・作業の流れ

サービス内容

メタゲノムDNAからショットガンライブラリーを作製後、Illuminaシーケンサーを用いてシーケンスデータを取得します。取得したリードについて、データベース配列へマッピングすることで、菌種組成および菌叢の持つ代謝機能を明らかにします。

・納品データ例
<系統分類>


<機能解析>
■チラシをご覧ください。
細菌叢・メタゲノム解析サービス

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 系統分類・機能解析結果一式

ご注文方法

  • 依頼書作成とFAX連絡
    • 高速シーケンス解析依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
    • 依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    • サンプル送付の前に、記入済み依頼書をFAXでご送付ください。
  • サンプル送付
    • 解析サンプルならびに依頼書を上記サンプル送付先へご送付ください。
    • サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、-20℃の冷凍便で平日午前着指定でご送付ください。
      また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

以下のフォーマットにご記入のうえ、依頼書記載のFAX番号へご送付ください。

受入サンプル

  • 生体サンプル等

    サンプル量 温度
    糞便 目安:200 mg程度 冷凍
    細菌細胞 1×108 cells 冷凍
    採取・送付方法について事前にお問い合せください。


  • ゲノムDNA
    以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

    サンプル量 濃度 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    ゲノムDNA 100 ng以上 10 ng/μl以上 1.6以上

    上記基準に満たない場合や土壌などの環境サンプルの場合は、別途お問い合わせください。
    DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
    電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。

ご留意事項

供与核酸の品質によっては再提供をお願いすることがあります。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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