特長
- ゲノムワイドなシーケンスにより、トランスジーン位置を網羅的に解析
- トランスジェニック動物やノックイン細胞の解析に
概要
ウイルスベクターを用いて製作されたiPS細胞の安全性評価、トランスジェニックマウスのトランスジーン挿入位置同定による品質確認、CHO細胞のトランスジーン挿入位置同定による生産性評価、モバイルエレメントの挿入位置同定による育種研究などに有効です。
サービス内容
- 全ゲノムシーケンスを用いた方法
350 bp程度にランダムに断片化したゲノムDNAからライブラリーを調製し、イルミナ社シーケンサーを用いて全ゲノムシーケンスを実施いたします。取得したデータは挿入配列と参照ゲノム配列へマッピングし、両方にマッピングされたリード情報（Discordant reads [d]）およびブレイクポイントをまたぐリード情報（Split reads [s]）から挿入位置を検出、挿入位置の情報を納品いたします。
価格・納期
ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。
納品物
- 作業報告書
- シーケンスデータ一式
- 挿入位置候補リスト、挿入図、マッピング結果等
トランスジーン挿入図
ご注文方法
- 依頼書作成とFAX連絡
- 高速シーケンス解析依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
- 依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
- サンプル送付の前に、記入済み依頼書をFAXでご送付ください。
- サンプル送付
- 解析サンプルならびに依頼書を上記サンプル送付先へご送付ください。
- サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、－20℃の冷凍便で平日午前着指定でご送付ください。
また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
以下のフォーマットにご記入のうえ、依頼書記載のFAX番号へご送付ください。
受入サンプル
- 参照ゲノム配列や挿入遺伝子配列情報
- ゲノムDNA
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
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サンプル量 |
濃度 |
純度 |
| OD260/OD280 |
OD260/OD230 |
| ゲノムDNA |
2 μg以上 |
40 ng/μl以上 |
1.6以上 |
| ・ |
DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer：10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。 |
| ・ |
電気泳動（1％ゲル）にて10～20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。 |
| ・ |
上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。 |
ご留意事項
| ・ |
供与核酸の品質によっては再提供をお願いすることがあります。 |
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ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
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お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
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