Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast (800)

日本薬局方収載プライマーによるPCR産物のシーケンス解析で細菌を推定（16S rDNA領域の約0.8 kb）

＊合わせてパンフレットもご覧ください
製品コード メーカー
略称		 製品名 容量 価格（税別） 特記事項 説明書、CoA
データシート
ベクター情報		 参考資料 カート
Takara Code
RR182A

TKR

タカラバイオ（株）
 Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast (800)
50回 ￥62,000
 説明書・データシート・ベクター情報 個
RR182A
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製品説明

本製品は、細菌類の16S ribosomal DNA（rDNA）領域内の特定領域（約0.8 kb）を増幅することができる試薬、およびPCR増幅産物のシーケンスのためのプライマーから成るキットです。本製品を使用して得られた増幅産物に対して、キットのシーケンスプライマーを用いた塩基配列解析を行い、得られた塩基配列とデータベース上の配列との相同検索により、細菌の分類を行うことができます。PCR酵素には改良型Taq DNA polymeraseを使用してるので、高速PCR条件により、PCR増幅を迅速に行うことができます。また、本酵素は抗体を用いたホットスタートPCR用の酵素なので、サイクル前のミスプライミングやプライマーダイマーに由来する非特異的増幅を防ぐことができます。

※本製品のプライマーを用いる解析方法は、第十八改正日本薬局方 参考情報「遺伝子解析による微生物の迅速同定法」に収載されています。
注意： 本製品は、細菌の種類によってはPCR増幅できない場合があります。
なお、真菌の場合は、Fungal rDNA (ITS1) PCR Kit Fast（製品コード RR183A）、または、Fungal rDNA (D1/D2) PCR Kit Fast（製品コード RR184A）をご利用ください。

内容

（50回分、25 μl PCR反応系）
①TaKaRa Taq HS Fast Detect Premix2×625 μl
②16S rDNA Primer Mix (800)＊110×125 μl
③dH2O650 μl
④Positive Control（E. coli DNA）1 ng/μl25 μl
⑤Sequencing Primer 10F7.5 pmol/μl50 μl
⑥Sequencing Primer 800R7.5 pmol/μl50 μl

*1 16S rDNA Primer Mix (800) に含まれるプライマーは、Sequencing Primer 10FおよびSequencing Primer 800Rと同じ配列です。

保存

－20℃
TaKaRa Taq HS Fast Detect PremixにはPCR酵素が含まれているため、過剰に凍結融解を繰り返すと活性が低下する場合がありますのでご注意ください。
融解の際は激しい攪拌を避け、融解後は穏やかにチューブを転倒混和してください。

DNA増幅産物のシーケンス解析

本製品に含まれるSequencing Primer 10Fを使用して、得られた精製増幅産物のシーケンス解析（片鎖解析）を行う。
必要に応じて、Sequencing Primer 800Rを使用した両鎖解析を行う。両鎖解析の場合、精度の高いシーケンスデータが得られる。
※ 本製品のシーケンス用プライマーは7.5 pmol/μlとなっていますので、適宜使用量を調整してご使用ください。

塩基配列情報の解析

得られた塩基配列情報をデータベース上の配列と相同性検索を行い、その結果より細菌の種類を類推します。
＜参考情報＞
BLAST 検索は、BLAST アルゴリズムを実装したプログラムをダウンロードして利用することができます。
　NCBI：https://ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI BLASTやDDBJのウェブ上で使用することもできます。
　NCBI BLAST：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
　https://www.ddbj.nig.ac.jp/services/blast.html

本製品以外に必要な試薬、器具、機器（主なもの）

  1. 遺伝子増幅システム（authorized instruments）
    Clontech PCR Thermal Cycler GP（製品コード WN400）
    TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch（製品コード TP350：終売）
    TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient（製品コード TP600：終売）
  2. PCRチューブ＊
    0.2 ml Hi-Tube Dome Cap（製品コード NJ200）
    0.2 ml Hi-8-Tube（製品コード NJ300）
    0.2 ml Hi-8-Dome Cap（製品コード NJ301）
    0.2 ml Hi-8-Flat Cap（製品コード NJ302）
    ＊TaKaRa PCR Thermal Cycler Fast（販売終了）には、Flat Cap型のチューブをご使用ください。 Dome Cap型のチューブは使用できません。詳細は、各装置の取扱説明書をご確認ください。
  3. アガロース電気泳動装置
    Mupid-2plus（製品コード M-2P）
    Mupid-exU（製品コード EXU-1）
    Mupid-One（製品コード O1-01）
  4. アガロースゲル Agarose L03「TAKARA」（製品コード 5003/5003B）
    PrimeGel Agarose PCR-Sieve（製品コード 5810A）など
  5. DNA染色剤
    SYBR Green I Nucleic Acid Gel Stain（製品コード 5760A/5761A）
    エチジウムブロマイドなど
    注）SYBR Green Iを使用する場合は専用のフィルターが必要です。
  6. マイクロ遠心機
  7. マイクロピペットおよびチップ（オートクレーブ処理したもの）
  8. DNA調製試薬
    SimplePrep reagent for DNA（製品コード 9180）
    NucleoSpin Tissue（製品コード 740952.10/.50/.250）など
  9. PCR産物精製試薬
    NucleoSpin Gel and PCR Clean-up（製品コード 740609.10/.50/.250）など

遺伝子検出・検査　関連試薬の選択フローをご利用ください

分野別の試薬選択フロー
手法別の試薬選択フロー

「遺伝子検査（食品・水質・家畜他）」関連のお役立ち情報専用ページもご参照ください。

微生物推定

関連製品・受託

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Fungal rDNA (ITS1) PCR Kit Fast
Fungal rDNA (D1/D2) PCR Kit Fast
MightyPrep reagent for DNA
SimplePrep™ reagent for DNA
NucleoSpin® Tissue
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up
プレミックスシーケンス解析（8連チューブ／96ウェルプレート）
Clontech PCR Thermal Cycler GP

注意事項
  • 本ページの製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
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