ATAC-Seq解析

組織や未固定の培養細胞をご提供いただき、Active Motif社で解析を行います。Transposomeを用いてオープンクロマチン領域を特異的に濃縮したライブラリー作製を行い、シーケンスします。取得したシーケンスデータは参照ゲノム配列にマッピングし、リードの集中する箇所をエンリッチ領域として検出、アノテーション情報を付与してリスト化します。さらに、マッピングの様子はUCSCゲノムブラウザにて閲覧可能な形式で納品いたします。一般的に、1群の解析について2検体以上の解析（Duplicateでの解析）を推奨します。

■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。


■チラシをご覧ください。
ATAC-Seq／ChIP-Seq解析受託サービス


個々の細胞レベルでのクロマチンアクセシビリティー領域や、活性制御領域のプロファイリングに有効なシングルセルレベルでのオープンクロマチン解析 Single-Cell ATAC-Seq（scATAC-Seq）も対応可能です。別途お問い合わせください。

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

お見積りについてはこちらよりご依頼ください。

• シーケンス配列情報（fastq）
• マッピング情報（bam）
• ピークコール結果一式（Excel）
• UCSC閲覧ファイル（BED、bigWigURL）

・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらこちらへご送付ください。
・その他の必要書類、サンプル送付先を担当者よりご連絡します。
※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

• 次世代シーケンス（NGS）解析発注依頼書（Excel）
• ヒトゲノム・遺伝子解析情報提供用紙（Excel）
  

※弊社「個人情報としてのゲノムデータの取り扱い」の詳細はこちらをご参照ください。

• サンプル送付
  ・事前にサンプル送付予定をご連絡ください。担当者よりサンプル送付先をご案内します。
  ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
  

提供物	サンプル量	処理方法
培養細胞	5×104～1×105 cells	細胞ペレットを5％DMSO存在下で緩慢凍結してください。 （凍結方法は事前にお問い合わせください。） ・固定化は必要ございません。 ・血球系の細胞も可能です。 ・単離済みの核サンプルも受付可能です。
組織	25～50 mg	ヒト、動物由来の凍結組織 （解析可能な組織の種類や凍結方法についてはお問い合わせください。）

・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。