| DNA Polymerase I (E. coli) |
Klenow Fragment | T4 DNA Polymerase |
|||
|---|---|---|---|---|---|
| 活 性 |
DNA Polymerase 5'→3' | ＋ | ＋ | ＋ | |
| Exonuclease | dsDNA 5'→3' | ＋ | － | － | |
| ssDNA 3'→5' | ＋ | ＋ | ＋＋＋ | ||
| dsDNA 3'→5' | ±*1 | ±*1 | ＋ | ||
| RNaseH | ＋ | － | － | ||
| 鋳 型 |
Single-Stranded DNA | ＋ | ＋ | ＋ | |
| Single-Stranded RNA | ±*2 | ±*2 | － | ||
| 分子量 | 109,000 | 68,000 | 114,000 | ||
| 至適pH*3 | 7.4 | 7.4 | 8.8 | ||
| 金属イオン | Mg2＋ | Mg2＋ | Mg2＋ | ||
| processivity*4 | 10～50塩基 | 10～50塩基 | n. i. | ||
| elongation速度 | 20～30塩基/s | 20～30塩基/s | 100塩基/s | ||
| ddNTPの取り込み | 低い*5 | 低い | n. i. | ||
| vortex攪拌の影響 | 不安定 | 不安定 | 不安定 | ||
*1 ssDNA 3'→5' exonucleaseによる過剰反応であり、分解能は低い
*2 逆転写酵素の活性測定系（poly r(A)n）に対しては活性があるが、天然のRNAに対する活性は低い
*3 Polymeraseとしての至適pH。共存するexonucleaseの至適pHは一般に異なる
*4 酵素が基質に貼り付いてから遊離する（1 attack）までに合成する鎖長
*5 ddNTPの取り込みが低いということは、阻害を受けにくいということを意味する。
T4 DNA Polymeraseの場合、exonucleaseが強いため、取り込みの程度は測定困難
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