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1. | MightyAmp DNA Polymerase(1.25 U/μl) | 200 μl |
2. | 2×MightyAmp Buffer(Mg2+, dNTP plus)*2 | 1.25 ml×4 |
3. | 5×Loading Dye | 1 ml×3 |
― | Extraction Buffer | 20 ml |
5. | Proteinase K | 200 μl |
現象 | 問題点 | 対策 |
---|---|---|
増幅しない 増幅効率が悪い |
プライマーのTm値 | 上記の式を参考にプライマー設計する |
2 step PCR | 3 step PCRを試す | |
3 step PCR | 2 step PCRを試す (3 step PCRで増幅しないものが2 stepで増幅する場合がある) |
|
アニーリング温度 | 2℃ずつ下げてみる | |
サイクル数 | サイクル数を最大40 cyclesまで増やす | |
サンプルの量・調製法 | ・PCR反応液に持ち込む抽出液の使用量を減らす、または増やす ・抽出液へ持ち込む試料の量を減らす、または増やす | |
非特異的増幅が著しい | プライマーのTm値 | 上記の式を参考にプライマー設計する |
3 step PCR | 2 step PCRを試す | |
サイクル数 | サイクル数を25~30 cyclesに設定 |
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