高速シーケンス(NGS)解析

最新技術を用いた高速・大量シーケンス(NGS)
新規ゲノム・変異解析・ChIP・16S rRNAの網羅的解析に

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※2021年3月31日をもちまして、Ion Torrent NGSシステム(サーモフィッシャーサイエンティフィック社)を用いたシーケンスサービスは終了となりました。

特長

  • 各種次世代シーケンサーを用いたハイスループットな塩基配列解析
  • 幅広いアプリケーションに対応
  • サンプル処理×情報解析をトータルにサポート
  • 国内設備と安心のセキュリティ体制

概要

次世代シーケンサーであるNovaSeq/MiSeq(イルミナ社)およびPacBio Sequel II(パシフィックバイオサイエンス社)を用いて、高速シーケンス(NGS)解析サービスを提供いたします。
大量のシーケンス解析が可能であるため、新規ゲノムのドラフト解析、変異解析をはじめ、転写産物解析やメタゲノム解析など用途に応じて最適な機種を用いて解析いただけます。

サービス内容

  • NovaSeq/MiSeqによる解析
    物理的に断片化したDNAからライブラリーを作製してフローセルに結合させ、Sequencing by Synthesis法による2色または4色蛍光検出により塩基配列を一挙に解析します。NovaSeqの場合、一度に1フローセルあたり約2,400 Gbaseの塩基配列データの取得が可能です。ゲノム配列解析だけでなく、RNA-Seq解析に対するプラットフォームが整っています。
  • PacBio Sequel II Systemによる解析
    物理的に断片化した長鎖DNAからライブラリーを作製して、1分子リアルタイム(Single Molecule Real-Time; SMRT)DNAシーケンスを行います。長鎖の解析リード長を誇り、約50 kbのシーケンスデータを得ることが可能です(CLRモード)。また、1分子を鋳型にシーケンスを行うため、増幅バイアスを無くすことができます。新規ゲノム配列解析だけでなく、スプライシングバリアントの検出目的としてcDNA配列解析などにも有効です。

<機器の特長>

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  NovaSeq6000
(SP試薬使用)
NovaSeq6000
(S4試薬使用)
MiSeq PacBio Sequel II
1リード長 150 base 150 base 150/250/300 base 約20,000 base~
リード数 約6.6億リード
(1レーンあたり)
*1
約40億リード
(1レーンあたり)
*1
約3,000万リード
(1ランあたり)
*1
約400万リード
(1セルあたり)
データ量 約100 Gbase
(1レーンあたり)
*1
約600 Gbase
(1レーンあたり)
*1
約4.5~9 Gbase
(1ランあたり)
*1
CLR約130 Gbase
CCS約24 Gbase
(1セルあたり)
解析手法 Sequencing by Synthesis法 SMRT*2 sequencing法
解析単位 ・1レーンから ・1レーンから
・相乗り
・1ランから
・相乗り(細菌叢解析)
・1セルから
・相乗り
アプリケーション例 ・全ゲノムシーケンス解析
・エクソーム解析
・ゲノム変異解析
・RNA-Seq解析
・cDNA配列解析
・微生物の新規ドラフト配列決定
・癌遺伝子などの変異解析
・PCR産物のシーケンス
・細菌叢解析
・ゲノム配列解析
・cDNA配列解析
・Ampliconシーケンス

*1 ペアエンド解析を行います。
*2 SMRTはSingle Molecule Real-Timeの略になります。


<各種NGS関連アプリケーション>
上記にないNGS関連アプリケーションについてもお気軽にご相談ください。

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合せください。
各種アプリケーションページ、チラシに参考価格を記載しているものもございますのでご参照ください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式(塩基配列情報、精度情報)
  • 各種アプリケーションに適したデータ解析結果

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
     また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・送付サンプルがRNAの場合には、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便で、送付サンプルがDNAの場合には-20℃の状態の冷凍便でお送りください。

受入サンプル

各種アプリケーションページをご参照ください。

ご留意事項

  • PacBio Sequel IIによるSMRT sequencing法はその他のシーケンス方法に比べて、ベースコールミスを起こす割合が高くなります。
  • 一部の納品物は大容量になりますのでハードディスクで納品対応させていただきます。
  • ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
    詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
  • お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
タカラバイオはイルミナ社認定のサービスプロバイダーです。
イルミナ社認定

タカラバイオはパシフィックバイオサイエンス社認定のサービスプロバイダーです。
パシフィックバイオサイエンス社認定
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
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