※2020年8月より、遺伝子発現量の解析方法を変更いたしました。
・解析に使用するツールをDragenに変更しました。
・解析に使用する標準の参照配列をEnsembl (GENECODE)に変更しました。
過去データとの比較をご希望の場合は弊社担当にご相談ください。
特長
- 既知遺伝子の発現定量解析に
- 微量検体の遺伝子発現定量解析が可能
- スプライシングバリアントや融合遺伝子の検出にも対応
概要
サービス内容
価格・納期
納品物
- 作業報告書
- シーケンスデータ一式
- 発現情報、マッピング結果ファイル等
※2020年8月より、遺伝子発現量の解析方法を変更いたしました。
・解析に使用するツールをDragenに変更しました。
・解析に使用する標準の参照配列をEnsembl (GENECODE)に変更しました。
過去データとの比較をご希望の場合は弊社担当にご相談ください。
ご注文方法
オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。
-
オンライン注文
WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
「オンラインのご注文方法について」
※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。
-
メール注文
・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。
- サンプル送付
・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
・送付サンプルがRNAの場合には、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便でお送りください。
受入サンプル
- total RNAなど
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
|
サンプル量 |
液量(目安) |
純度 |
OD260/OD280 |
OD260/OD230 |
total RNA |
50 ng以上 |
25 μl以上 |
1.6以上 |
cDNA |
5 ng以上 |
10 μl以上 |
組織・細胞 |
別途ご相談ください |
・TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit (イルミナ社)での解析を希望の場合は哺乳類の場合4 μg以上、
それ以外の生物種の場合8 μg以上のtotal RNAをご提供ください。
・cDNAはSMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit/SMART-Seq HT Kit/SMART-Seq Single Cell Kitで増幅した産物を送付ください。
分解の進んだサンプルの場合はSMART-Seq Stranded Kitにて調整したライブラリーをご送付ください。
・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
・DNase処理を実施してください。
・サンプル調製時にエタノール沈殿を実施する場合は、共沈剤としてグリコーゲンを添加しないでください。
・電気泳動にてrRNAのバンドが検出され、分解していないことを予めご確認ください。
・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。
■サンプル送付容器について
・RNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。
24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
<推奨プレートおよびシール>
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・SEAL & SAMPLE Aluminium foil Lid(Biomek社, No. 538619)
ご留意事項
・ |
ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合はご連絡し、対応方法についてご相談いたします。 |
・ |
ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
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お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
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こちらをご確認ください。