SMART-Seq® mRNA / SMART-Seq® mRNA LP

イルミナ社NGS装置用の超微量mRNA-Seq用ライブラリー調製キット
  • Total RNA 10 pg~100 ng、または1~1,000細胞の超微量サンプルからイルミナ社NGS装置用の高品質mRNA-Seq用ライブラリー調製が可能
  • サンプルロスやハンドリングエラーを最小限に抑制するシンプルな操作ステップ
  • Unique Dual Index Kit(別売り)の使用により、インデックスホッピングの影響を軽減
  • ユーザーフレンドリーな解析ツール「Cogent NGS」が無料で利用可能
製品コード メーカー
略称
製品名 容量 価格(税別)
キャンペーン価格
特記事項 説明書、CoA
データシート
ベクター情報
参考資料 カート
Takara Code
634772

CLN

Clontech
SMART-Seq® mRNA
NGS関連 -RNAシーケンス編- 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法) 安全データシート(SDS)添付 ライセンス
24回 ¥219,000
¥175,200
2023/11/27~
2024/03/29

説明書・データシート・ベクター情報
Z4772N
634773

CLN

Clontech
SMART-Seq® mRNA
NGS関連 -RNAシーケンス編- 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法) 安全データシート(SDS)添付 ライセンス
96回 ¥740,000
¥592,000
2023/11/27~
2024/03/29

説明書・データシート・ベクター情報
Z4773N
634770

CLN

Clontech
SMART-Seq® mRNA
NGS関連 -RNAシーケンス編- 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法) 安全データシート(SDS)添付 ライセンス
96回×4 ¥2,757,000
¥2,205,600
2023/11/27~
2024/03/29

説明書・データシート・ベクター情報
Z4770N
634768

CLN

Clontech
SMART-Seq® mRNA LP
NGS関連 -RNAシーケンス編- 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法) 安全データシート(SDS)添付 ライセンス
24回 ¥233,000
¥186,400
2023/11/27~
2024/03/29

30%OFFモニターキャンペーン実施中!
説明書・データシート・ベクター情報
Z4768N
634769

CLN

Clontech
SMART-Seq® mRNA LP
NGS関連 -RNAシーケンス編- 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法) 安全データシート(SDS)添付 ライセンス
96回 ¥772,000
¥617,600
2023/11/27~
2024/03/29

説明書・データシート・ベクター情報
Z4769N
634771

CLN

Clontech
SMART-Seq® mRNA LP
NGS関連 -RNAシーケンス編- 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法) 安全データシート(SDS)添付 ライセンス
96回×4 ¥2,867,000
¥2,293,600
2023/11/27~
2024/03/29

説明書・データシート・ベクター情報
Z4771N
634756

CLN

Clontech
Unique Dual Index Kit (1-24)
24回 ¥34,000
説明書・データシート・ベクター情報
Z4756N
634752

CLN

Clontech
Unique Dual Index Kit (1-96)
96回 ¥87,000
説明書・データシート・ベクター情報
Z4752N
634753

CLN

Clontech
Unique Dual Index Kit (97-192)
96回 ¥87,000
説明書・データシート・ベクター情報
Z4753N
634754

CLN

Clontech
Unique Dual Index Kit (193-288)
96回 ¥87,000
説明書・データシート・ベクター情報
Z4754N
634755

CLN

Clontech
Unique Dual Index Kit (289-384)
96回 ¥87,000
説明書・データシート・ベクター情報
Z4755N
※色文字での表示は、キャンペーン価格およびそのキャンペーン期間です。
※本キットにはIndexが含まれていません。Unique Dual Index Kit(製品コード 634752/634753/634754/634755/634756)を別途ご購入ください。
※SMART-Seq mRNA(製品コード 634772/634773/634770)にはライブラリー調製キットは含まれていません。
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製品説明

SMART-Seq mRNA LPは、total RNA 10 pg~100 ng、または1~1,000細胞の超微量サンプルからイルミナ社NGS装置用の高品質mRNA-Seq用ライブラリーが調製可能なキットです。高品質・高効率なcDNA合成技術SMART法 (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)を採用しており、完全長mRNA-Seqにおける遺伝子発現定量解析が可能です。また、Unique Dual Index Kit(製品コード 634752、別売り)を用いたマルチプレックスシーケンスにより、インデックスホッピングの影響を軽減することができます。
ライブラリー調製においては、フラグメンテーションやステムループのアダプターライゲーションをシングルチューブで行う弊社独自のシングルチューブワークフローにより、ハンズオンタイムの短縮に加え、操作ミスやサンプルロスを抑制します。
また、データ解析には、ユーザーフレンドリーな解析ツール「Cogent NGS」が無料で利用可能です。

Cogent NGSソフトウェアは下記ページからダウンロードしてください。
Cogent NGS Discovery Software (takarabio.com)
Cogent NGS Analysis Pipeline (takarabio.com)

※分解の進んだ低品質RNAやnon-coding RNAからライブラリー調製を行う場合は、逆転写反応にランダムプライマーを使用するSMART-Seq Stranded Kitをご使用ください。

図1. SMART法によるcDNA合成フロー
図1. SMART法によるcDNA合成フロー


図2. SMART-Seq Library Prep Kitによるライブラリー調製フロー
図2. SMART-Seq Library Prep Kitによるライブラリー調製フロー


図3. シングルチューブワークフローによるライブラリー調製
図3. シングルチューブワークフローによるライブラリー調製

注意事項

本製品は、SMART-Seq v4 PLUS Kitおよび SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencingの製品名が変更となった製品です。
製品名以外に以下に記載されたマイナーチェンジがなされていますが、プロトコールや性能への影響はありません。

  1. SeqAmp PCR bufferが SeqAmp CB PCR bufferになり、DNAクリーンアップ時のビーズのペレッティングおよび再懸濁の操作性が向上しています。
  2. AfaI、10× AfaI Buffer、0.1% BSAは含まれていません。
  3. Total RNAのインプット量の上限が、10 pg~10 ngから10 pg~100 ngとなっています。
  4. 本キットにはIndexが含まれていません。Unique Dual Index Kit(製品コード 634752他)を別途ご購入ください。

内容

SMART-Seq mRNA(製品コード 634772/634773/634470)
Box 1(Store at -70℃)
Control Total RNA(1 μg/μl)
Box 2(Store at -20℃)
SMART-Seq v4 Oligonucleotide(48 μM)
PCR Primer II A(12 μM)
5× Ultra Low First Strand Buffer
SMARTScribe Reverse Transcriptase(100 U/μl)
3' SMART-Seq CDS Primer II A(12 μM)
RNase Inhibitor(40 U/μl)
Nuclease-Free Water
10× Lysis Buffer
Elution Buffer(10 mM Tris-Cl, pH8.5)
SeqAmp DNA Polymerase
SeqAmp CB PCR Buffer(2×)

SMART-Seq mRNA LP(製品コード 634768/634769/634771)
SMART-Seq mRNA(製品コード 634772/634773/634470)
SMART-Seq Library Prep Kit
10× FE
FE Dilution Buffer
Lib Prep Buffer
Lib Prep Enzyme
Rxn Enhancer
Stem Loop Adapters
Amplification Buffer
PrimeSTAR HS DNA Polymerase(5 U/μl)
Nuclease-Free Water

本キットの単品販売はありません。

保存

SMART-Seq mRNA
  • Control Total RNA:-70℃
  • その他のコンポーネント:-20℃

SMART-Seq Library Prep Kit:-20℃

(10× Lysis Buffer:融解後は4℃保存、Elution Buffer:融解後は室温保存)

本製品以外に必要な試薬、機器(主なもの)

Index Kit
  • Unique Dual Index Kit (1-24)(製品コード 634756)
    UDI No. U001-U024
  • Unique Dual Index Kit (1-96)(製品コード 634752)
    UDI No, U001-U096
  • Unique Dual Index Kit (97-192)(製品コード 634753)
    UDI No, U097-U192
  • Unique Dual Index Kit (193-288)(製品コード 634754)
    UDI No, U193-U288
  • Unique Dual Index Kit (289-384)(製品コード 634755)
    UDI No, U289-U384

PCR増幅およびバリデーション
  • First-Strand cDNA 合成専用のPCRサーマルサイクラー
  • Double-Strand cDNA 増幅専用のPCRサーマルサイクラー
  • Nuclease-free thin-wall PCR tube(0.2 ml;USA Scientific社 Code 1402-4700)または同等のNuclease-free thin-wall PCR tube stripsまたは96-well Plate
  • Nuclease-free low adhesion 1.5 ml tube(USA Scientific社 Code 1415-2600)またはDNA LoBind tube(Eppendorf社 Code.022431021)または同等のnucleic acid low-binding tubes
  • 96-well Plate用粘着シール Thermo Scientific Adhesive PCR Plate Seals(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AB0558)または 8 tube strips用Cap strips(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AB0784/AB0850)

セルソーティング
  • 8-tube strips(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AB0264)またはセルソーティングに適したPCR tube strips, 96-well plates
  • (オプション)BD FACS Pre-Sort Buffer(BD社 Cat. No. 563503)
  • チューブ・プレート用クーリングブロック(-20℃で保存してあらかじめ冷やしておく)
  • Adhesive PCR Plate Foils(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AB-0626)
  • ドライアイス(細胞の凍結用)
  • (オプション)SMART-Seq HT Kit Lysis Components(製品コード 634439)First-Strand cDNA 合成専用のPCRサーマルサイクラー

SPRI Bead精製
  • NucleoMag NGS Clean-up and Size Select(5 ml size:製品コード 744970.5;50 ml size:製品コード 744970.50;500 ml size:製品コード 744970.500)
    ※NucleoMagの代わりにAMPure XP PCR purification kit(Beckman Coulter社 5 ml size:Cat. No. A63880;60 ml size:Cat. No. A63881)も使用可能
  • Magnetic Separation Device
  • 12~24サンプル用
    0.2 mlチューブ:SMARTer-Seq Magnetic Separator - PCR Strip:製品コード 635011)など
    0.2 mlチューブまたはストリップ用遠心機
    96-well フォーマット用:Magnetic Stand-96(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AM10027)など
    24~96サンプル用
    96-well フォーマット用:Magnetic Stand-96(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AM10027)など
    1.5 ml用(シーケンス用ライブラリーをプールする場合に必要)
    Magnetic Stand(製品コード 631964)または NEB Magnetic Separation Rack(NEB社 Cat. No. 1506S)
    8-tube strips(Thermo Fisher Scientific社 Cat. No. AB0264)またはPCRラックに固定されNuclease-freeのPCR tube strips、またはセルソーターで動作確認済みの96-well Plate
  • 80% Ethanol(必ず用時調製すること)

その他
  • シングルチャンネルピペット:10 μl、20 μl、200 μlおよび1,000 μl
  • 8連チャンネルピペット:20 μl、200 μl
  • フィルターピペットチップ:10 μl、20 μl、200 μlおよび1,000 μl
  • 1.5 mlチューブ用微量遠心機
  • 0.2 mlチューブまたはstrip用微量遠心機
  • 96ウェル冷却ラック(IsoFreeze PCR Rack, MIDSCI社 Cat. No. 5640-T4、96-Well Aluminum Block, Light Labs社 Cat. No. A-7079など)
注意事項
  • 本ページの製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
  • タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。
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