ICELL8 シングルセル解析

シングルセルレベルでの遺伝子発現解析
＜NEW＞2022.6.23 更新
TCR/BCRプロファイリング & 融合遺伝子検出が可能になりました。

特長

  • 5,184個のナノウェルを搭載したICELL8 Chipに細胞を分注し、シングルセルを取得
  • 単一の生細胞のみを選択してmRNA解析（1,200～1,500個程度のプロファイルを一度に取得）
  • 多様な細胞サイズ（5～100 μm）に対応し、1 Chipあたり最大8サンプルまでの同時解析が可能
  • 高感度なSMART-Seq技術により、シングルセルの全長トランスクリプトームの解析が可能（全長解析）
  • TCR/BCRプロファイリング、融合遺伝子検出も可能
  • 3'末端配列から解析する3'DE解析も選択可能

サービス内容

調製したシングルセルに対して、SMART-Seq Pro Application Kit - 2 Chipを用いてChip上で完全長のcDNA合成を実施します。ICELL8 chipから回収したライブラリーから次世代シーケンサーにて遺伝子の全長配列を取得し、Cogent NGSソフトウェアツールにて全長トランスクリプトームの発現プロファイリングを行います。全長配列を解析することにより、遺伝子単位の発現差解析だけでなく、トランスクリプトーム単位の発現差解析や選択的スプライシングの解析を行います。またTCR/BCRプロファイリング、融合遺伝子検出も可能です。
※3'RNA-Seq法（3'DE解析）での遺伝子発現差解析（Seuratソフトウェアでの解析）のメニューにつきましては、別途お問い合わせください。

※シングルセル化装置ICELL8 cx Single-Cell Systemの詳細はこちら

※Cogent NGSソフトウェアツールは以下リンクから無料でダウンロードできます。
Cogent NGS Discovery Software (takarabio.com)


■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。
ICELL8 シングルセル解析ウェブ会員限定技術資料

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 発現情報データ等
※解析結果については、解析結果の可視化ソフトウェアCogentDSをTakara Bio USAのウェブサイトよりダウンロードいただき、ご確認いただけます。

ご注文方法

以下のフォーマットにご記入のうえ、電子メールにてこちらへご送付ください。

受入サンプル

  • 細胞
  • 参照配列情報など

詳細は別途お問い合わせください。

ご留意事項

・ ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
・ お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

Application

ICELL8® Single-Cell Systemを用いた細胞混合サンプルの解析
ICELL8® Single-Cell Systemを用いた神経分化細胞プロファイリング
ICELL8® Single-Cell Systemを用いたアストロサイト分注　（細胞サイズと分注バイアスの確認）

関連製品・受託

ICELL8® cx Single-Cell System
SMART-Seq® Pro Application Kit - 2 Chip（cxシステム用）
SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing
T細胞レパトア解析（T細胞受容体多様性解析）
次世代シーケンス（NGS）解析受託

ICELL8 シングルセル解析 Q&A

注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
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