T細胞レパトア解析（T細胞受容体多様性解析）

SMARTテクノロジー／5' RACE法とNGSの組み合わせによる網羅的なレパトア解析

特長

  • 低い増幅バイアスが期待できるSMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2を使用
  • UMIの利用により、わずか0.001％のクローン型特異的CDR3配列まで高感度に検出可能
  • 比較解析、多様性指標を含む多様な情報解析を提供

■チラシをご覧ください。
ヒトT細胞レパトア解析受託サービス

サービス内容

供与細胞またはtotal RNAから、TCRα、TCRβ受容体領域についてSMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2を用いてシーケンスライブラリーの調製を行い、次世代シーケンサーを用いて塩基配列を解析します。目的の解析領域に応じて、NovaSeqまたはNextSeqでの解析提案が可能です。得られた塩基配列をもとに多様性の解析を行います。

■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。
ヒトT細胞レパトア解析ウェブ会員限定技術資料

オプション　サンプル調製

価格・納期

価格・納期は検体数やご依頼内容によって変わりますので、別途お問い合わせください。

お見積りについてはこちらよりご依頼ください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 解析データ一式

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
    　また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書（オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物）を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便でお送りください。

受入サンプル

以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
送付物 サンプル量 濃度 液量（目安） 純度
OD260／OD280 OD260／OD230
total RNA
（T細胞）		 300 ng以上 20 ng/μl以上 15 μl以上 1.6以上
total RNA
（全血・組織由来）		 3 μg以上 150 ng/μl以上 20 μl以上 1.6以上
組織検体 100 mg以上 ―
血液検体 全血 3 ml以上 ―
※対象はヒト由来検体のみとなります。
※末梢血、組織等にてご依頼の場合は、別途RNA抽出費用を申し受けます。
※血液検体の場合、ヘパリンを含む採血管は使用しないでください。
※組織は採取後速やかに－80℃で保存し、十分な量のドライアイスを入れて弊社へご発送ください。
　迅速な凍結保存が困難な場合は、RNAlaterに浸漬するなど、RNAが分解しないようにして保存してください。


シーケンスライブラリーの作製の際には、サンプル中のT細胞由来のtotal RNA量が重要となります。
末梢血単核細胞以外の検体につきましては、以下の検体中のおよそのT細胞の存在比を目安に必要サンプル量をご準備ください。
検体種別 T細胞の存在比の目安
セルソーター等で単離されたT細胞 ＞90％
末梢血単核細胞（PBMC） 40～60％
全血 20～40％
リンパ組織 40～60％
その他組織 ＜10％


■サンプル送付容器について
・RNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブでの提供はご遠慮ください。
　24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
　※プレートは弊社より提供可能（無償）です。ご希望の方はお問い合わせください。

＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates（Eppendorf社, No. EP-0030128.648）
・タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）

ご留意事項

  • ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
    詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。
  • 解析サンプルやその他供与物は別途定めている場合を除き、解析終了後弊社で3ヵ月は保管いたします。

関連製品・受託

SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
RNA-Seq解析

注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
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