miRNA-Seq解析

miRNAを含めたsmall RNAの発現解析

特長

  • total RNAや血清・血漿検体など、様々なサンプルから網羅的なmiRNA発現解析を行います。miRNA以外のsmall RNAの発現解析も可能です。

概要

miRNA（microRNA）は、18～26塩基からなる機能性non-coding RNAの1つで、遺伝子発現の転写後抑制機構として注目を集めています。miRNAは組織特異的または時期特異的に多数のmRNAを制御することで、細胞増殖・アポトーシス・発生と分化・代謝などに深く関与しています。また、その異常は癌などの疾患とも密接に関わっており、数々のmiRNAとそのターゲット遺伝子の同定が進められています。更に血清や血漿中のmiRNAは細胞間の情報伝達機能を持つことが示唆されており、各種疾患や生命現象のバイオマーカーとして注目されています。タカラバイオでは、次世代シーケンサーを用いたmiRNA解析の網羅的な解析サービスをご提供いたします。

サービス内容

Total RNAをご提供いただき、シーケンスライブラリーを作製し、イルミナ社シーケンサーにてシーケンスを行います。既知のmature miRNAなどのsmall RNAについて発現量を算出した結果を納品いたします。

作業の流れ

miRNAシーケンス解析の作業の流れ


発現解析結果
遺伝子ごとの発現情報（Count値およびTPM値）とアノテーション情報をExcel形式で納品いたします。
発現解析結果

【オプションサービス】
・RNA抽出
・データマイニング

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 解析データ一式

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
    　また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書（オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物）を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・送付サンプルがRNAの場合には、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便でお送りください。

受入サンプル

横にスクロールできます
サンプル量 濃度 液量（目安） OD260/OD280 OD260/OD230
Total RNA*1（短鎖を含む） 600 ng以上 20 ng/μl以上 30 μl以上 1.6以上
血清／血漿由来RNA 200 μl以上の血清／血漿分のRNA*3
Exosome由来RNA 1 ml以上の血清／血漿分のRNA*3
血清・血漿*2 500 μl以上 - -
*1 電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
*2 送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。ヘパリン入り採血管は使用しないでください。
*3 比較群同士では同じ量のサンプルから同じ方法で抽出することが重要です。詳細は事前にご相談ください。
・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
・DNase処理を実施してください。
・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。


■サンプル送付容器について
・RNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。
　24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates (Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・WATSON　タイタースティック HCフィルム（547-KTS-HC）

ご留意事項

・ ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合はご連絡し、対応方法についてご相談いたします。
・ ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
・ お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

関連製品・受託

ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて
ヒト組織等の臨床検体のお取り扱いについて
次世代シーケンス（NGS）解析受託

注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
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