クラウドデータマイニング解析(Expression Miner 2.0)

クラウド上でRNA-Seqの比較解析、各種作図が簡単に行えます。

特長

  • RNA-Seqの発現解析結果を用いたデータマイニングツール
  • 比較解析、統計検定をご自身で簡単に行えるクラウド解析サービス
  • 組み合わせや閾値を何度でも変更して解析することが可能

概要

クラウド上にアップロードしたRNA-Seqの発現解析結果から、フィルタリング、比較解析を行います。比較手法(t検定、ANOVA等)を選択できるため、バイオインフォマティクスの知識がなくても簡単に解析できます。
また、比較解析結果から変動遺伝子を抽出、エンリッチメント解析を行うことも可能です。

サービス内容

クラウド上にアップロードされたRNA-Seqの既知遺伝子発現解析結果*から、フィルタリング、比較解析を行い、その比較解析結果から、変動遺伝子を抽出し、Reactome、Gene Ontologyなどのデータベースを用いたエンリッチメント解析を行います。
解析結果はcsv形式のファイルとしてエクスポート可能で、図はpng形式のファイルとして保存できます。

* 弊社で実施した既知遺伝子発現解析結果をアップロードいたします。弊社で既知遺伝子発現解析を行っていない場合は、弊社パイプラインによる既知遺伝子発現解析からのご依頼が必要です。

■各種機能
クラスタリング

価格・納期

サービス項目 参考価格 利用可能期間
Expression Miner 2.0 ¥150,000 1ライセンスあたり 納品日より3ヵ月間

納品物

クラウド解析サービスをご利用の場合は、遺伝子発現解析結果をクラウド上にアップロードし、納品時にクラウドURLをご連絡いたします。クラウド解析サービスは納品後3ヵ月間ご利用いただけます。
※シーケンスからご依頼の場合は、別途、作業報告書・解析データを納品いたします。

■クラウド解析サービスご利用環境について
クラウド解析サービスは、Google Chromeの使用を推奨いたします。Firefox、Microsoft Edge、Safari(いずれも2021年4月時点での最新版)でも動作確認を行っておりますが、動作自体を保証するものではありません。

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。

    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
     また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、送付データに含まれる名称の記載は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・解析データは平日午前着指定でご送付ください。

受入サンプル

シーケンスデータ
RNA-Seq解析で得られたイルミナ社シーケンスデータ(fastqファイル)
※シーケンスデータでお預かりの場合は、遺伝子発現解析からご依頼いただく必要がございます。
※弊社で実施した遺伝子発現解析結果をお持ちの場合は事前にご相談ください。

ご留意事項

ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。 詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。

【Expression Minerソフトウェアランセンスについて】
Expression Minerソフトウェアライセンスをご購入される際には、cBioinformatics社からの使用制限に関する同意が必要です。
以下の「Expression Minerに関するライセンスについて」をご確認ください。
なお、弊社参考見積書番号によりご依頼いただいた場合、「Expression Minerに関するライセンスについて」をご了承いただいたものとみなします。
 License Statement No. L109  Expression Minerに関するライセンスについて
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。