高速シーケンス解析をリーズナブルにご提供

相乗りシーケンス解析

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[サンプル送付先] タカラバイオ株式会社 CDMセンター 遺伝子工学研究/検査 受託受付担当 宛て
〒525-0058 滋賀県草津市野路東七丁目4番38号
TEL:077-567-9262
ご注意:伝票の品名に受託名をご記載ください。

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特長

  • イルミナ社HiSeq、NovaSeqを用いたハイスループットな塩基配列解析
  • 幅広いアプリケーションに対応
  • 国内設備と安心のセキュリティ体制

概要

次世代シーケンサーのデータ産生能力は年々増加しており、アプリケーションによってはオーバースペックになっています。タカラバイオでは、イルミナ社HiSeqまたはNovaSeqを用いたペアエンドシーケンス解析を複数のお客様でシェアしていただくことにより、最適なデータ量をお求めやすい価格でご提供いたします。
■チラシをご覧ください。

相乗りシーケンス(NGS)解析

サービス内容

HiSeqまたはNovaSeqのペアエンドシーケンスの解析単位である1レーン分を複数ユーザーでシェアしていただくサービスです。HiSeq 2500を用いた100 base長ペアエンドシーケンスまたはNovaSeq 6000を用いた150 base長ペアエンドシーケンスを実施いたします。使用するライブラリーキットや得られるデータ量の目安はアプリケーションによって異なります。以下の表をご参照ください。

●DNA-seq解析、全ゲノムシーケンス解析
HiSeq 4 Gbase 相乗りプラン:
微生物のゲノムドラフト解析やゲノムサイズが200 Mbase程度までの生物の変異解析に最適です。 PCRフリーライブラリーもご選択いただけます。

NovaSeq 90 Gbase 相乗りプラン:
ヒト、マウスなどの全ゲノムシーケンス、変異解析にご利用ください。

・シーケンス解析
シーケンサー ライブラリー データ量(目安) 送付サンプル 価格(税別) 納期
HiSeq 2500
(100PE)
TruSeq Nano DNA
Library Prep Kit
4 Gbase
/検体
ゲノムDNA 500 ng 以上
(濃度 20 ng/μl 以上)
¥140,000 約2~4週間
★短納期
TruSeq DNA
PCR-Free Library
Prep Kit
4 Gbase
/検体
ゲノムDNA 2 μg 以上
(濃度 40 ng/μl 以上)
\145,000 4~6週間
★短納期
NovaSeq 6000
(150PE)
TruSeq DNA
PCR-Free Library
Prep Kit
90 Gbase
/検体
ゲノムDNA 2 μg 以上
(濃度 100 ng/μl 以上)
¥175,000 約2ヵ月

・情報解析【オプション】
サービス内容 情報解析 検体数/データ量 参考価格 参考納期 備考
ヒト全ゲノム
シーケンス解析
変異解析 1検体/90 Gbase ¥115,000 +約2週間 マッピング結果(bamファイル)と変異検出結果(vcfファイル)、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品

●ヒトエクソーム解析
納期重視のHiSeq相乗りプラン、多検体を低価格で解析可能なNovaSeq相乗りプランをご用意しています。NovaSeq相乗りプランは、検体数に応じた価格設定をしています。下記以外の検体数の場合はお問合せください。

・シーケンス解析
シーケンサー ライブラリー データ量(目安) 送付サンプル 価格(税別) 納期
HiSeq 2500
(100PE)
SureSelect 
(Human All Exon V6)
5 Gbase
/検体
ゲノムDNA
5 μg 以上
(濃度 100 ng/μl 以上)
\160,000 2~4週間
★短納期
NovaSeq 6000
(150PE)
SureSelect
(Human All Exon V6)
100 Gbase
/8検体
ゲノムDNA
500 ng 以上
(濃度 20 ng/μl 以上)
¥750,000 /
8検体
※約\94,000/検体
約2ヵ月
100 Gbase
/16検体
¥1,150,000/16検体
※約\72,000/検体

・情報解析【オプション】
ヒトエクソーム変異解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
サービス内容 情報解析 検体数/データ量 参考価格 参考納期 備考
ヒトエクソーム
解析
変異解析 16検体/100 Gbase ¥175,000 +約2週間 ヒトエクソーム解析ご依頼の場合のオプション。bamファイル、vcfファイル、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
変異解析
★短納期
1~2検体/5~10 Gbase ¥65,000 +5営業日 ★短納期 HiSeq相乗りプランでのヒトエクソーム解析ご依頼の場合のオプション。
bamファイル、vcfファイル、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
8検体/~40 Gbase ¥110,000

●RNA-seq解析
納期重視のHiSeq相乗りプラン、検体あたりのコストを抑えたNovaSeq相乗りプランを選択いただけます。
微量サンプルの解析にはSMART-seq相乗りプランをご利用ください。NovaSeq相乗りプランは、検体数に応じた価格設定をしています。下記以外の検体数の場合はお問合せください。

・シーケンス解析
シーケンサー ライブラリー データ量(目安) 送付サンプル 価格(税別) 納期
HiSeq 2500
(100PE)
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit 4,000万リード
/検体
total RNA 4 μg 以上
(濃度 200 ng/μl 以上)
\140,000 2~4週間
★短納期
SMART-seq v4
+ Nextera DNA Sample Prep Kit
4,000万リード
/検体
◎SMART-seq
total RNA 50 ng 程度
\180,000 4~6週間
★短納期
NovaSeq 6000
(150PE)
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit 6億リード
/8検体
total RNA 4 μg 以上
(濃度 200 ng/μl 以上)
¥590,000
/8検体
※約\74,000/検体
約2ヵ月
6億リード
/16検体
¥830,000
/16検体
※約\52,000/検体

・情報解析【オプション】
既知遺伝子発現解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
サービス内容 情報解析 検体数/
データ量
参考価格 参考納期 備考
RNA-seq解析 既知遺伝子
発現解析
16検体/
6億リード
¥250,000 +約2週間 対象生物種: ヒト、マウス、ラット、イネ、シロイヌナズナ。その他の生物種はお問い合わせください。
既知遺伝子
発現解析
★短納期
2検体/8,000万リード ¥120,000 +5営業日 ★短納期 HiSeq相乗りプランでのRNA-seq解析ご依頼の場合のオプション。
対象生物種: ヒト、マウス、ラット、イネ、シロイヌナズナのみ
6検体/
2.4億リード
¥220,000
※シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
※血液・細胞・組織などからのRNA抽出サービスのオプションもございます。
※データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
【オプション解析】
  • 核酸抽出
    核酸抽出からご依頼の場合は、納期+2週間程度かかります。検体数、検体種類によっては納期が遅れる場合がございます。

  • 短納期情報解析
    HiSeq相乗りプランのオプションメニューです。HiSeq相乗りプランをご依頼の場合のみ、ご依頼いただけます。シーケンス納期+5営業日程度にて納品いたします。

  • WEB納品
    HiSeq相乗りプランのオプションメニューです。HiSeq相乗りプランご依頼で、情報解析のオプション無しの場合にご選択いただけます。通常価格より5,000円お値引させていただきます。
    注意事項をご確認の上、ご選択ください。

  • 情報解析(通常納期)
    オンライン注文にて、下記メニューを選択いただくことも可能です。短納期シーケンスをご依頼の場合は、こちらの情報解析(通常納期)はご選択いただけません。

    ・既知遺伝子発現解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
    ・ゲノム変異解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
    ・ヒトエクソーム変異解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。

    【HiSeq相乗りプランについて】
    ・オンライン注文限定のサービスです。一度に最大10検体をご依頼いただけます。
    ・カレンダーをご確認の上、オンライン注文にてご依頼ください。オンライン注文はこちら
     ※SMART-seq v4およびTruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kitを用いた短納期解析はオンライン注文に対応しておりません。見積書をご用意いたしますのでお問合わせください。
    ・カレンダーの◆印のサンプル到着期限日の午前中まで必着でサンプルをお送りください(サンプルの受入は平日のみです)。
    ・サンプル到着期限日◆より、10営業日で納品物を弊社より発送します。
    ・オプションの短納期情報解析もあわせてご依頼の場合は、カレンダー発送予定日より+5営業日程度お時間をいただきます。

    短納期カレンダー10月

    短納期カレンダー11月

    短納期カレンダー12月

    短納期カレンダー2019年1月

    短納期カレンダー2019年2月

    短納期カレンダー2019年3月

    ◆ … サンプル到着期限日(この日の午前中まで必着で送付してください。)
    ● … データ発送予定日

    <HiSeq相乗りシーケンス 注意事項>
    ・サンプル受領後、弊社にて品質検定を実施しますが、品質結果の途中報告は行いません。
    送付サンプルの品質基準に満たなくても、作業は進めさせていただきます。
    ・サンプル到着期限日◆の午前中までにサンプルが届かなかった場合は、次のランスケジュールでの実施となります。
    (例: 12月12日着 ⇒ 12月26日到着期限日のランスケジュールで実施し、12月26日の発送となります。)
    ・核酸抽出からご依頼の場合は、核酸抽出作業が終了後、直近のランスケジュールにて対応します。
    ・サンプル到着順に作業を行います。ご依頼検体数の総数が多い時は納期が延びる場合もございます。
    ・シーケンス不良で再シーケンスとなった場合は、納期が延びる可能性がございます。
    ・各作業工程における弊社判断基準を下回る場合には、カレンダー記載の納期を達成できない、または解析中止となる可能性がございます。
    ・解析中止となりました場合には、それまでの作業代金を申し受けております。
    ・納品予定カレンダーは、その他受託状況により変更することがございます。

価格・納期

・価格: 注文方法、メニューにより価格が異なります。
・納期: NovaSeq相乗りプラン … 検体受領後2ヵ月
HiSeq相乗りプラン … カレンダー参照
※ オプション作業の納期は含まれておりません。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式(fastq形式ファイル)

オプション情報解析
  • マッピング結果(bam形式ファイル)
  • 解析結果(Excel形式ファイル)
    など

※ WEB納品ご選択時の注意事項
・WEB納品システムの対応ブラウザは、Google Chrome です。
・各ファイルのダウンロードは1回のみです。
・シーケンスデータはサイズが大きいため時間を要する場合がございます。
 事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。
 ・推奨回線速度計測サイト: https://www.musen-lan.com/speed/speed-img.html
 ・測定結果が20Mbpsの場合:20分/サンプル、50Mbpsの場合:10分/サンプルが目安です。
 ・複数サンプルのご依頼の場合はこの数倍の時間を要しますのでご注意ください。
 ・シーケンスデータはエクソソームシーケンスやRNA-Seqでは5GB/サンプル
  全ゲノムシーケンスでは数十GB/サンプルが目安です。

ご注文方法

オンライン注文とFAX注文の2種類からお選びください。HiSeq相乗りプランは、オンライン注文からご注文ください。
  • オンライン注文:
    ※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意いたしますので、お問い合わせください。
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ

    ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
    「オンラインのご注文方法について」

    ※オンライン注文ページは Internet Explorer11.0のバージョンのブラウザで動作確認をしております。それ以前のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。 また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • FAX注文:


サンプル送付
  • 解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を上記サンプル送付先へご送付ください。
  • サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。 また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。 なお、送付する核酸がRNAの場合には、凍結状態を維持するために充分量のドライアイスを同梱し冷凍便で、送付する核酸がDNAの場合には-20℃の状態の冷凍便でお送りください。

受入サンプル

各種アプリケーションによって異なりますので、お問い合わせください。
ライブラリーでの受入も可能です。

ご留意事項

本解析は複数ユーザー様のサンプルを混合してシーケンスいたします。混合データからタグ配列をもとに分類し、各サンプルデータを作成いたしますが、それぞれに別データが混入する可能性を否定することはできません。ご了承ください。
一部の納品物は大容量になりますのでハードディスクで納品させていただきます。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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