マッハライ・ナーゲル社製品選択ガイド<DNA抽出・精製・クリーンアップ>


サンプル、標準的な収量、所要時間推奨製品
プラスミド
DNA調製
トランスフェクショングレード陰イオン交換クロマトグラフィーMini:大腸菌培養液 1~10 ml、3~20 μg、60分NucleoBond PC 20
Midi:大腸菌培養液 ~200 ml (high copy)、~500 μg、70分/30分NucleoBond Xtra Midi/Midi Plus
Maxi:大腸菌培養液 ~600 ml (high copy)、~1,000 μg、75分/35分NucleoBond Xtra Maxi/Maxi Plus
Mega:500~2,000 μg、90~120分NucleoBond PC 2000
Giga:2,000~10,000 μg、120~150分NucleoBond PC 10000
シリカメンブレン、スピンカラムMini:大腸菌培養液 ~5 ml、15~30 μg、14分NucleoSpin Plasmid Transfection-grade
シリカメンブレン、SnapカラムMidi:大腸菌培養液 ~50 ml、~700 μg、35分NucleoSnap Plasmid Midi
エンドトキシンフリーグレード陰イオン交換クロマトグラフィーMidi:大腸菌培養液 ~200 ml(high copy)、~500 μg、85分/45分、
エンドトキシン <0.05 EU/μg
NucleoBond Xtra Midi EF/Midi Plus EF
Maxi:大腸菌培養液 ~600 ml(high copy)、~1,000 μg、90分/50分、
エンドトキシン <0.05 EU/μg
NucleoBond Xtra Maxi EF/Maxi Plus EF
Mega:500~2,000 μg、150分、
エンドトキシン <0.1 EU/μg
NucleoBond PC 2000 EF
Giga:2,000~10,000 μg、180分、
エンドトキシン <0.1 EU/μg
NucleoBond PC 10000 EF
BAC、PAC、P1、コスミド陰イオン交換クロマトグラフィー大腸菌培養液 250~750 ml、150 μg、75分NucleoBond Xtra BAC
大腸菌培養液 100~500 ml、100 μg、120分NucleoBond BAC 100
クローニング、形質転換、シーケンスシリカメンブレン、スピンカラム大腸菌培養液 1~10 ml、25~40 μg、25分NucleoSpin Plasmid
大腸菌培養液 2~10 ml、15~30 μg、14分NucleoSpin Plasmid EasyPure
ゲノム
DNA調製
全血および体液からの調製
(クエン酸、EDTA、へパリン、CPDA処理血に使用可能)
シリカメンブレン、スピンカラム~200 μl 全血、4~6 μg、30分NucleoSpin Blood
~200 μl 全血、4~6 μg、25分NucleoSpin Blood QuickPure
0.2~2 ml 全血、40~60 μg、60分NucleoSpin Blood L
2~10 ml 全血、200~300 μg、60分NucleoSpin Blood XL
陰イオン交換クロマトグラフィー4~5時間
最大500 μgの高分子ゲノムDNAを精製
NucleoBond CB
血漿、血清からの調製シリカメンブレン、スピンカラム~240 μl 血漿、血清、~25 ng、27分
50 bp以上のcfDNAを回収
NucleoSpin Plasma XS
シリカメンブレン、Snapカラム~5 ml 血漿、~100 ng/1 ml 血漿、45分
50 bp以上のcfDNAを回収
NucleoSnap DNA Plasma
組織、培養細胞、バクテリア、酵母からの調製シリカメンブレン、スピンカラム0.025~10 mg 組織/10~104個培養細胞、~3 μg、20分(溶解後)NucleoSpin Tissue XS
~25 mg 組織/102~107個培養細胞、~35 μg、20分(溶解後)NucleoSpin Tissue
~40 mg 組織/~106個培養細胞、~4 μg、25分(1時間以内の溶解後)NucleoSpin DNA RapidLyse
陰イオン交換クロマトグラフィー4~5時間
最大500 μgの高分子ゲノムDNAを精製
NucleoBond AXG
植物、糸状菌からの調製シリカメンブレン、スピンカラム~100 mg 植物組織、1~30 μg、30分NucleoSpin Plant II
~400 mg 植物組織、10~100 μg、90分NucleoSpin Plant II Midi
~1,500 mg 植物組織、50~300 μg、90分NucleoSpin Plant II Maxi
FFPE組織切片~7切片(10 μm厚、面積 250 mm2)、試料に大きく依存、70分(溶解後)NucleoSpin DNA FFPE XS
食品、試料から調製加工食品、大豆(豆乳、大豆粉)、チョコレート、穀類、肉類、動物飼料など ~200 mg、0.1~10 μg、30分NucleoSpin Food
法医学的サンプルからの調製血液痕、タバコ吸殻、スワブサンプルなど、1~3 μg(口腔粘膜の場合)NucleoSpin DNA Forensic
糞便からの調製シリカメンブレン、スピンカラム、破砕用のBead Tube付200 mg 新鮮便、凍結便、試料に大きく依存、60分NucleoSpin DNA Stool
昆虫、甲殻類から調製~40 mg 昆虫、甲殻類、~25 μg、35分NucleoSpin DNA Insect
脳など脂肪成分の多い試料から調製~40 mg 脂肪分の多い組織(脳、脂肪組織、脂肪の多い魚類)、試料に大きく依存、35分NucleoSpin DNA Lipid Tissue
微生物培養液から調製~40 mg 湿菌体、5~25 μg(30 mg 湿菌体の場合)、35分NucleoSpin Microbial DNA
土壌からの調製~500 mg 土壌、汚泥、堆積物、2~10 μg、90分NucleoSpin Soil
ウイルス
DNA調製
血清、血漿から調製シリカメンブレン、スピンカラム~200 μl 血清、血漿、無細胞体液、試料に大きく依存、50分NucleoSpin Virus
血清、血漿、血液から調製~200 μl 全血、血清、血漿、体液、試料に大きく依存、30分NucleoSpin Blood
DNA
Clean-up
PCR産物のクリーンアップ、アガロースゲルからの精製シリカメンブレン、スピンカラム~400 μl PCR反応液、~400 mg アガロースゲル、回収率 70~95%、10分NucleoSpin Gel and PCR Clean-up
~4 ml PCR反応液、~4 g アガロースゲル、回収率 70~95%、25分NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Midi
~10 ml PCR反応液、~10 g アガロースゲル、回収率 70~95%、30分NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Maxi
PCR産物のクリーンアップシリカビーズ20~400 μl PCR反応液、回収率 70~80%、45分NucleoTraPCR
アガロースゲルからの精製~200 mg アガロースゲル、回収率 50~90%、60分NucleoTrap
DNA断片精製、サイズ分画磁性ビーズ17.5 pg~5 μg DNAを含む溶液、回収率 80%以上NucleoMag NGS Clean-up and Size Select
Dye-terminator除去ゲルろ過、スピンカラム20 μl シーケンス反応液、5分NucleoSEQ
色素除去疎水性クロマトグラフィー50 mgまでのEtBr、SYBR Green Iを除去bondEX EtBr
ゲノムDNAのクリーンアップシリカメンブレン、スピンカラム~150 μl DNA水溶液(~25 μg DNA)、回収率 80~90%、15分NucleoSpin gDNA Clean-up
~400 μl DNA水溶液(~2 μg DNA)、回収率 60~70%、20分NucleoSpin gDNA Clean-up XS

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