TCR/BCRレパトア解析

定量性に優れた低バイアスなレパトア解析

特長

  • 低バイアスな遺伝子増幅法を用いた解析
  • ヒト・マウス・ラットの複数遺伝子のレパトア解析が可能
  • 検体ごとのクローン比較に加えて多様な情報解析が可能

■チラシをご覧ください。
TCR/BCRレパトア解析受託サービス

サービス内容

Total RNAから低バイアスな遺伝子増幅法を用いてTCR、BCR遺伝⼦を増幅し、次世代シーケンサーを⽤いて塩基配列を取得します。得られた塩基配列をもとに多様性（レパトア）の解析を⾏います。

【解析対象遺伝子】
生物種 解析対象遺伝子
ヒトTCR：α, β, γ, δ
BCR：IgM, IgG, IgA, IgD, IgE, IgL, IgK
マウスTCR：α, β
BCR：IgM, IgG, IgA, IgD, IgE, IgL, IgK
ラットBCR：IgG, IgL, IgK
※ラットはBCR解析のみ


■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。
TCR/BCRレパトア解析ウェブ会員限定技術資料

【オプション】
  • 血液（全血）からのPBMC分離
  • 細胞ソーティング
  • 細胞・組織からのRNA調製 データ解析
  • 各種二次解析：類似性解析、主成分解析、ヒートマップ、Circosプロット、ロゴプロット　など

価格・納期

ご依頼内容によって異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ（fastq）
  • 解析データ一式

【納品データ例】
レパトア解析結果2Dグラフ
レパトア解析結果2Dグラフ
レパトア解析結果3Dグラフ
レパトア解析結果3Dグラフ
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レパトア解析結果2Dグラフ
レパトア解析結果2Dグラフ
レパトア解析結果3Dグラフ
レパトア解析結果3Dグラフ
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■クラウド納品について
Boxによるクラウド納品を行います。共同研究者様とのデータの共有を簡単に行っていただけます。
※クラウド納品ご選択時の注意事項
  • シーケンスデータはサイズが大きいためダウンロードに時間を要する場合がございます。
    事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。
    推奨回線速度計測サイトはこちらから
  • 回線速度が110 Mbpsの場合：500 GByteのダウンロードに10時間、50 Mbpsの場合：23時間が目安です。
  • シーケンスデータサイズの目安は以下となります。
    レパトアシーケンス １遺伝子
    （シーケンスデータ量 20万～40万リード／検体）    		約0.2 GByte／検体
  • 150 GByteを超える大量のデータをダウンロードする際にはBox Drive（デスクトップ用アプリ）をインストールしてご利用ください。
  • ご依頼内容によっては対応が難しい場合がございます。その場合は、メディア納品（HDD等）への変更をご案内します。
  • 事前のテストをご希望の場合はご連絡ください。

ご注文方法

検体送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
依頼書記載の検体名称と、実際の送付検体に記載の名称は必ず一致させてください。
※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • 検体送付
    ・解析検体ならびに依頼書を下記検体送付先へご送付ください。
    ・検体は乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便でお送りください。

    • 受入検体

    以下の点にご注意の上、解析検体を調製してください。
    検体量 濃度 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    total RNA
    （PBMC／T細胞／B細胞由来）    		 500 ng以上 50 ng/μl以上 1.6以上
    total RNA
    （全血・組織由来）    		 5 μg以上 150 ng/μl以上 1.6以上
    組織 100 mg以上 ―
    血液 全血 3 ml以上 ―
    単離細胞検体
    （PBMC、培養細胞、ソート細胞）    		 1×106細胞以上 ―
    • 解析に用いる検体量によってクロノタイプの検出数が変わります。ご送付いただいた検体量にあわせて、解析に用いる検体量を調整いたします。
    • 末梢血、組織等にてご依頼の場合は、別途RNA抽出費用を申し受けます。
    • Total RNAでご送付いただく場合の純度に関して、RIN値情報をお持ちの場合はご提供ください。（RIN 7以上を推奨）
    • 組織は採取後速やかに－80℃で保存し、十分な量のドライアイスを同梱して弊社へご送付ください。
    • PBMC分離を希望する血液検体は、採血後48時間以内に弊社到着となるよう室温でご送付ください。
    • 単離細胞検体は、細胞凍結保存液を添加して凍結したものをご送付ください。


    ■検体送付容器について
    • RNA検体は1.5 mlチューブでご送付ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブでの提供はご遠慮ください。
      24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
      • プレートは弊社より提供可能（無償）です。ご希望の方はお問い合わせください。

    ＜推奨プレートおよびシール＞
    • Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates（Eppendorf社, No. EP-0030128.648）
    • タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）

    ご留意事項

    • ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わる検体は、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
      詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
    • お客様よりご提供いただいた検体・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

    関連製品・受託

    シングルセル解析
    SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
    RNA-Seq解析

    注意事項
    • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
    • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
    • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。