送付検体量、送付方法および納品物の詳細

品質検定の結果で弊社条件を満たさない場合、改めて検体の送付をお願いする場合があります。
※下記検体の核酸抽出をご希望の場合は事前に情報提供用紙を弊社へお送りください。弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。


次世代シーケンス（NGS）解析

○RNA解析関連

送付検体量の目安
  • total RNAなど
    以下の点にご注意の上、解析検体を調製してください。
    横にスクロールできます
    　　　　　　　　
    アプリケーション種類 生物種 RNA量 濃度（目安） 液量（目安） 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    mRNA対象
    SMART-Seq mRNA
    ＋Nextera XT DNA Library Prep Kit    		 － 50 ng以上1.7 ng/μl以上＊1
    100 ng/μl以下    		 30 μl以上 1.6以上
    total RNA対象
    SMART-Seq Stranded Kit    		 ヒト／マウス／ラット 50 ng以上 3 ng/μl以上 17 μl以上 1.6以上
    ＊1 短納期プランでは、自動分注機を使用し、プレート単位で作業を実施します。液量調整のため加水処理を実施することがあります。RNA量・濃度が基準に満たない場合は事前にご相談ください。

    • 電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。DNase処理を実施してください。
    • RNA検体はRNase free水に溶解してください。
    • RNA検体調製時にエタノール沈殿を実施する場合は、共沈剤としてグリコーゲンを添加しないでください。

    ■RNA検体送付手順

    ■検体送付容器について
    • 短納期プランでは、RNA検体を弊社指定の送付キット（無償）でご送付いただいております。送付キットは、オンライン注文時に併せてご依頼ください。
    • 短納期プラン以外の場合は、RNA検体は1.5 mlチューブでご送付ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブの場合は対応不可となります。9検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートでご送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

    ＜推奨プレートおよびシール＞
    • Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates（Eppendorf社, No. EP-0030128.648）
    • タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）

  • 細胞、各種組織、血液や原核生物、植物など
      検体量 送付形態
    細胞 ～105 cells または
    105～5×106 cells（目安）＊2    		凍結細胞ペレット／1.5 mlチューブ
    組織 ～5 mg または
    5～30 mg（目安）＊2    		凍結組織／1.5または2 mlチューブ
    ＊2 組織重量または細胞数によって使用する試薬が変わる場合がございますので、別途お問い合わせください。

    • 送付検体の採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。
    • サンプリングする部位によって解析結果が異なることを回避するため、組織の場合には目的の部位のみをお送りください。特定の部位の摘出はお受けできません。

    ＜細胞の場合＞
    細胞ペレットをPBSで洗浄して遠心分離により上清を完全に除去した後、直ちに細胞ペレットを液体窒素により瞬間凍結させて、－80℃で凍結保存してください。

    ＜組織の場合＞
    摘出した組織を直ちに液体窒素により瞬間凍結させて－80℃で凍結保存してください。液体窒素による瞬間凍結が困難な場合には、RNAlater試薬に浸漬してください。組織検体の10倍量のRNAlater試薬を添加します（組織 1 mgに対して約10 μl）。

    大きな組織片は、瞬間凍結やRNAlater試薬の浸透が不十分になり、保存時にRNAの分解が生じたり、その後の抽出作業が妨げられますので、添加前に0.5 cm以下の厚さの組織片に速やかにカットした後に瞬間凍結またはRNAlaterに浸漬してください。大きな組織片からの抽出はお受けできません。

納品物
  • 作業報告書
  • シーケンスデータ（Fastq）

オプション情報解析
  • 解析結果（Excel形式ファイル）
  • 遺伝子発現量解析（有償）の場合、マッピング結果（bam形式ファイル）

○調製済みライブラリー提供
（NovaSeqシーケンスのみ）

送付検体量の目安
  • 混合済みライブラリー
      濃度
    混合済みライブラリー 濃度：10 nM以上（30 μl 以上）
    • NovaSeqシーケンス　100 Gbaseまたは6.6億リード相当をご依頼の場合、最大16インデックスまで混合いただけます。
    • インサートサイズは300～500 bpを基準としており、極端に小さいもの、大きいものは対応できない場合があります。
    • NovaSeqシーケンス　300 Gbaseまたは20億リード相当以上をご依頼の場合はインデックス混合数の上限はございません。

    ■検体送付容器について
    • ライブラリーは1.5 mlチューブでご送付ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブの場合は短納期対応ができず、通常納期での対応となります。

納品物
  • 作業報告書
    シーケンスデータ（Fastq）



検体情報入力テンプレート

以下からご注文内容に応じた依頼書をダウンロードしてください。必要事項をご記入の上、オンライン注文にてファイルのアップロードをお願いします。

注意事項
  • 本ページの製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
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