相乗りシーケンス解析

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※ SMART-Seq解析キャンペーン実施中
※ 2020年6月1日より、相乗りシーケンスの仕様が変更となりました。
短納期シーケンス対応のライブラリー種類が変更となりました。DNA-Seq解析ではTruSeq Nano DNA Library Prep Kit、RNA-Seq解析(SMART-Seq解析)ではSMART-Seq v4 Ultra Low Input Kit + Nextera XT DNA Library Prep Kitを使用したライブラリー作製を行います。詳細はサービス内容をご覧ください。

※ 2019年12月2日より、遺伝子発現量の算出手法を変更いたしました(FPKM値⇒TPM値)。

特長

  • イルミナ社NovaSeq 6000を用いたハイスループットな塩基配列解析
  • ライブラリー受け入れ相乗りプランで自由度高い活用を
  • 最短2週間納品の短納期プラン
  • 国内設備と安心のセキュリティ体制

概要

次世代シーケンサーのデータ産生能力は年々増加しており、アプリケーションによってはオーバースペックになっています。タカラバイオでは、イルミナ社NovaSeq6000を用いたペアエンドシーケンス解析を複数のお客様でシェアしていただくことにより、最適なデータ量をお求めやすい価格でご提供いたします。

■チラシをご覧ください。

相乗りシーケンス(NGS)解析

遺伝子発現解析受託
遺伝子発現解析受託

サービス内容

NovaSeqのペアエンドシーケンスの解析単位である1レーン分を複数ユーザーでシェアしていただくサービスです。NovaSeq 6000を用いた150 base長ペアエンドシーケンスを実施いたします。使用するライブラリーキットや得られるデータ量の目安はアプリケーションによって異なります。以下の表をご参照ください。

●ライブラリー受け入れ相乗りシーケンス解析
サービス
内容
送付サンプルデータ量目安価格(税別)納期
ライブラリー受け入れ
相乗りシーケンス解析
混合済みライブラリー
(1~16インデックス混合可能)
濃度:10 nM 以上(20 μl 以上)
100 Gbase
または
6.6億リード
¥280,0002週間~
★短納期
混合済みライブラリー
(インデックスは自由にご利用ください。)
濃度:10 nM以上(30 μl以上)
600 Gbase
または
40億リード
¥957,0004週間~
★短納期
事前(検体送付日の約1週間前)にライブラリー情報(キット名、ライブラリー量、インサートサイズ、インデックス配列)および電気泳動図のご提供をお願いしています。インサートサイズは300~500 bpを基準としており、極端に小さいもの、大きいものは対応不可の場合がありますので、事前にご相談ください。
持ち込みライブラリーのため、データ量および品質保証はいたしかねます。
ライブラリーの種類によっては、カレンダースケジュールより数日納期が延びるものがございます。
  例)Chromiumシステムを使用するライブラリーキットなど

●DNA-Seq解析、全ゲノムシーケンス解析
短納期相乗りプラン: 6 Gbase/検体、納期最短 約2週間
微生物のゲノムドラフト解析やゲノムサイズが200 Mbase程度までの生物の変異解析に最適です。
TruSeq Nano DNA Library Prep Kitを用いてライブラリー作製を行います。PCRフリーライブラリーには対応しておりません。

短納期相乗りプラン: 90 Gbase/検体、納期最短 約4週間
ヒト、マウスなどの全ゲノムシーケンス、変異解析にご利用ください。PCRフリーライブラリーで実施いたします。

一定データ量相乗りプラン: 100 Gbase/一式、納期 約4~6週間
相乗り1件あたり100 Gbaseのデータ量を取得します。1件あたり最大16検体まで混合可能です。PCRフリーライブラリーで実施いたします。
下記以外の検体数の場合はお問合せください。

・シーケンス解析
サービス内容 ライブラリー 送付サンプル データ量 価格(税別) 納期
DNA-Seq解析
短納期プラン
TruSeq Nano DNA
Library Prep Kit
ゲノムDNA 600 ng 以上
(濃度 20 ng/μl以上)
6 Gbase
/検体
4検体まで:¥120,000/検体
5検体:¥85,000/検体
8検体:¥66,250/検体
16検体:¥50,625/検体
約2週間~
★短納期
全ゲノムシーケンス解析
短納期プラン
TruSeq DNA
PCR-Free Library
Prep Kit
ゲノムDNA 4 μg 以上
(濃度 80 ng/μl 以上)
90 Gbase
/検体
¥150,000/検体 約4週間~
DNA-Seq解析
一定データ量プラン
TruSeq DNA
PCR-Free Library
Prep Kit
ゲノムDNA 4 μg 以上
(濃度 80 ng/μl 以上)
100 Gbase
/一式
2検体 :¥310,000
4検体 :¥370,000
8検体 :¥490,000
16検体:¥730,000
約4~6週間

・情報解析【オプション】
下記以外の解析をご希望の場合はご相談ください。
サービス内容 情報解析 検体数/
データ量
参考価格 参考納期 備考
ヒト全ゲノム
シーケンス解析
変異解析 1検体/90 Gbase ¥115,000 +約10営業日 マッピング結果(bamファイル)と変異検出結果(vcfファイル)、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。

●ヒトエクソーム解析
多検体を低価格で解析可能な一定データ量相乗りプランを選択いただけます。1件あたり100 Gbase相当、最大16検体まで混合可能です。下記以外の検体数の場合はお問合せください。

・シーケンス解析
サービス内容 ライブラリー 送付サンプル データ量 価格(税別) 納期
ヒトエクソーム解析
一定データ量プラン
SureSelect
(Human All Exon V6)
ゲノムDNA
1 μg 以上
(濃度 20 ng/μl 以上)
100 Gbase 2検体:¥350,000
4検体:¥450,000
8検体:¥650,000
16検体:¥1,050,000
約6~8週間

・情報解析【オプション】
ヒトエクソーム変異解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
サービス内容 情報解析 検体数/データ量 参考価格 参考納期 備考
ヒトエクソーム解析 変異解析 16検体/100 Gbase ¥175,000 +約10営業日 ヒトエクソーム解析ご依頼の場合のオプション。
bamファイル、vcfファイル、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。

●SMART-Seq解析、RNA-Seq解析
※ SMART-Seq解析キャンペーン実施中
短納期相乗りプラン: 4000万リード/検体、納期最短 約2週間
SMART-Seq解析によるmRNAを対象とした納期重視のシーケンスになります。totalRNAが50 ng程度あれば対応可能です。
SMART-Seq v4 Ultra Low Input Kit + Nextera XT DNA Library Prep Kitを使用してライブラリー作製を行います。

一定データ量相乗りプラン: 6.6億リード/一式、納期 約6~8週間
相乗り1件あたり6.6億リードのデータ量を取得します。
mRNAを対象にしたTruSeq Stranded mRNA Library Prep Kitを用いたシーケンス、total RNAを対象にしたSMART-Seq Stranded Kitを用いたシーケンスが選択いただけます。1件あたり最大8-16検体まで混合可能です。下記以外の検体数の場合はお問合せください。

・シーケンス解析
サービス内容 ライブラリー 送付サンプル データ量 価格(税別) 納期
SMART-Seq解析
短納期プラン
◎mRNA対象
SMART-Seq v4+
Nextera XT DNA Library Prep Kit
total RNA 50 ng程度 4,000万リード
/検体
4検体まで:\120,000/検体
5検体:\85,000/検体
8検体:\66,250/検体
16検体:\50,625/検体
約2週間~
★短納期
RNA-Seq解析
一定データ量プラン
◎mRNA対象
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
total RNA 4 μg 以上
(濃度 200 ng/μl 以上)
6.6億リード 2検体:\310,000
4検体:¥370,000
8検体:¥490,000
16検体:¥730,000
約5~7週間
◎total RNA対象
SMART-Seq Stranded Kit
total RNA 50 ng 程度 2検体:¥314,000
4検体:¥378,000
8検体:¥506,000
約6~8週間

・情報解析【オプション】 ※2019年12月2日より、遺伝子発現量の算出手法を変更いたしました(FPKM値⇒TPM値)。
既知遺伝子発現解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
サービス内容 情報解析 検体数/
データ量
参考価格 参考納期 備考
SMART-Seq解析
短納期プラン
既知遺伝子
発現解析
4000万リード/検体 無償
(シーケンス解析に付属しています。)
追加納期は発生しません。 対象生物種: ヒト、マウス
その他の生物種はお問い合わせください。
RNA-Seq解析
一定データ量プラン
既知遺伝子
発現解析
16検体/6.6億リード ¥250,000 +10営業日 対象生物種:ヒト、マウス、ラット、イネ、シロイヌナズナのみ
シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。

【オプション解析】
  • 核酸抽出
    核酸抽出からご依頼の場合は、納期+2週間程度かかります。検体数、検体種類によっては納期が遅れる場合がございます。

  • WEB納品
    短納期プランのオプションメニューです。短納期プランご依頼で、情報解析のオプション無しの場合にご選択いただけます。通常価格より5,000円お値引させていただきます。
    ※ SMART-Seqキャンペーン(1~6検体ご依頼時)では、WEB納品をご選択いただいても、5,000円のお値引きはございませんのでご了承ください。
    注意事項をご確認の上、ご選択ください。

  • 情報解析
    オンライン注文にて、下記メニューを選択いただくことが可能です。

    ・既知遺伝子発現解析
    参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
    ・ゲノム変異解析
    参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
    ・ヒトエクソーム変異解析
    参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。

  • クラウド解析サービス VariantFilter
    サーバ上にアップロードした変異解析結果より、お客様自身で変異絞り込みや比較解析を簡単に行っていただけます。変異解析とあわせた「変異解析パッケージ」をご選択ください。
    目的遺伝子、既知SNP、変異クオリティ、人種別アレル頻度、疾患影響度、変異影響度などを使用した変異絞り込み、疾患群とコントロール群を指定し、疾患群特異的な変異の絞り込み等が可能です。
    クラウド解析は事前のWEB会員登録が必要です。納品後6ヵ月間ご利用いただけます。

【相乗り:短納期プランについて】
※2020年6月1日より、相乗り:短納期プランの仕様が変更となりました。
短納期プラン対応ライブラリー種類が変更となります。DNA-Seq解析では、TruSeq Nano DNALibrary Prep Kit、RNA-Seq解析・SMART-Seq解析では、SMART-seq v4+Nextera DNA Sample Prep Kitが対象となります。
※ 2020年6月1日分からカレンダー納期も変更となっておりますので、ご確認の上、ご依頼をお願いいたします。オンライン注文の受付締切時間も変更となっておりますのでご注意をお願いいたします。

・オンライン注文限定のサービスです。一度に最大16検体をご依頼いただけます。全ゲノムシーケンス解析は一度に最大6検体までのご依頼となります。
・カレンダーをご確認の上、オンライン注文にてご依頼ください。オンライン注文はこちら
オンライン注文入力期限は、サンプル到着期限日◆の前営業日12時です。カレンダーのサンプル到着期限日◆の前営業日12時までにオンライン注文を完了してください。12時以降の注文の場合は、期限内にサンプルが到着しても次のランスケジュールでの解析とさせていただきます。
・カレンダーの◆印のサンプル到着期限日の午前中まで必着でサンプルをお送りください(サンプルの受入は平日のみです)。
・サンプル到着期限日◆より、約10営業日で納品物を弊社より発送します。
・オプションの情報解析もあわせてご依頼の場合は、カレンダー発送予定日より+10営業日程度お時間をいただきます。
・ライブラリー受け入れ相乗りプランでは、ライブラリーの種類による、カレンダースケジュールより数日納期が延びるものがございます。
 例)Chromiumシステムを使用するライブラリーキットなど

短納期カレンダー2020年8月

短納期カレンダー2020年9月

短納期カレンダー2020年10月

短納期カレンダー2020年11月

短納期カレンダー2020年12月

◆ … サンプル到着期限日(この日の午前中まで必着で送付してください。)
● … データ発送予定日

<短納期プラン 注意事項>
・サンプル受領後、弊社にて品質検定を実施しますが、品質結果の途中報告は行いません。
送付サンプルの品質基準に満たなくても、作業は進めさせていただきます。
オンライン注文完了がサンプル到着期限日◆の前営業日12時以降となった場合や、サンプル到着期限日◆の午前中までにサンプルが届かなかった場合は、次のランスケジュールでの実施となります。
(例: 9月4日着 ⇒ 9月8日到着期限日のランスケジュールで実施し、9月24日の発送予定となります。)
・核酸抽出からご依頼の場合は、核酸抽出作業が終了後、直近のランスケジュールにて対応します。
・サンプル到着順に作業を行います。ご依頼検体数の総数が多い時は納期が延びる場合もございます。
・シーケンス不良で再シーケンスとなった場合は、納期が延びる可能性がございます。
・各作業工程における弊社判断基準を下回る場合には、カレンダー記載の納期を達成できない、または解析中止となる可能性がございます。
・解析中止となりました場合には、それまでの作業代金を申し受けております。
・納品予定カレンダーは、その他受託状況により変更することがございます。

価格・納期

・価格: 注文方法、メニューにより価格が異なります。サービス内容をご参照ください。
・納期: 短納期プラン: カレンダー参照(最短約2週間~)
一定データ量プラン: 約4~8週間 *サービス内容をご参照ください。
※ オプション作業の納期は含まれておりません。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式(fastq形式ファイル)

オプション情報解析
  • マッピング結果(bam形式ファイル)
  • 解析結果(Excel形式ファイル)
    など
    ※ SMART-Seqキャンペーン、生物種:ヒト、マウスをご依頼の場合の情報解析では、マッピング結果(bam形式ファイル)は納品物に含まれません。ご希望の場合は別途ご相談ください。

・クラウド解析サービスをご利用の場合は、変異解析結果をクラウド上にアップロードし、納品時にクラウドURLをご連絡いたします。クラウド解析サービスは納品後6ヵ月間ご利用いただけます。
※ クラウドご利用には、事前にWEB会員登録が必要です。

■クラウド解析サービスご利用環境について
クラウド解析サービスは、Google Chromeの使用を推奨いたします。 Google Chrome 70.0.3538.77のバージョンで動作確認をしております。それ以外のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。

※ WEB納品ご選択時の注意事項
・WEB納品システムの対応ブラウザは、Google Chromeです。
・各ファイルのダウンロードは1回のみです。
・シーケンスデータはサイズが大きいため時間を要する場合がございます。
 事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。
 ・推奨回線速度計測サイト: https://www.musen-lan.com/speed/speed-img.html
 ・測定結果が20Mbpsの場合:20分/サンプル、50Mbpsの場合:10分/サンプルが目安です。
 ・複数サンプルのご依頼の場合はこの数倍の時間を要しますのでご注意ください。
 ・シーケンスデータはエクソソームシーケンスやRNA-Seqでは5GB/サンプル
  全ゲノムシーケンスでは数十GB/サンプルが目安です。

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。
相乗り:短納期プランをご利用の場合は、必ずオンライン注文からご注文ください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
    「オンラインのご注文方法について」
    ※オンライン注文ページは Internet Explorer11.0のバージョンのブラウザで動作確認をしております。それ以前のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。 また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で、解析依頼書をダウンロードいただきますと、登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・送付サンプルがRNAの場合には、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便で、送付サンプルがDNAの場合には-20℃の状態の冷凍便でお送りください。

受入サンプル

各種アプリケーションによって異なりますので、お問い合わせください。
ライブラリーでの受入も可能です。

ご留意事項

  • 本解析は複数ユーザー様のサンプルを混合してシーケンスいたします。混合データからタグ配列をもとに分類し、各サンプルデータを作成いたしますが、それぞれに別データが混入する可能性を否定することはできません。ご了承ください。
  • ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
    詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
  • お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
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