NovaSeqのペアエンドシーケンスの解析単位である1レーン分を複数ユーザーでシェアしていただくサービスです。NovaSeq 6000を用いた150 base長ペアエンドシーケンスを実施いたします。使用するライブラリーキットや得られるデータ量の目安はアプリケーションによって異なります。以下の表をご参照ください。
●ライブラリー受け入れ相乗りシーケンス解析
サービス 内容 | 送付サンプル | データ量目安 | 価格(税別) | 納期 |
ライブラリー受け入れ 相乗りシーケンス解析 | 混合済みライブラリー (1~16インデックス混合可能) 濃度:10 nM 以上(20 μl 以上) | 100 Gbase または 6.6億リード | ¥280,000 | 2週間~ ★短納期 |
混合済みライブラリー (インデックスは自由にご利用ください。) 濃度:10 nM以上(30 μl以上) | 600 Gbase または 40億リード | ¥957,000 | 4週間~ ★短納期 |
※事前(検体送付日の約1週間前)にライブラリー情報(キット名、ライブラリー量、インサートサイズ、インデックス配列)および電気泳動図のご提供をお願いしています。インサートサイズは300~500 bpを基準としており、極端に小さいもの、大きいものは対応不可の場合がありますので、事前にご相談ください。
※持ち込みライブラリーのため、データ量および品質保証はいたしかねます。
※ライブラリーの種類によっては、カレンダースケジュールより数日納期が延びるものがございます。
例)Chromiumシステムを使用するライブラリーキットなど
●DNA-Seq解析、全ゲノムシーケンス解析
短納期相乗りプラン: 6 Gbase/検体、納期最短 約2週間
微生物のゲノムドラフト解析やゲノムサイズが200 Mbase程度までの生物の変異解析に最適です。
※TruSeq Nano DNA Library Prep Kitを用いてライブラリー作製を行います。PCRフリーライブラリーには対応しておりません。
短納期相乗りプラン: 90 Gbase/検体、納期最短 約4週間
ヒト、マウスなどの全ゲノムシーケンス、変異解析にご利用ください。PCRフリーライブラリーで実施いたします。
一定データ量相乗りプラン: 100 Gbase/一式、納期 約4~6週間
相乗り1件あたり100 Gbaseのデータ量を取得します。1件あたり最大16検体まで混合可能です。PCRフリーライブラリーで実施いたします。
下記以外の検体数の場合はお問合せください。
・シーケンス解析
サービス内容 |
ライブラリー |
送付サンプル |
データ量 |
価格(税別) |
納期 |
DNA-Seq解析 短納期プラン |
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit |
ゲノムDNA 600 ng 以上 (濃度 20 ng/μl以上) |
6 Gbase /検体 |
4検体まで:¥120,000/検体
5検体:¥85,000/検体
8検体:¥66,250/検体
16検体:¥50,625/検体 |
約2週間~ ★短納期 |
全ゲノムシーケンス解析 短納期プラン |
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit |
ゲノムDNA 4 μg 以上 (濃度 80 ng/μl 以上) |
90 Gbase /検体 |
¥150,000/検体 |
約4週間~ |
DNA-Seq解析 一定データ量プラン |
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit |
ゲノムDNA 4 μg 以上 (濃度 80 ng/μl 以上) |
100 Gbase /一式 |
2検体 :¥310,000
4検体 :¥370,000
8検体 :¥490,000
16検体:¥730,000 |
約4~6週間 |
・情報解析【オプション】
下記以外の解析をご希望の場合はご相談ください。
サービス内容 |
情報解析 |
検体数/ データ量 |
参考価格 |
参考納期 |
備考 |
ヒト全ゲノム シーケンス解析 |
変異解析 |
1検体/90 Gbase |
¥115,000 |
+約10営業日 |
マッピング結果(bamファイル)と変異検出結果(vcfファイル)、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品 |
※シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
※データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
●ヒトエクソーム解析
多検体を低価格で解析可能な一定データ量相乗りプランを選択いただけます。1件あたり100 Gbase相当、最大16検体まで混合可能です。下記以外の検体数の場合はお問合せください。
・シーケンス解析
サービス内容 |
ライブラリー |
送付サンプル |
データ量 |
価格(税別) |
納期 |
ヒトエクソーム解析 一定データ量プラン |
SureSelect (Human All Exon V6) |
ゲノムDNA 1 μg 以上 (濃度 20 ng/μl 以上) |
100 Gbase |
2検体:¥350,000
4検体:¥450,000
8検体:¥650,000
16検体:¥1,050,000 |
約6~8週間 |
・情報解析【オプション】
ヒトエクソーム変異解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
サービス内容 |
情報解析 |
検体数/データ量 |
参考価格 |
参考納期 |
備考 |
ヒトエクソーム解析 |
変異解析 |
16検体/100 Gbase |
¥175,000 |
+約10営業日 |
ヒトエクソーム解析ご依頼の場合のオプション。 bamファイル、vcfファイル、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品 |
※シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
※データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
●SMART-Seq解析、RNA-Seq解析
短納期相乗りプラン: 4000万リード/検体、納期最短 約2週間
SMART-Seq解析によるmRNAを対象とした納期重視のシーケンスになります。totalRNAが50 ng程度あれば対応可能です。
※SMART-Seq v4 Ultra Low Input Kit + Nextera XT DNA Library Prep Kitを使用してライブラリー作製を行います。
一定データ量相乗りプラン: 6.6億リード/一式、納期 約6~8週間
相乗り1件あたり6.6億リードのデータ量を取得します。
mRNAを対象にしたTruSeq Stranded mRNA Library Prep Kitを用いたシーケンス、total RNAを対象にしたSMART-Seq Stranded Kitを用いたシーケンスが選択いただけます。1件あたり最大8-16検体まで混合可能です。下記以外の検体数の場合はお問合せください。
・シーケンス解析
サービス内容 |
ライブラリー |
送付サンプル |
データ量 |
価格(税別) |
納期 |
SMART-Seq解析 短納期プラン |
◎mRNA対象
SMART-Seq v4+ Nextera XT DNA Library Prep Kit |
total RNA 50 ng程度 |
4,000万リード /検体 |
4検体まで:\120,000/検体
5検体:\85,000/検体
8検体:\66,250/検体
16検体:\50,625/検体 |
約2週間~ ★短納期 |
RNA-Seq解析 一定データ量プラン |
◎mRNA対象 TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit |
total RNA 4 μg 以上 (濃度 200 ng/μl 以上) |
6.6億リード |
2検体:\310,000
4検体:¥370,000
8検体:¥490,000
16検体:¥730,000 |
約5~7週間 |
◎total RNA対象 SMART-Seq Stranded Kit |
total RNA 50 ng 程度 |
2検体:¥314,000
4検体:¥378,000
8検体:¥506,000 |
約6~8週間 |
・情報解析【オプション】
※2019年12月2日より、遺伝子発現量の算出手法を変更いたしました(FPKM値⇒TPM値)。
既知遺伝子発現解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
サービス内容 |
情報解析 |
検体数/ データ量 |
参考価格 |
参考納期 |
備考 |
SMART-Seq解析 短納期プラン |
既知遺伝子 発現解析 |
4000万リード/検体 |
無償 (シーケンス解析に付属しています。) |
追加納期は発生しません。 |
対象生物種: ヒト、マウス その他の生物種はお問い合わせください。 |
RNA-Seq解析 一定データ量プラン |
既知遺伝子 発現解析 |
16検体/6.6億リード |
¥250,000 |
+10営業日 |
対象生物種:ヒト、マウス、ラット、イネ、シロイヌナズナのみ
|
※シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
※データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
【オプション解析】
- 核酸抽出
核酸抽出からご依頼の場合は、納期+2週間程度かかります。検体数、検体種類によっては納期が遅れる場合がございます。
- WEB納品
短納期プランのオプションメニューです。短納期プランご依頼で、情報解析のオプション無しの場合にご選択いただけます。通常価格より5,000円お値引させていただきます。
注意事項をご確認の上、ご選択ください。
- 情報解析
オンライン注文にて、下記メニューを選択いただくことが可能です。
・既知遺伝子発現解析参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
・ゲノム変異解析参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
・ヒトエクソーム変異解析参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
- クラウド解析サービス VariantFilter
サーバ上にアップロードした変異解析結果より、お客様自身で変異絞り込みや比較解析を簡単に行っていただけます。変異解析とあわせた「変異解析パッケージ」をご選択ください。
目的遺伝子、既知SNP、変異クオリティ、人種別アレル頻度、疾患影響度、変異影響度などを使用した変異絞り込み、疾患群とコントロール群を指定し、疾患群特異的な変異の絞り込み等が可能です。
クラウド解析は事前のWEB会員登録が必要です。納品後6ヵ月間ご利用いただけます。
【相乗り:短納期プランについて】
※2020年6月1日より、相乗り:短納期プランの仕様が変更となりました。
短納期プラン対応ライブラリー種類が変更となります。DNA-Seq解析では、TruSeq Nano DNALibrary Prep Kit、RNA-Seq解析・SMART-Seq解析では、SMART-seq v4+Nextera DNA Sample Prep Kitが対象となります。
※ 2020年6月1日分からカレンダー納期も変更となっておりますので、ご確認の上、ご依頼をお願いいたします。オンライン注文の受付締切時間も変更となっておりますのでご注意をお願いいたします。
・オンライン注文限定のサービスです。一度に最大16検体をご依頼いただけます。全ゲノムシーケンス解析は一度に最大6検体までのご依頼となります。
・カレンダーをご確認の上、オンライン注文にてご依頼ください。
オンライン注文はこちら
オンライン注文入力期限は、サンプル到着期限日◆の前営業日12時です。カレンダーのサンプル到着期限日◆の前営業日12時までにオンライン注文を完了してください。12時以降の注文の場合は、期限内にサンプルが到着しても次のランスケジュールでの解析とさせていただきます。
・カレンダーの◆印のサンプル到着期限日の午前中まで必着でサンプルをお送りください(サンプルの受入は平日のみです)。
・サンプル到着期限日◆より、約10営業日で納品物を弊社より発送します。
※混み合っているため、11月12月は通常より納期をいただいております。
・オプションの情報解析もあわせてご依頼の場合は、カレンダー発送予定日より+10営業日程度お時間をいただきます。
・ライブラリー受け入れ相乗りプランでは、ライブラリーの種類による、カレンダースケジュールより数日納期が延びるものがございます。
例)Chromiumシステムを使用するライブラリーキットなど
◆ … サンプル到着期限日(この日の午前中まで必着で送付してください。)
● … データ発送予定日
<短納期プラン 注意事項>
・サンプル受領後、弊社にて品質検定を実施しますが、品質結果の途中報告は行いません。
送付サンプルの品質基準に満たなくても、作業は進めさせていただきます。
・
オンライン注文完了がサンプル到着期限日◆の前営業日12時以降となった場合や、サンプル到着期限日◆の午前中までにサンプルが届かなかった場合は、次のランスケジュールでの実施となります。
(例: 12月4日着 ⇒ 12月8日到着期限日のランスケジュールで実施し、12月23日の発送予定となります。)
・核酸抽出からご依頼の場合は、核酸抽出作業が終了後、直近のランスケジュールにて対応します。
・サンプル到着順に作業を行います。ご依頼検体数の総数が多い時は納期が延びる場合もございます。
・シーケンス不良で再シーケンスとなった場合は、納期が延びる可能性がございます。
・各作業工程における弊社判断基準を下回る場合には、カレンダー記載の納期を達成できない、または解析中止となる可能性がございます。
・解析中止となりました場合には、それまでの作業代金を申し受けております。
・納品予定カレンダーは、その他受託状況により変更することがございます。
- 作業報告書
- シーケンスデータ一式(fastq形式ファイル)
オプション情報解析
- マッピング結果(bam形式ファイル)
- 解析結果(Excel形式ファイル)
など
※生物種:ヒト、マウスをご依頼の場合の情報解析では、マッピング結果(bam形式ファイル)は納品物に含まれません。ご希望の場合は別途ご相談ください。
・クラウド解析サービスをご利用の場合は、変異解析結果をクラウド上にアップロードし、納品時にクラウドURLをご連絡いたします。クラウド解析サービスは納品後6ヵ月間ご利用いただけます。
※ クラウドご利用には、事前に
WEB会員登録が必要です。
■クラウド解析サービスご利用環境について
クラウド解析サービスは、Google Chromeの使用を推奨いたします。 Google Chrome 70.0.3538.77のバージョンで動作確認をしております。それ以外のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。
※ WEB納品ご選択時の注意事項
・WEB納品システムの対応ブラウザは、Google Chromeです。
・各ファイルのダウンロードは1回のみです。
・シーケンスデータはサイズが大きいため時間を要する場合がございます。
事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。