DNAメチル化解析(NGS)

次世代シーケンサーを用いたメチル化シトシンシーケンス

特長

  • 次世代シーケンサーを用いて、全ゲノムを対象に網羅的にシトシン単位のメチル化率を算出(全ゲノムメチル化シーケンス解析)
  • CpG領域のメチル化をターゲットにしたReduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)解析も実施可能

サービス内容

次世代シーケンサーを用いて全ゲノムをシーケンスし、網羅的にメチル化解析を実施します。
CpGサイトをターゲットとし、コストを抑えて解析可能なRRBS解析も対応しています。

■解析手法の特徴
  全ゲノムメチル化シーケンス解析 RRBS解析(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)
特徴
  • ✔ 全ゲノムにおいてシトシンサイトのメチル化率を1塩基レベルで定量解析。高い網羅性。
  • ✔ CpG以外のCHGやCHHサイトも解析可能
  • ✔ ゲノムワイドに1塩基レベルでメチル化率を算出
  • ✔ CpGサイト近傍を制限酵素で切断し、バイサルファイト処理後、その切り口をシーケンス解析
  • ✔ ヒトの場合で400万ヵ所以上、マウスで200~400万ヵ所程度のCpGサイトのメチル化率を定量解析
網羅性
コスト 高い 低い
※全ゲノムメチル化シーケンス解析の情報解析作業はRhelixa社で実施します。
※RRBS解析はActive Motif社で実施します。

■サービス詳細は技術資料をご覧ください(閲覧にはWEB会員ログインが必要です)。
DNAメチル化解析ウェブ会員限定資料


オプション サンプル調製

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

お見積りについてはこちらよりご依頼ください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • マッピング結果一式
  • メチル化解析結果一式

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。
※RRBS解析をご依頼の場合は、別途必要書類およびサンプル送付先をご案内いたします。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
     また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着�

受入サンプル

  • 参照配列情報
  • ゲノムDNA
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
横にスクロールできます
  解析方法 DNA量 濃度 純度
OD260/OD280 OD260/OD230
ゲノムDNA 全ゲノムメチル化シーケンス解析 600 ng以上 10 ng/μl以上 1.6以上
RRBS解析 100 ng以上 10 ng/μl以上
組織・細胞(オプション)お問い合わせください。
  • 上記基準はヒトゲノムを解析する場合の値です。ゲノムサイズにより必要量が異なりますので別途お問い合わせください。
  • DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
  • 電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。

■サンプル送付容器について
・ゲノムDNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。0.2 ml、0.5 ml、8連チューブでのご提供はご遠慮ください。
 24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

<推奨プレートおよびシール>
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・タイタースティックHCフィルム(WATSON社, No. 547-KTS-HC)

※RRBS解析をご依頼の場合は、別途サンプル送付先をご案内いたします。

ご留意事項

  • ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
    詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。
  • お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。