疾患ゲノム変異アノテーション

ゲノム変異データからの疾患変異絞り込みと病原性判定

特長

  • MH Guide/Mendel(Molecular Health社)ソフトウェアを用いた変異アノテーションサービス
  • キュレーションされた複数のデータベースを用いて、膨大なゲノム変異データから遺伝性疾患変異を絞り込み、ACMGガイドラインに基づいて病原性を判定
  • 取得済みシーケンスデータ(Fastqファイル)からのご依頼も可能

サービス内容

ヒト全ゲノムシーケンス解析またはヒトエクソーム解析データより得られた変異検出結果(vcfファイル)をMH Guide/Mendelへアップロードします。MH Guide/Mendelでは、ACMGガイドライン、MH Consensusに基づいた遺伝性疾患変異の絞り込み、病原性判定のレポート出力が可能です。
マニュアル操作での変異絞り込みも可能です。

米国臨床遺伝・ゲノム学会(American College of Medical Genetics and Genomics:ACMG)と分子病理学会(Association for Molecular Pathology:AMP)がまとめた世界標準の臨床遺伝子診断ガイドライン。個々の変異に対して、病的(pathogenic)変異か良性(benign)変異かの判断基準やその重要性の基準が定められています。

■チラシをご覧ください。
疾患ゲノム変異アノテーション


■MH Guide/Mendel資料

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。
※検体数、検体情報、送付データ形式、解析内容のご希望などをご連絡ください。
シーケンスからのご依頼も可能です。

お見積りについてはこちらよりご依頼ください。

納品物

  • 作業報告書
  • アカウント納品の場合
    ・ご自身でレポート作成可能なMH Guide/Mendelのアカウント(利用可能期間:60日間)
     MH Guide/Mendelにアップロードされたデータの閲覧、変異絞り込み、レポート出力などが可能
    ・MH Guide/Mendel操作手順書動画
  • レポート納品の場合
    ・MH Guide/Mendelにて解析後、病変性変異(Pathogenic)のみを対象に作成したレポートPDF

ご注文方法

※お見積りをご用意いたしますので、事前にお問い合わせください。

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
     また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・検体送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載の検体名称と、実際の送付検体に記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • 検体送付
    ・VCFファイルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記検体送付先へご送付ください。
    ・VCFファイルはハードディスク等に保存した状態で破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。

受入検体

VCFファイル
CRCh37またはCRCh38を参照配列としたVCF v4.2以上のファイル
*シーケンスまたはシーケンスデータ(fastqファイル)からのご依頼も可能ですので、ご相談ください。
*パネル解析データの解析をご希望の場合は事前にご相談ください。

ご留意事項

・ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わる検体は、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。

・【MH Guide/Mendelソフトウェアライセンスについて】
MH Guide/Mendelソフトウェアのご利用にあたり、Molecular Health社からの使用制限および免責事項等に関する同意が必要です。ご利用前に、弊社より本ライセンスについてご相談させていただきます。

・お客様よりご提供いただいた検体・情報および納品物の複製は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。