ゲノム変異解析

微生物変異株解析、高等生物のSNPやゲノム構造変化の解析

特長

  • 次世代シーケンサーによる網羅的ゲノム変異解析
  • 参照配列に対する変異箇所(置換、欠失、挿入など)を迅速に検出
  • 検出した変異のアノテーション情報の付加もサポート

サービス内容

NovaSeq/MiSeqによる次世代シーケンス(NGS)解析では、微生物から高等生物レベルのゲノムDNA変異候補領域を効率良く取得できます。
ゲノムDNAを提供いただき、ペアエンド解析を行います。参照配列にマッピングして変異箇所(置換、欠失、挿入など)の解析を行いリスト化します。

ヒト全ゲノムシーケンス解析についてはこちらをご覧ください。

■サービス詳細は技術資料をご覧ください(閲覧にはWEB会員ログインが必要です)。
ゲノム変異解析ウェブ会員限定技術資料


オプション サンプル調製



オプション 情報解析(バイオインフォマティクス)

  • 変異解析(マッピング・変異検出・変異アノテーション)
    参照配列に対し、シーケンスにより得られたリード配列をマッピングし、一塩基置換や短い挿入欠失部位を検出します。遺伝子情報が存在する生物種の場合は、検出した変異と遺伝子の位置関係、変異による影響(アミノ酸置換など)についてアノテーションを付加することも可能です。

価格・納期

【シーケンス解析】 ※作製済みライブラリー提供シーケンスのみのご依頼をご希望の場合はこちら
サービス内容 ライブラリー データ量 参考価格 納期
DNA-Seq解析
短納期プラン
ThruPLEX DNA-Seq Kit 6 Gbase/検体 5検体 :¥72,000/検体
8検体 :¥53,250/検体
16検体:¥37,625/検体
約4~6週間
★短納期
DNA-Seq解析
一定データ量プラン
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit 100 Gbase/一式 2検体 :¥158,000/検体
4検体 :¥95,500/検体
8検体 :¥64,250/検体
16検体:¥48,625/検体
約4~6週間
※シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
※データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。

<短納期プランについて>
・オンライン注文限定のサービスです。一度に最大16検体をご依頼いただけます。オンライン注文はこちら
・弊社にて品質検定を実施しますが、品質結果の途中報告は行いません。送付サンプルの品質基準に満たなくても、作業は進めさせていただきます。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 変異候補の抽出結果、マッピング結果等

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
     また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。
    • 次世代シーケンス(NGS)解析依頼書(Excel)
    • 解析生物に関する情報提供用紙(Excel)
      ※細菌、真菌、ウイルス、原虫及び寄生虫を送付いただく場合は、受託サービスをお申込みいただく前に、「解析生物に関する情報提供用紙」にご記入の上、弊社へお送りください。 弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。弊社ではバイオセーフティーレベル3以上の生物および安全性が確認できない検体については受け入れできません。ご了承ください。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・サンプルは凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し、冷凍便でご送付ください。

受入サンプル

  • 参照配列情報
  • ゲノムDNA

以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
横にスクロールできます

ライブラリー DNA量 濃度 液量 純度
OD260/OD280 OD260/OD230
ゲノムDNA ThruPLEX DNA-Seq Kit 200 ng以上 40 ng/μl以上 40 μl以上 1.6以上
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit 4 μg以上 80 ng/μl以上 50 μl以上 1.6以上
  • DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
  • 電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。
  • 上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。


■サンプル送付容器について
・ゲノムDNAサンプルは、1.5 mlチューブでご提供ください。0.2 ml、0.5 ml、8連チューブでのご提供はご遠慮ください。
24検体以上の場合は96 well plateでご提供ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

<推奨プレートおよびシール>
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・WATSON タイタースティック HCフィルム(547-KTS-HC)

ご留意事項

供与核酸の品質によっては、再提供をお願いすることがあります。
ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。