体細胞変異解析

探索的にがんゲノム変異を網羅的かつ高感度に検出!

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特長

  • 検体にわずかに存在するゲノム変異を高精度に検出
  • 正常組織・腫瘍組織の組み合わせで偽陽性を少なくゲノム変異を検出(Matched-Pair解析)
  • 腫瘍組織のみでもゲノム変異を高感度に検出
  • 探索目的でcfDNAの変異を網羅的に解析することも可能

概要

腫瘍組織に含まれるヘテロな細胞集団のゲノム変異を高精度に検出します。探索的にこれらヘテロに存在する細胞集団の中から高精度に細胞集団の変異情報を取得(体細胞変異解析)する手法としては、エクソーム解析が広く用いられています。また、偽陽性の影響を少なくするためには、細胞集団に存在する生殖細胞変異と体細胞変異を区別する組織由来の情報を取得する必要がありましたが、それらに対応できないcfDNAをターゲットとする網羅的な変異解析も可能になりました。

サービス内容

体細胞ゲノム変異を検出するには全ゲノムシーケンスまたはエクソームシーケンスデータ(fastqファイルまたはbamファイル)が必要となります。それぞれのシーケンスデータを参照ゲノム配列にマッピングし、結果を比較することによって、腫瘍組織特異的に存在する変異を高感度に検出します。

(解析の流れ)
体細胞変異解析とドライバー遺伝子解析


※ 腫瘍組織のシーケンスデータ量は、目的に応じて異なります。腫瘍組織においては平均冗長度×200以上、cfDNAでは×3,000以上をお薦めします。
エクソーム解析 参考取得データ量

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • 変異候補の抽出結果、マッピング結果等
    ・マッピング結果(bam形式)
    ・体細胞変異結果(xlsx形式)

    (納品物例)
    納品物例

    納品物例

ご注文方法

※お見積りをご用意いたしますので、事前にお問い合わせください。
生物種、サンプル情報、送付データ形式、解析内容のご希望などをご連絡ください。


オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
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  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・シーケンスデータならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・シーケンスデータはハードディスク等に保存した状態で破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。

受入サンプル

  • シーケンスデータ
    ヒト全ゲノムシーケンス解析やエクソーム解析で得られたシーケンスデータ(fastqファイル)またはマッピングデータ(bamファイル)

ご留意事項

ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
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